Последствия лечения антибиотиками: Побочные эффекты антибиотиков — Статьи медицинского центра «Реновацио

Содержание

5 побочных эффектов антибиотиков, о которых вы не знали

 

Несмотря на высокую эффективность в лечении многих заболеваний, ранее считавшихся неизлечимыми, область применения антибиотиков ограничена строгими показаниями, а их прием может сопровождаться рядом побочных реакций, которые могут проявиться в процессе лечения. И об этом необходимо помнить всем, кто приступает к терапии с применением антибактериальных препаратов.

Чаще всего антибактериальные препараты приводят к тошноте и расстройству работы желудочно-кишечного тракта. Но на самом деле побочных эффектов от этих препаратов может быть гораздо больше. И периодически ученые дополняют список нежелательных реакций, которые могут возникнуть при приеме антибиотиков.

Лихорадка

Бывает, мы самостоятельно принимаем решение начать прием антибиотиков для борьбы с заболеваниями, которые привели к повышению температуры тела. При этом мы надеемся на то, что температура снизится. Но может получиться наоборот. Выяснилось, что антибактериальные препараты, в определенном проценте случаев могут стать причиной лихорадки или усилить ее. 1 Это один из их побочных эффектов, который наблюдается у ряда антибиотиков, в том числе у тех, которые применяют для лечения осложнений ОРВИ.

При повышении температуры тела после приема антибиотиков либо при усилении ранее начавшейся лихорадки, необходимо прекратить прием препарата и обратиться за помощью к врачу. Не стоит ждать, когда жар станет слишком сильным. Отсутствие положительной динамики может свидетельствовать о неэффективности данного препарата, что требует врачебного решения и коррекции терапии. Высокая температура тела негативно влияет на обмен веществ, что может привести к нарушению водно-солевого баланса, когда страдают нервная, сердечно-сосудистая и мочевыделительная системы. 2

Подобные состояния опасны для жизни, поэтому перед лечением необходимо принять взвешенное решение и начинать лечение антибиотиками только при наличии веских оснований и после консультации врача.

Грибковые заболевания

Антибиотики могут привести к дисбактериозу и способствовать развитию грибковой инфекции. 3 Получается, можно лечить одно заболевание, а в «нагрузку» получить другое.

Грибки могут поразить слизистые оболочки желудочно-кишечного тракта, а также кожу и мочеполовую систему. Если же грибковое заболевание генерализованное, то есть распространившееся по организму, то существует риск поражения внутренних органов.

4

При развившемся грибковом заболевании часто присоединяются другие инфекции, которые могут привести к резкому снижению иммунитета, язвам, даже облысению и другим неприятным и опасным последствиям. Чтобы избежать подобных осложнений, врачи иногда назначают прием антибиотиков вместе с противогрибковыми препаратами, что увеличивает нагрузку на организм.

Аллергия

Конечно же, один из самых распространенных побочных эффектов антибиотиков – это аллергия. 5 В этом случае на коже могут появиться зудящая сыпь и отеки. При тяжелых формах становятся опухшими веки, губы и язык, наблюдаются затруднения при глотании и разговоре, появляется резкая слабость, ощущается тяжесть за грудиной и одышка даже в состоянии покоя. Так проявляется анафилактический шок – острое патологическое состояние, которое опасно для жизни. В случае стремительного развития симптомов аллергии необходима скорая врачебная помощь и проведение реанимационных мероприятий.

Необходимо учитывать и тот факт, что антибиотики могут попадать к нам в организм вместе с некоторыми продуктами питания – например, в мясе могут содержаться пенициллины. А это значит, что практически у каждого человека наблюдается риск развития аллергии при приеме антибактериальных препаратов.

6 Это еще раз указывает на необходимость врачебного контроля при приеме антибиотиков.

Головокружение

Часть антибактериальных препаратов отличаются вестибулотоксичностью, то есть они могут привести к головокружению. Также может наблюдаться дизэквилибрация – неустойчивость и раскоординированность движений. 7

Обо всех подобных симптомах необходимо сразу же сообщить своему лечащему врачу, он подберет для вас другой препарат.

Беременность

Неожиданный побочный эффект антибиотиков, не правда ли? На самом деле речь идет о повышении риска забеременеть у тех женщин, кто одновременно принимает оральные контрацептивы и некоторые лекарства из группы антибиотиков. Причина в том, что определенные антибактериальные препараты увеличивают выработку ферментов в печени, которые усиливают распад эстрогенов, поступающих из таблеток, и тем самым снижают эффективность противозачаточных препаратов. 8

В настоящее время ученые продолжают изучать механизм влияния различных антибиотиков на контрацептивы. Если вы не планируете беременность, во время лечения и еще неделю после завершения курса используйте дополнительные барьерные методы контрацепции.

О чем необходимо помнить?

Необходимо очень внимательно относиться к выбору лекарств и по возможности выбирать те, которые обладают наибольшим терапевтическим и наименьшим токсическим воздействием. Поэтому не стоит принимать антибиотики, если к этому нет показаний и эти препараты вам не рекомендовал врач.

При ОРВИ и болях в горле в большинстве случаев целесообразно выбирать симптоматическую терапию, которая способствует избавлению от неприятных симптомов вне зависимости от причины их возникновения. Препарат Стрепсилс® Интенсив, таблетки для рассасывания [медово-лимонные] оказывает местное обезболивающее и противовоспалительное действие на слизистую оболочку полости рта и горла: уменьшает отек, затруднение при глотании, боль и ощущение раздражения в горле.9

Препарат помогает устранить боль в горле вне зависимости от причины ее возникновения (будь то вирусы, бактерии или грибы). 

Способ применения и дозировки

9

Взрослые и дети старше 12 лет: медленно рассасывать по одной таблетке каждые 3-6 часов.

Максимальная суточная доза: 5 таблеток.

Продолжительность курса лечения – не более 3 дней. Если при приеме препарата в течение 3 дней симптомы сохраняются или усиливаются, необходимо прекратить лечение и обратиться к врачу.

Перед применением препарата ознакомьтесь с инструкцией.

Последствия неправильного приёма антибиотиков

В современном мире люди покупают и принимают внутрь антибиотики так же легко и спокойно, как, например, покупают и едят яблоки. Совершенно при этом не задумываясь, что имеют дело с большой опасностью.

Практика показывает, что сегодня нужно как можно чаще и громче говорить об ответственности и последствиях, которые могут быть связаны с приёмом, казалось бы, «безобидных» антибиотиков. При неправильном приёме антибиотики могут убивать не только «плохие», но и «хорошие» бактерии. Препараты могут быть просто токсичными и опасными для вашего организма. Нельзя самостоятельно принимать, менять дозировку или схему лечения.

Вот вам два «свежих» примера из практики.

Пример №1.

Пациенту назначили лечение хеликобактерной инфекции по схеме в несколько этапов. Со слов пациента «…этот препарат я не докупил, а потом у меня всё «расстроилось», решил, что просто допью антибиотики… и мне стало ещё хуже!»

И скажу вам не просто хуже, случилась катастрофа! При колоноскопии был обнаружен псевдомембранозный колит, простыми словами — тяжёлое воспаление толстого кишечника. Идея «просто допью антибиотики» оборачивается дисбактериозом, воспалением слизистой. При тяжёлых формах этого колита начинается интоксикация, повреждения стенки кишечника, общее обезвоживание и расстройство электролитного баланса, нередко в сочетании с нарушением белкового обмена.

Словом, организм получает очень сильный удар, после которого сложно будет прийти в себя.

Пример №2.

Молодой человек для лечения непонятных воспалительных высыпаний на коже головы по назначению доктора принимал лечение, куда входил антибиотик. Помогло. Но через некоторое время снова те же высыпания.

«…Ну, я посмотрел, что доктор назначил, и каждый раз, как выскочат шишки — пил». И так в течение полутора лет, иногда два, три раза в месяц. На момент нашего обследования «…неконтролируемая диарея, похудел, живот постоянно бурлит, работать не могу».

Исследования выявили эрозии, острые язвы. Вы их можете видеть на фотографиях.

Не буду утомлять вас медицинскими примерами. Поверьте, описанное — это лишь малая часть осложнений, которые встречаются при эндоскопических исследованиях у меня на приёме. Просто запомните главное правило: принимать антибиотики нужно по назначению врача. Не менять самостоятельно дозу, последовательность приёма препаратов. Так вы гарантируете себе благоприятный результат лечения.

А если вас что-то беспокоит, посоветуйтесь с лечащим врачом. Будьте здоровы!

эндоскопист МЦ «Медлюкс» Тамара Муцольгова

Медлюкс

Антибиотики не только полезны, но и опасны – Наука – Коммерсантъ

Примерно 70% россиян предпочитают лечиться антибиотиками при простудных заболеваниях. Специалистов и экспертов сферы здравоохранения настораживает такая статистика, потому что бесконтрольное самолечение может привести к тяжелым последствиям — от аллергических реакций до анафилактического шока.

Наиболее распространенные недуги, которые россияне стремятся вылечить антибиотиками,— это простуды и ЛОР-заболевания. Нередко следствием этого становятся привыкание к препарату и снижение его эффективности для организма.

По словам отоларинголога, доктора медицинских наук, профессора, руководителя центра отоларингологии «Он клиник» Ирины Кириченко, наиболее часто встречающийся у пациентов недуг — не имеющий полипов хронический синусит, воспаления в пазухах носа. Это связано с ухудшением экологической обстановки, занятиями экстремальными видами спорта (скалолазание, дайвинг) и тем, что пациенты самостоятельно лечатся антибиотиками, объясняет она.

«Очень много пациентов сами назначают себе лечение в виде различных антибактериальных препаратов, а также закапывания в нос сока алоэ, чего делать не нужно. Особо актуально среди граждан и промывание полости носа под давлением, добавление в промывную воду соли, соды и йода, что выжигает слизистую оболочку, а также способствует отеку и хронизации процесса»,— сетует она и замечает, что одним из вариантов профилактики развития или обострения синусита является своевременная диагностика и корректирование нарушения строения полости носа. Если при хроническом риносинусите антибиотики и назначаются специалистом, то сразу на длительный срок — вплоть до трех месяцев, указывает Кириченко.

По ее мнению, при обострении хронического риносинусита назначение антибиотиков вообще не всегда оправданно. Однако для пациентов, имеющих осложнения в виде хронического иммунодефицита, сахарного диабета, ВИЧ-инфекции, гепатитов B или C, а также при иммуносупрессивной терапии назначение антибактериальной терапии на фоне обострения хронического синусита будет обоснованно. Назначение антибиотиков может иметь место и при одонтогенном синусите, который нередко протекает с осложнениями и требует лечения не только у ЛОР-врача, но и у стоматолога.

«В зависимости от клинической картины доктор сам решает, назначать или не назначать антибактериальную терапию, но неправильно назначенная антибактериальная терапия может привести к увеличению резистентности. Поэтому огульные назначения антибиотиков при лечении хронического риносинусита не рекомендуются»,— предупреждает Кириченко.

Родоначальник всех антибиотиков — пенициллин — в 1928 году был открыт британским бактериологом Александром Флемингом. Находка, изменившая ход истории, была случайной. Доктор Флеминг не отличался большой аккуратностью: в его лаборатории часто был беспорядок, а чашки Петри, которые используются в лабораториях для культивирования бактерий и вирусов и наблюдения за ними, часто оставались немытыми после опытов. Флеминг исследовал колонии стафилококков. Однажды после очередного исследования он уехал на месяц в отпуск, оставив по традиции немытыми чашки, а когда приехал, то обнаружил в них плесень. Как настоящий исследователь, он решил не мыть чашку, а рассмотреть плесень под микроскопом. Увиденное удивило его: вокруг скопления плесени не было бактерий. Флеминг сделал вывод, что данный вид плесени подавляет болезнетворные микроорганизмы. Плесневые грибы в чашке относились к роду пенициллум — и вещество, которое обладало антибактериальным эффектом, было названо пенициллином. Это лекарство спасло миллионы жизней.

И сегодня роль антибиотиков в современном мире не стоит недооценивать. Некоторые заболевания просто невозможно вылечить без них. «С помощью препаратов антимикробного ряда успешно вылечиваются сложные, практически смертельные патологии, в том числе пневмония, менингококковые инфекции»,— говорит врач-терапевт, иммунолог Людмила Василенко. Вред антибиотиков для организма также очевиден. Воздействие их проявляется не только во вмешательстве в жизнедеятельность болезнетворных микробов, но и в тотальном устранении полезной микрофлоры, в первую очередь кишечника, основополагающей для поддержания иммунной системы.

«Особенно сложными последствиями специалисты считают раздражение слизистой оболочки желудка и кишечника, сложное нарушение баланса микрофлоры желудочно-кишечного тракта, нарушение работы почек, печени и желчного пузыря, выраженные аллергической реакцией, расстройство нервной системы, проявляющееся в вестибулярных нарушениях. В последнее время учащаются случаи бесконтрольного приема антибактериальных препаратов пациентами самопроизвольно. Статистика показывает, что в основном это люди, занятые карьерой и не имеющие возможности посещать врача и корректировать схему лечения»,— жалуется Людмила Василенко.

«При терапии вирусных инфекций антибиотики назначают только в случае, если заболевание осложнилось бактериальной инфекцией и вред антибиотиков сопоставимо ниже пользы для всего организма»,— подчеркивает Людмила Василенко. Врачи также утверждают, что существует правило безопасного приема антибиотиков. Для того чтобы лечение антибиотиками оказалось максимально эффективным и не спровоцировало осложнений, нужно, во-первых, соблюдать дозировку, которую назначил врач. Во-вторых, перед приемом следует дополнительно изучить инструкцию: в списке противопоказаний могут быть патологии, которые лечащий доктор не учел. В-третьих, не стоит практиковать прием антибактериальных препаратов на голодный желудок, так как вред антибиотиков для слизистой оболочки желудка и кишечника — давно доказанный факт. К тому же лекарство стоит запивать достаточным количеством воды: это позволит минимизировать воздействие на слизистую. Исключается алкоголь, прием абсорбентов, препаратов, разжижающих кровь, на весь период антибиотикотерапии. «На фоне улучшения состояния и снятия симптомов патологии не следует самовольно прекращать прием лекарства, так как не до конца убитые бактерии выработают устойчивость к препарату и дальнейшее лечение окажется неэффективным. Минимизируется вред антибиотиков с помощью приема пробиотиков. Доктора прописывают пациентам схему, по которой эти препараты следует принимать весь период лечения и некоторое время после окончания терапии. Так как антибактериальное средство способно угнетать иммунную систему, не стоит забывать о приеме иммуномодуляторов и витаминных комплексов»,— рекомендует Любовь Василенко.

Антибиотики эффективно нейтрализуют многие виды бактерий, но не все. Некоторые штаммы выжили при лечении и размножаются, из-за этого в дальнейшем эффективность антибактериальных препаратов снижается. Именно поэтому ученым приходится разрабатывать все новые и новые антибиотики.

Европейская сеть по контролю за потреблением антимикробных средств назвала распространение устойчивых к антибиотикам бактерий угрозой здоровью населения и призвала сообщество ученых к постоянной разработке новых лекарств. «Антибиотики нового поколения имеют более широкий спектр действия. Эффективность современных антибактериальных средств растет, уменьшается их побочное действие. Но стоит помнить, что ввиду быстрого роста резистентности к современным антибиотикам производство эффективного лекарства нового поколения может занимать десятилетия»,— посетовал терапевт Владислав Жемчугов.

Оксана Менейлюк


как вывести токсины после антибиотиков

как вывести токсины после антибиотиков

К недостаткам относят длительный, в сравнении с синтетическими препаратами, курс лечения и некоторые неудобства приёма ампул Клинистила, в сравнении с таблетками.

пот выводит токсины, где в омске купить клинистил
где купить клинистил от паразитов в спб
что любят паразиты в организме
как вывести подкожного паразита
как вывести токсины после химиотерапии

Именно поэтому после приёма антибиотиков нужно помочь своему организму в восстановлении. Восстановление микрофлоры кишечника и иммунитета. Длительный приём антибиотиков значительно ухудшает микрофлору кишечника.. Одним из самых распространенных результатов такого дисбиоза после приема антибиотиков является кандидоз. Его симптомы: появление нетипичных выделений, которые отличаются по плотности, консистенции, цвету и запаху, зуд, жжение и раздражение. Точный диагноз может поставить только врач, — но в связи со сложившейся неблагоприятной эпидемиологической обстановкой покупатель может обратиться к фармацевту за рекомендацией и покупкой безрецептурных препаратов. Почему возникает диарея после приема антибиотиков. Механизм развития диареи после курса антибиотиков. Лечение антибиотик-ассоциированной диареи. Профилактика диареи при антибиотикотерапии. Когда необходимо обратиться к врачу.. Антибиотики — группа лекарственных средств, нацеленных на борьбу с болезнетворными бактериями. Попадая в организм, они подавляют рост патогенной флоры и способствуют устранению инфекционно-воспалительных заболеваний.. выведение токсинов и продуктов обмена; выделение, всасывание воды в кишечнике; формирование каловых масс, регуляция их выведения. После антибиотикотерапии в кишечнике и печени, а также крови и лимфе поселяется группа пенициллиновых грибков. Они угнетают нормальную микрофлору кишечника и снижают иммунитет, аллергизуют все слизистые организма. И на этом фоне могут быть различные проявления аллергии, как на медикаменты, так и на различные продукты питания. А также повышенная восприимчивость к различным вирусам, бактериям, паразитам.. Большой токсической нагрузке при употреблении антибиотиков подвергается костный мозг, который вырабатывает элементы крови. Часто изменяется формула крови, что может привести к онкологическим заболеваниям крови. Нарушается репродуктивная функция. Открытие антибиотиков стало своеобразным рубежом в развитии не только медицины, но и общества в целом. Столь эффективные лекарственные средства, конечно же, закономерно имеют побочные эффекты. Однако польза от антибактериальных средств настолько выражена, что их применение, несмотря на высокую распространенность побочных эффектов, не прекратится. Среди побочного действия почти у всех антибиотиков наиболее часто встречается нарушение пищеварения в виде расстройства стула, возникновение анбитиотикассоциированной диареи. Причём в последнее время частота развития анбитиотикассоциированной диареи возросла. после приема антибиотиков для восстановления микрофлоры. Непатогенные живые микроорганизмы поддерживают синтез интерферона, снимая симптомы аллергии. Действующие компоненты нейтрализуют бактерии Helicobacter Pylori, которые вызывают язвенную болезнь желудка.. Активные вещества, входящие в Линекс устойчивы к антибиотикам. Они оказывают влияние не только на нижние отделы кишечника, но и на верхние (этими свойствами обладают далеко не все пробиотики). Многокомпонентное средство, пригодно практически для всех пациентов, включая детей (даже тех, кто находится на искусственном питании). Детоксикация кишечника. Чтобы нормофлора хорошо росла и размножалась нужно вывести токсины из организма. В комплексе с пробиотиками можно использовать пребиотики, например Наринэ-форте с инулином. Инулин является растворимой клетчаткой, которая в кишечнике не переваривается. Совместно с большим количеством компонентов бактериальных клеток он действует как естественный сорбент. Таким образом происходит очищение организма от токсинов, накопленных за время болезни. III этап. Создание временного искусственного биоценоза в кишечнике. Препараты, плохо всасывающиеся из желудочно-кишечного тракта, выводятся кишечником и применяются при гастритах, энтеритах и колитах (например, вяжущие средства, некоторые антибиотики используемые при кишечных инфекциях). Кроме того, из печеночных клеток лекарства и их метаболиты попадают в желчь и с нею поступают в кишечник, откуда либо повторно всасываются, доставляются в печень, а затем с желчью в кишечник (кишечно- печеночная циркуляция), либо выводятся из организма с каловыми массами. Кишечные антибиотики. Доказано, что большинство кишечных инфекций вызываются грамотрицательными бактериями. По этой причине максимальный антибактериальный эффект оказывают антибиотики, активные в отношении грамотрицательной микрофлоры.. Известный антибиотик Левомицетин нарушает выработку белковых структур клеток бактерий и угнетает их ферментативную активность. Однако при кишечных инфекциях он применяется только в случае тяжелых расстройств системного характера, поскольку вещество быстро проникает в кровь и проходит через все барьеры. Назначают препарат при недостаточном действии местных антибиотиков. Если после приема антибиотиков у вас не было сыпи, расстройства желудка и других симптомах, это не значит, что побочные эффекты обошли вас стороной. Просто организм молча принял удар и не подал виду. Антибиотики внутри нас.. Орган, который должен очищать кровь от токсинов, плохо справляется со своей функцией, в результате чего организм страдает от интоксикации. Как помочь организму восстановиться?. К таким относится комплекс с пектином Жидкий уголь, который не только выводит вредные вещества, но и восстанавливает микрофлору кишечника. Основной действующий ингредиент Жидкого угля — яблочный пектин. Он растворяется в воде и превращается в гель. После приема антибиотиков эти бактерии погибают, открывая дорогу другим микроорганизмам, которые выделяют газы и другие токсические вещества, препятствуют всасыванию воды. Из всего этого и формируется типичный комплекс симптомов - частая диарея, метеоризм, вздутие и боли в животе, симптомы общей интоксикации (слабость, разбитость, иногда незначительное повышение температуры). Устранить такие последствия лечения антибиотиками можно только одним способом - приемом препаратов-пробиотиков, содержащие живые бактерии, полезные для нашего организма (Линекс, Бифидумбактерин). В легких случаях достаточно.

где купить клинистил от паразитов в спб как вывести токсины после антибиотиков

пот выводит токсины где в омске купить клинистил где купить клинистил от паразитов в спб что любят паразиты в организме как вывести подкожного паразита как вывести токсины после химиотерапии чем почистить организм от паразитов купить протокол лечения энтеробиоза

как вывести токсины после антибиотиков что любят паразиты в организме

чем почистить организм от паразитов купить
протокол лечения энтеробиоза
какие продукты выводят паразитов
как вылечить паразитов в организме человека
как проверить на паразитов организм какие анализы
как выводить паразитов из организма человека

Препарат Клинистил имеет натуральный состав и удобную форму, поэтому можно применять самостоятельно, но инструкция по применению рекомендует предварительно рассмотреть принципы использования. Желательно проконсультироваться с врачом, который подберет подходящую схему для лечения для каждого пациента. Когда появились боли, проблемы с пищеварением, тошнота и рвота сестра порекомендовала пропить ампулы Клинистил. Она медик, предположила, что гельминтоз. Одну упаковку сестра дала, а еще 2 купила на сайте производителя. Пропила курс, проблемы исчезли. Клинистил не содержит алкалоидов. При расщеплении биоактивных веществ компонентов ЛС алкалоиды не образуются – отсутствует эффект привыкания независимо от длительности курса и суточной дозировки.

Применение антибиотиков без назначения врача — опасно

В аптеках г.о. Истра наблюдается большой спрос на препараты, применяемые при лечении бактериальных инфекций, другими словами – на антибиотики. Систематический мониторинг показывает, что в некоторых аптеках их раскупают практически сразу же после поступления очередной партии.

Напоминаем, что применение антибактериальных препаратов без назначения врача – это не только не эффективное лечение, но и опасное. И это факт!

Почему нельзя назначать самому себе антибиотики, и какие могут быть последствия от самолечения? Об этом рассказывает главный внештатный пульмонолог министерства здравоохранения РФ, член-корреспондент РАН Сергей Николаевич Авдеев.

По его словам:

Применение антибиотиков в качестве профилактики коронавирусной инфекции - недопустимо. Антибиотики не действуют ни на какие вирусы, включая новый̆ коронавирус. Их назначают только в случае развития бактериальных осложнений при COVID-19.

Самостоятельное и бесконтрольное лечение антибиотиками может привести к развитию побочных реакций. В результате нерационального использования микробы, находящиеся на теле человека и внутри него, могут приобрести устойчивость к применяемым препаратам, и, как следствие, после возможного развития бактериальной̆ инфекции, врачам придется использовать иные схемы лечения, иногда с использованием нескольких препаратов, а не одного, и курс терапии будет более длительным.

Необходимо учитывать и лекарственные взаимодействия антибиотиков с теми препаратами, которые пациент получает для лечения или профилактики хронических заболеваний.

 К тому же не стоит забывать, что антибиотики, как и все лекарственные препараты, имеют нежелательные побочные действия. Об этом написано в сопровождающих аннотациях. На первый взгляд, они могут быть безобидными, как, например, аллергическая сыпь, но иногда приводят к целому ряду опасных побочных реакций, вплоть до анафилактического шока.

Все эти причины говорят об однозначном выводе, что антибиотики – это рецептурный препарат. Не стоит заниматься самолечением, эти препараты должны назначаться исключительно врачом. 

Берегите себя и своих близких.

можно ли пить во время и после лечения, побочные эффекты, через сколько можно

Месяц назад я простудился — вернее, это я так думал. Болезнь переросла во что-то, похожее на бронхит, а вчера врач поставила воспаление легких и назначила антибиотики. Но есть проблема: в выходные у отца юбилей — 60 лет. Будет праздничный стол и алкоголь.

У меня вопрос: насколько опасно совмещать спиртное и антибиотики и что будет, если все-таки выпить, чтобы не обижать отца и гостей?

На эффективность большинства антибиотиков алкоголь не влияет — лекарства будут бороться с болезнетворными бактериями так же эффективно, как если бы вы не пили. Однако некоторые антибиотики взаимодействуют со спиртным. Из-за этого могут возникнуть побочные реакции, которых в противном случае удалось бы избежать.

Что такое антибиотики

Антибиотики — лекарства, которые борются с бактериальными инфекциями у людей и животных. Это бактериальные яды, которые воздействуют на уязвимые точки микробов. В результате последние либо погибают, либо утрачивают способность расти и размножаться. У вирусов уязвимых точек, характерных для бактерий, нет, поэтому на них антибиотики не действуют.

Как и любые лекарства, антибиотики могут вызывать побочные эффекты. Проблема в том, что при совместном приеме с некоторыми антибиотиками спиртное не только усиливает нежелательные реакции на лекарство, но и может провоцировать новые.

Почему не рекомендуется смешивать антибиотики и алкоголь — Американский центр зависимостей

Как алкоголь влияет на работу антибиотиков

Помимо антибиотиков с алкоголем не сочетаются антидепрессанты, антигистаминные, барбитураты, бензодиазепины, обезболивающие, противовоспалительные препараты. Даже некоторые лекарства на основе трав могут вызывать негативные последствия, если запивать их алкоголем.

Взаимодействие алкоголя и лекарств — журнал «Исследования алкоголя и здоровья»PDF, 99 КБ

Спиртное взаимодействует с лекарственными препаратами двумя способами.

За обезвреживание ядов отвечают специальные белки — ферменты, которые вырабатывает печень. Если в печень поступает не только антибиотик, но и лишнее спиртное, увеличивается нагрузка на ферменты. В результате они либо не успевают выполнить свою работу, либо, наоборот, выполняют ее слишком быстро. В первом случае уровень антибиотика в организме увеличивается, а это может привести к большей токсичности препарата и побочным эффектам, которых при точной дозировке удалось бы избежать. А во втором случае антибиотик разрушается слишком быстро — до того, как успеет подействовать.

Алкоголь подавляет работу ферментов и усиливает токсичность антибиотиков — международная база данных лекарственных препаратов Drugs

Алкоголь усиливает побочные эффекты лекарства и провоцирует новые. Например, метронидазол и сам по себе вызывает сонливость и подавляет внимание, а спиртное дополнительно усиливает эти эффекты. В результате человек рискует попросту уснуть за праздничным столом.

Алкоголь и метронидазол — NHS

Кроме того, метронидазол в сочетании с алкоголем дает дополнительные побочные эффекты: вызывает головную боль, тошноту, боль в животе и аритмию. Никто не знает, почему так получается: взаимодействие этого антибиотика со спиртным пока недостаточно изучено.

Помимо алкоголя антибиотики не сочетаются и с другими лекарствами. Это антикоагулянты, например варфарин, противосудорожные средства, например фенитоин и фенобарбитал, противодиабетические препараты в таблетках, например толбутамид. Поэтому перед началом приема антибиотиков нужно рассказать врачу обо всех своих заболеваниях и лекарствах, которые вы принимаете.

УЧЕБНИК

Как победить выгорание

Курс для тех, кто много работает и устает. Цена открыта — назначаете ее сами

Начать учиться

Можно ли пить алкоголь одновременно с антибиотиками

Это зависит от того, какой именно антибиотик принимать вместе со спиртным и в каких отношениях с алкоголем находится человек.

Взаимодействие алкоголя и антибиотиков — журнал «Антимикробные препараты и химиотерапия»PDF, 536 КБ

Эритромицин. Даже небольшие дозы алкоголя ускоряют работу ферментов печени, которые отвечают за переработку препарата. В результате лекарство может не подействовать — потребуются дополнительные дозы.

Кетоконазол и гризеофульвин. Если человек выпьет спиртной напиток в тот же день, что и одно из этих лекарств, увеличится риск развития дисульфирамоподобной реакции — так называют состояние, похожее на очень тяжелое похмелье. Человека тошнит и рвет, у него раскалывается голова, а у некоторых даже возникают боли в груди и животе.

Доксициклин. У людей, страдающих хроническим алкоголизмом, доксициклин ускоряет работу ферментов печени, которые отвечают за переработку препарата. Именно поэтому зависимым от алкоголя людям требуются более высокие дозировки этого лекарства.

При этом не все антибиотики одинаково плохо сочетаются со спиртным. Есть препараты, принимать алкоголь одновременно с которыми относительно безопасно. Умеренные дозы алкоголя, то есть не более одной стандартной порции в день для женщин и двух для мужчин, совместимы:

  • с пероральными пенициллинами, фторхинолонами и тетрациклинами;
  • некоторыми цефалоспоринами — цефдиниром и цефподоксимом;
  • азитромицином;
  • нитрофурантоином.

Стандартная порция алкоголя составляет 14 г чистого этанола — Национальный институт алкогольной зависимости и алкоголизма США

Через какое время после приема антибиотиков можно пить алкоголь

Сказать, какой совет точнее, сложно. Но пожалуй, имеет смысл подождать минимум двое суток.

Так пить или не пить

Хотя некоторые антибиотики сочетаются с умеренными дозами алкоголя, пациентам, которые лечатся от бактериальных инфекций, пить спиртное все-таки не рекомендуется. Алкогольные напитки не только влияют на работу ферментов печени, но и нарушают нормальный сон — все это мешает полноценному выздоровлению.

Алкоголь мешает людям нормально высыпаться — НКО Sleep Foundation

Даже если врач назначил вам совместимый со спиртным антибиотик, безопаснее все-таки не пить, даже в честь праздника.


Алкоголь после антибиотиков

Вопрос о том, можно ли совмещать употребление алкогольных напитков с приемом антибиотиков часто возникает перед людьми, которые страдали от различных заболеваний во время праздничных застолий. И это совершенно не удивительно, ведь именно антибактериальные лекарства чаще всего применяются для лечения инфекций различного происхождения.

Антибактериальная терапия вносит ограничения в жизнь человека – это касается одновременного приема других медикаментозных средств, некоторых продуктов питания, а также спиртных напитков. Какое воздействие оказывают антибиотики и алкоголь на организм и может ли такое сочетание принести серьезный вред здоровью?

Совместимость антибиотиков и спиртного

Взаимодействие антибактериальных препаратов с алкогольными напитками изучалось на протяжении многих лет. Было установлено, что после приема медикаменты принимают активное участие во многих обменных процессах, распадаясь на составные компоненты. Большая часть этих веществ не вступает в реакцию с этиловым спиртом, поэтому во многих случаях допускается употребление алкогольных напитков во время антибактериальной терапии.

Но прием алкоголя должен быть однократным. Желательно сделать перерыв между напитком и лекарством как минимум на 24 часа. Более частое употребление спиртного значительно снижает эффективность антибиотиков, поэтому лечение не принесет положительных результатов.

Выделяется ряд лекарственных препаратов, при которых употреблять спиртное категорически запрещается:

  • фторхинолоны;
  • аминогликозиды;
  • нитроимидазолы;
  • некоторые цефалоспорины.

Спиртные напитки оказывают повышенную нагрузку на печень, как и медикаментозные средства из группы антибиотиков. Именно поэтому такая совместимость может иметь самые печальные последствия для состояния печени и всего организма.

Вред алкоголя во время антибактериальной терапии

Антибиотики и алкоголь, совместимость которых изучалась в лабораторных условиях, оказывают негативное воздействие на организм человека. Лекарственные препараты тормозят процесс расщепления этилового спирта, в результате чего накапливается уксусный альдегид. Это приводит к серьезной интоксикации, которая может выражаться в форме дыхательной недостаточности, обезвоживания, приступов рвоты, нарушений сердечного ритма.

Этиловый спирт несовместим с антибактериальными препаратами, так как данное сочетание оказывает усиленную нагрузку на печень и приводит к ее токсическому поражению. Составные вещества спирта вступают в конфликт с компонентами лекарства, в результате чего нарушается выведение продуктов распада. Вредные метаболиты активно накапливаются, вызывая тяжелую интоксикацию.

В некоторых случаях спиртные напитки вызывают седативный эффект, как и отдельные антибиотики. Поэтому алкоголь после антибиотиков часто приводит к токсическому угнетению центральной нервной системы.

Антибиотики и фторхинолоны

Отвечая на вопрос, можно ли алкоголь при приеме антибиотиков из группы фторхинолонов врачи подчеркивают, что подобная комбинация несет самые тяжелые последствия для здоровья. К наиболее распространенным фторхинолонам относятся:

  1. Офлоксацин.
  2. Левофлоксацин.
  3. Зимар, Зарквин.
  4. Ломфлокс.
  5. Норфлоксацин.
  6. Ципрофлоксацин.
  7. Спарфло.
  8. Палин.
  9. Абактал.
  10. Вигамокс, Авелокс.

Почему нельзя употреблять спиртные напитки с медикаментами из группы фторхинолонов? В большинстве случаев такая совместимость приводит к тяжелому угнетению центральной нервной системы, последствием которого является состояние комы.

Спиртное и аминогликозиды

Многие мужчины и женщины интересуются, можно ли принимать аминогликозиды одновременно с алкогольными напитками и какое действие такое сочетание имеет для организма. Не рекомендуется сочетать спиртное с такими лекарственными препаратами:

  • Селемицин, Амикацина сульфат;
  • Изофра;
  • Тобрекс, Брамитоб;
  • Гентамицин;
  • Нетромицин;
  • Канамицин;
  • Полижинакс;
  • Стрептомицин.

Антибактериальные средства из группы аминогликозидов сегодня применяются крайне редко, так как они отличаются широким спектром побочных действий. Одновременное употребление алкогольных напитков усиливает побочные эффекты лекарств, оказывая выраженное токсическое действие на внутренние органы и весь организм в целом.

Нитроимидазолы в сочетании с алкоголем

В случае, если антибактериальная терапия проводится при помощи нитроимидазолов, от приема спиртных напитков необходимо полностью отказаться. Эти лекарственные препараты провоцируют повышенную чувствительность к этиловому спирту, поэтому употребление алкоголя приводит к тяжелой форме интоксикации.

Наиболее известные нитроимидазолы:

  1. Метронидазол.
  2. Клион.
  3. Трихопол.
  4. Тинидазол.
  5. Метрогил.
  6. Фазижин.

Этиловый спирт усиливает побочные действия нитроимидазолов. Пациента беспокоят приступы тошноты и рвоты, боли в области живота, ощущение жара, сильные головные боли, учащение пульса.

Воздействие алкоголя на другие антибиотики

Совместимый ли алкоголь с другими группами антибактериальных препаратов – это миф или реальность? Одновременное употребление спиртных напитков с медикаментами имеет меньшее негативное действие, но все же на протяжении антибактериальной терапии рекомендуется пить минимальное количество алкоголя.

Хмельные напитки нейтрализуют лечебные свойства фармакологических средств, в результате чего лечение не будет эффективным. Кроме того, этиловый спирт способен усиливать побочные эффекты антибиотиков, усугублять проявления дисбактериоза.

Но однократный прием спиртного не приведет к таким негативным последствиям. После антибиотиков пить алкоголь разрешается спустя 24-25 часов. Это время необходимо выдержать для того, чтобы составные компоненты этилового спирта успели расщепиться и вывестись из организма.

Отвечая на вопрос, через сколько после алкоголя пить антибиотики, важно помнить, что между их приемом должно пройти не менее 24 часов. Желательно выдержать еще больший интервал времени. Установлено, что чем больше пауза между употреблением алкогольных напитков и антибиотиков, тем меньше вероятность развития побочных действий.

В случае, если у человека был продолжительный запой и он только из него вышел, необходимо подождать как минимум через период, равный половине длительности запоя и лишь затем приступать к лечению антибактериальными препаратами.

Антибиотики – это серьезные лекарственные средства, применяемые для лечения широкого спектра заболеваний. На эффективность антибактериальной терапии оказывают влияние многие факторы, в том числе и прием алкоголя. На протяжении всего лечения лучше всего отказаться от употребления спиртного – это поможет получить быстрые положительные результаты и восстановить здоровье.

Борьба с устойчивостью к антибиотикам | FDA

Узнайте больше о том, почему вам могут не понадобиться антибиотики во время болезни, и о проблемах, которые могут вызвать антибиотики, если их принимать без надобности.

Антибиотики - это лекарства, используемые для лечения инфекций, вызванных бактериями. Антибиотики, также известные как противомикробные препараты, спасли бесчисленное количество жизней.

Однако неправильное и чрезмерное употребление этих препаратов способствовало возникновению явления, известного как устойчивость к антибиотикам. Эта устойчивость развивается, когда потенциально вредные бактерии изменяются таким образом, что снижает или устраняет эффективность антибиотиков.

A Проблема общественного здравоохранения

Устойчивость к антибиотикам - растущая проблема общественного здравоохранения во всем мире. Когда человек инфицирован устойчивой к антибиотикам бактерией, не только лечение этого пациента становится более трудным, но и устойчивые к антибиотикам бактерии могут распространяться на других людей.

Когда антибиотики не действуют, результат может быть

  • более длительные болезни
  • Болезни более сложные
  • больше посещений врача
  • употребление более сильных и дорогих препаратов
  • человек больше смертей от бактериальных инфекций

Примеры бактерий, которые стали устойчивыми к антибиотикам, включают бактерии, вызывающие кожные инфекции, инфекции мочевыводящих путей, менингит, заболевания, передаваемые половым путем, и инфекции дыхательных путей, такие как пневмония.

В сотрудничестве с другими правительственными учреждениями Управление по санитарному надзору за качеством пищевых продуктов и медикаментов (FDA) выступило с рядом инициатив по борьбе с устойчивостью к антибиотикам.

Агентство издало правила маркировки лекарств, в которых подчеркивается разумное использование антибиотиков. Правила побуждают медицинских работников назначать антибиотики только в случае клинической необходимости и консультировать пациентов о правильном использовании таких лекарств и важности их приема в соответствии с указаниями. FDA также поощряет разработку новых лекарств, вакцин и улучшенных диагностических тестов для инфекционных заболеваний.

Антибиотики борются с бактериями, а не с вирусами

Антибиотики предназначены для лечения бактериальных инфекций. Например, они используются для лечения ангины, вызываемой стрептококковыми бактериями, и кожных инфекций, вызванных стафилококковыми бактериями.

Хотя антибиотики убивают бактерии, они не эффективны против вирусов. Следовательно, они не будут эффективны против вирусных инфекций, таких как простуда, кашель, многие виды боли в горле и грипп.

Использование антибиотиков против вирусных инфекций

  • не вылечит инфекцию
  • не помешает другим людям заразиться вирусом
  • не поможет человеку почувствовать себя лучше
  • может вызывать ненужные вредные побочные эффекты
  • может способствовать развитию устойчивых к антибиотикам бактерий

Пациенты и медицинские работники могут сыграть важную роль в борьбе с устойчивостью к антибиотикам. Пациентам не следует требовать антибиотики, если медицинский работник говорит, что они не нужны.Медицинские работники должны назначать антибиотики только при инфекциях, которые, по их мнению, вызваны бактериями.

Как пациент, лучше всего спросить у своего лечащего врача, будет ли антибиотик эффективным при вашем заболевании. Также спросите, что еще вы можете сделать, чтобы облегчить симптомы.

Так как же узнать, что у вас простуда или бактериальная инфекция?

Джозеф Тёрнер, доктор медицины, магистр здравоохранения, медицинский сотрудник Центра оценки и исследований лекарственных средств FDA, говорит, что симптомы простуды или гриппа обычно уменьшаются в течение недели.Но если у вас жар и другие симптомы, которые сохраняются и ухудшаются с течением времени, возможно, у вас бактериальная инфекция, и вам следует проконсультироваться с врачом.

Следуйте инструкциям по использованию по назначению

Когда вам прописывают антибиотик для лечения бактериальной инфекции, важно принимать лекарство точно в соответствии с указаниями. Вот еще несколько советов по правильному использованию антибиотиков.

  • Принимайте антибиотики в соответствии с предписаниями. Важно принимать лекарство в соответствии с предписаниями врача, даже если вы чувствуете себя лучше.Если лечение прекратится слишком рано и вы снова заболеете, оставшиеся бактерии могут стать устойчивыми к принимаемому вами антибиотику.
  • Не пропускайте дозы. Антибиотики наиболее эффективны, когда их принимают по назначению.
  • Не экономьте на антибиотиках. Вы можете подумать, что можете приберечь антибиотик на случай следующего заболевания, но на данный момент антибиотик предназначен для лечения вашей конкретной инфекции. Никогда не принимайте остатки лекарства. Принятие неправильного лекарства может отложить получение соответствующего лечения и может привести к ухудшению вашего состояния.
  • Не принимайте антибиотики, назначенные другим лицам. Они могут не подходить для вашего заболевания, могут отсрочить правильное лечение и привести к ухудшению вашего состояния.
  • Поговорите со своим лечащим врачом. Задавайте вопросы, особенно если вы не уверены, когда вам нужен антибиотик или как его принимать.
  • Все препараты имеют побочные эффекты. Сообщите своему врачу, если у вас появятся новые или необычные симптомы или побочные эффекты.Возможно, вам потребуется остановить прием антибиотика, вызывающего неприятный побочный эффект, и завершить лечение другим антибиотиком.

Потребители и медицинские работники также могут сообщать о нежелательных явлениях в программу FDA MedWatch по телефону 800-FDA-1088 или онлайн в MedWatch.

Что делает FDA

FDA борется с устойчивостью к антибиотикам с помощью мероприятий, включающих

  • Утверждение некоторых новых антибиотиков. С 2015 года FDA одобрило новые антибиотики, которые могут лечить определенные устойчивые бактерии.Медицинским работникам рекомендуется использовать новые антибиотики надлежащим образом, а некоторые антибиотики использовать только у пациентов, у которых есть ограниченные возможности лечения или нет других вариантов лечения.
  • Правила маркировки, касающиеся правильного использования антибиотиков. Маркировка антибиотиков содержит обязательные заявления в нескольких местах, рекомендующие медицинским работникам использовать эти препараты только для лечения инфекций, которые, как считается, вызваны бактериями. Маркировка также побуждает медицинских работников консультировать пациентов по поводу правильного использования.
  • Партнерство для повышения осведомленности общественности. FDA сотрудничает с Центрами по контролю и профилактике заболеваний (CDC) в рамках кампании «Стань умнее: знай, когда антибиотики работают», предлагая веб-страницы, брошюры, информационные бюллетени и другие источники информации, направленные на то, чтобы помочь общественности узнать о профилактике заболеваний. устойчивые к антибиотикам инфекции.
  • Поощрение разработки новых антибиотиков. FDA разработало руководство для промышленности по типам клинических исследований, которые можно проводить для оценки эффективности антибактериального препарата при лечении различных типов инфекций.FDA организовало и участвовало в семинарах, направленных на разработку новых антибиотиков для лечения устойчивых бактериальных инфекций.

к началу

Произошла ошибка при настройке пользовательского файла cookie

Этот сайт использует файлы cookie для повышения производительности. Если ваш браузер не принимает файлы cookie, вы не можете просматривать этот сайт.


Настройка вашего браузера для приема файлов cookie

Существует множество причин, по которым cookie не может быть установлен правильно.Ниже приведены наиболее частые причины:

  • В вашем браузере отключены файлы cookie. Вам необходимо сбросить настройки вашего браузера, чтобы он принимал файлы cookie, или чтобы спросить вас, хотите ли вы принимать файлы cookie.
  • Ваш браузер спрашивает вас, хотите ли вы принимать файлы cookie, и вы отказались. Чтобы принять файлы cookie с этого сайта, нажмите кнопку «Назад» и примите файлы cookie.
  • Ваш браузер не поддерживает файлы cookie. Если вы подозреваете это, попробуйте другой браузер.
  • Дата на вашем компьютере в прошлом.Если часы вашего компьютера показывают дату до 1 января 1970 г., браузер автоматически забудет файл cookie. Чтобы исправить это, установите правильное время и дату на своем компьютере.
  • Вы установили приложение, которое отслеживает или блокирует установку файлов cookie. Вы должны отключить приложение при входе в систему или проконсультироваться с системным администратором.

Почему этому сайту требуются файлы cookie?

Этот сайт использует файлы cookie для повышения производительности, запоминая, что вы вошли в систему, когда переходите со страницы на страницу.Чтобы предоставить доступ без файлов cookie потребует, чтобы сайт создавал новый сеанс для каждой посещаемой страницы, что замедляет работу системы до неприемлемого уровня.


Что сохраняется в файле cookie?

Этот сайт не хранит ничего, кроме автоматически сгенерированного идентификатора сеанса в cookie; никакая другая информация не фиксируется.

Как правило, в cookie-файлах может храниться только информация, которую вы предоставляете, или выбор, который вы делаете при посещении веб-сайта.Например, сайт не может определить ваше имя электронной почты, пока вы не введете его. Разрешение веб-сайту создавать файлы cookie не дает этому или любому другому сайту доступа к остальной части вашего компьютера, и только сайт, который создал файл cookie, может его прочитать.

Кратковременное лечение антибиотиками оказывает различное долгосрочное воздействие на микробиом горла и кишечника человека

Реферат

Введение антибиотиков - стандартное лечение бактерии Helicobacter pylori , основного возбудителя язвенной болезни и рака желудка.Однако долгосрочные последствия этого лечения для местной микробиоты человека относительно не изучены. Здесь мы изучали краткосрочные и долгосрочные эффекты лечения кларитромицином и метронидазолом, обычно используемым режимом терапии против H. pylori , на местную микробиоту в горле и нижнем отделе кишечника. Бактериальный состав в образцах, собранных в течение четырехлетнего периода, контролировали путем анализа гена 16S рРНК с использованием пиросеквенирования на основе 454 и полиморфизма длин концевых рестрикционных фрагментов (T-RFLP).В то время как микробные сообщества необработанных контрольных субъектов были относительно стабильными с течением времени, через неделю после лечения антибиотиками наблюдались резкие сдвиги с уменьшением бактериального разнообразия у всех леченных субъектов в обоих местах. Хотя микробиота разных субъектов однозначно реагировала на лечение антибиотиками, можно было наблюдать некоторые общие тенденции; например, резкое снижение количества актинобактерий в горле и кале сразу после лечения. Хотя впоследствии разнообразие микробиоты восстановилось и стало напоминать состояния до лечения, в некоторых случаях микробиота оставалась нарушенной в течение до четырех лет после лечения.Кроме того, через четыре года после лечения были обнаружены высокие уровни гена устойчивости к макролидам erm (B), что указывает на то, что устойчивость к антибиотикам, однажды отобранная, может сохраняться в течение более длительных периодов времени, чем предполагалось ранее. Это подчеркивает важность ограничительного использования антибиотиков для предотвращения последующего неэффективного лечения и потенциального распространения устойчивости к антибиотикам.

Образец цитирования: Jakobsson HE, Jernberg C, Andersson AF, Sjölund-Karlsson M, Jansson JK, Engstrand L (2010) Краткосрочное лечение антибиотиками оказывает различное долгосрочное воздействие на микробиом горла и кишечника человека.PLoS ONE 5 (3): e9836. https://doi.org/10.1371/journal.pone.0009836

Редактор: Адам Дж. Ратнер, Колумбийский университет, Соединенные Штаты Америки

Поступила: 18 сентября 2009 г .; Одобрена: 3 марта 2010 г .; Опубликовано: 24 марта 2010 г.

Авторские права: © 2010 Jakobsson et al. Это статья в открытом доступе, распространяемая в соответствии с условиями лицензии Creative Commons Attribution License, которая разрешает неограниченное использование, распространение и воспроизведение на любом носителе при условии указания автора и источника.

Финансирование: Фонд Экхаги и Фонд Содерберга, а также частично Министерство энергетики США Свяжитесь DE-AC02-05Ch21231 с Национальной лабораторией Лоуренса Беркли. Финансирующие организации не играли никакой роли в дизайне исследования, сборе и анализе данных, принятии решения о публикации или подготовке рукописи.

Конкурирующие интересы: Авторы заявили об отсутствии конкурирующих интересов.

Введение

В каждой анатомической нише человеческого тела обнаруживается сложная специализированная микробиота [1].Нормальная кишечная микробиота выполняет несколько полезных функций, включая защиту от вторжения патогенов, развитие иммунной системы и питание [2], [3], [4], [5], [6]. Несколько внешних факторов могут вызвать нарушения или изменить бактериальный состав. Например, известно, что противомикробное лечение вызывает краткосрочные изменения в составе нормальной микробиоты человека [7], но также были показаны долгосрочные последствия [8], [9], [10], [11]. Одной из проблем, вызывающих беспокойство при приеме антибиотиков, является возможность отбора устойчивых к антибиотикам штаммов бактерий; не только среди тех, на которые направлен антибиотик, но и среди нормальной микробиоты [10].Таким образом, коренная микробиота человека может потенциально служить резервуаром генов устойчивости и способствовать развитию устойчивости к антибиотикам [12], [13].

Обычно применяемая схема лечения Helicobacter pylori , грамотрицательной палочки, колонизирующей слизистую оболочку желудка, представляет собой тройную терапию кларитромицином, метронидазолом и омепразолом [14], [15], [16]. Такое лечение может привести к развитию устойчивости к антибиотикам среди штаммов H. pylori [16], а также среди представителей нормальной микробиоты [7], [9], [10], [11], [17].Один из механизмов устойчивости к макролидам - ​​это метилазы устойчивости к эритромицину, кодируемые генами erm . Эти гены были обнаружены у разных родов, у erm (B) самый большой диапазон хозяев [18]. Ген erm (B) обычно находится на транспозонах, расположенных в хромосоме или плазмидах [18], и кодирует рибосомную метилазу, которая метилирует 23S рибосомную РНК и тем самым предотвращает связывание антибиотика [19].

В нескольких отчетах [7], [20], [21] описаны микробиологические изменения после эрадикационной терапии, содержащей кларитромицин, метронидазол и омепразол, с использованием традиционных методов культивирования.Однако недавние исследования, основанные на анализе гена 16S рРНК, показали, что около 60–80% бактериального сообщества в кишечнике еще не культивировано, отчасти из-за неизвестных требований к росту [22]. Поэтому влияние этой широко используемой лечебной терапии антибиотиками на большую часть микробиоты человека полностью не изучено, особенно долгосрочные последствия.

Различные молекулярные подходы были применены для непосредственной оценки разнообразия и состава ассоциированных с человеком бактериальных сообществ без необходимости культивирования [22], [23], [24], [25].Большинство исследований сосредоточено на кишечной среде, хотя исследуется все большее количество участков тела [1]. Например, недавно в горле была обнаружена весьма разнообразная микробиота [24] со 152 различными филотипами. Здоровая микробиота также была охарактеризована в дистальном отделе пищевода [26] и желудка [27]. Наибольшее количество бактерий обнаруживается в толстой кишке [25], где, по оценкам, примерно 10 11 бактерий колонизируют 1 грамм фекалий [28].

Одним из примеров подхода, основанного на ДНК-фингерпринте, который использовался для изучения эффектов антибиотиков на микробиоту кишечника, является полиморфизм длины терминального рестрикционного фрагмента (T-RFLP) [29].Ранее мы использовали этот подход для мониторинга воздействия клиндамицина на фекальную микробиоту [8]. Наблюдались как краткосрочные сдвиги в сообществах, так и долгосрочные воздействия (т.е. 2 года) на популяции Bacteroides .

В настоящем исследовании мы использовали комбинацию молекулярных подходов для оценки воздействия обычно используемого лечения антибиотиками для H. pylori на состав бактериального сообщества в образцах горла и стула в течение четырехлетнего периода времени.Используя пиросеквенирование гена 16S рРНК и T-RFLP, мы стремились определить, приводит ли лечение антибиотиками к долгосрочным сдвигам в структуре микробного сообщества в образцах. Кроме того, мы использовали ПЦР в реальном времени для мониторинга уровней устойчивости гена erm (B) в течение четырех лет после лечения.

Результаты

Долговременная стабильность местной микробиоты

Результаты T-RFLP и пиросеквенирования в значительной степени дополняют друг друга. T-RFLP предоставил быстрый обзор изменений в доминантных членах сообщества, тогда как данные пиросеквенирования предоставили подробную информацию об изменениях в относительных количествах тысяч OTU.Несколько тысяч считываний пиросеквенирования были проанализированы у всех пациентов и контрольной группы, и приблизительно 5000–11000 считываний пиросеквенирования либо в глотке, либо в кале были проанализированы на каждого субъекта (Таблица S1).

Данные T-RFLP были хорошо воспроизводимы на основании повторных экстракций из образцов фекалий и рестрикционных перевариваний с тремя различными рестрикционными ферментами (данные не показаны). В целом результаты T-RFLP хорошо коррелировали с результатами 454-пиросеквенирования в отношении наиболее доминирующих представителей микробиоты.Согласно базе данных RDP, наиболее доминирующими TRF (расщепление HaeIII; 272–276 п.н.) в фекальном сообществе были представители подгруппы Clostridium coccoides внутри типа Firmicutes (рисунки S1, S2 и S3). Относительное содержание этих TRF положительно сказалось у пациента D и отрицательно повлияло на пациентов E и F. Кроме того, TRF длиной 285 п.н., соответствующий Enterococcus faecalis согласно базе данных RDP, стал очень доминирующим у пациентов E и F. сразу после лечения и составлял более 20% фекальной микробиоты (Рисунки S2 и S3).

Для анализа данных пиросеквенирования сначала были определены относительные количества различных типов в контрольной группе, и эти количества использовались в качестве базовых для сравнения с субъектами в группе лечения. В микробиоте горла во всех шести образцах преобладали пять бактериальных типов; Firmicutes, представляющие 49% считываний пиросеквенирования (среднее значение для шести особей, индивидуальные значения см. В таблице S2), за которыми следуют Bacteroidetes (15%), Actinobacteria (14%), Fusobacteria (6%) и Proteobacteria (5%). (Инжир.1). В средней фекальной микробиоте во всех шести образцах преобладали четыре бактериальных типа; Firmicutes (78%), за которыми следуют Actinobacteria (14%), Bacteroidetes (3%) и Proteobacteria (2%) (рис. 2; отдельные значения см. В таблице S3). В целом, наиболее доминирующими таксономическими группами на уровне рода, обнаруженными в образцах горла, были, например, Streptococcus , Prevotella , Coprococcus , Actinomyces, и Neisseria (фиг. 3A, фиг. S4A и таблица S4). В образцах фекалий наиболее доминирующими таксономическими группами были e.грамм. Lachnospiraceae Incertae Sedis , неклассифицированные Lachnospiraceae , Bifidobacterium , Collinsella , неклассифицированные Ruminococcaceae (рис. 3B, рис. S4B, таблица S4).

Рис. 1. Распределение филы в образцах горла.

Круговые диаграммы, показывающие типы, обнаруженные в образцах горла в день 0, день 8–13, 1 и 4 года у трех контрольных (A, B и C) и трех пациентов, получавших антибиотики (D, E и F). При использовании пиросеквенирования 16S рРНК в образцах горла было обнаружено пять различных типов; Firmicutes, Proteobacteria, Actinobacteria, Bacteroidetes и Fusobacteria.

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0009836.g001

Рис. 2. Распределение типов фекалий в образцах фекалий.

Круговые диаграммы, показывающие типы, обнаруженные в образцах фекалий в день 0, день 8–13, 1 и 4 года у трех контрольных (A, B и C) и трех пациентов, леченных антибиотиками (D, E и F). При использовании пиросеквенирования 16S рРНК в образцах фекалий были обнаружены четыре различных типа; Firmicutes, Proteobacteria, Actinobacteria и Bacteroidetes.

https: // doi.org / 10.1371 / journal.pone.0009836.g002

Рис. 3. Индивидуальные ответы на антибиотики.

Тепловые карты показывают относительную численность на образец различных таксономических групп, обнаруженных в образцах горла (A) или фекалий (B) пациентов. Цветная панель показывает процент относительной численности (0–70%) различных таксономических групп в пределах основных типов (Actinobacteria, Bacteroidetes, Firmicutes, Fusobacterium и Proteobacteria), обнаруженных у пациентов в день 0 (1), день 8-13 (2) , Через 1 год (3) и через 4 года (4) после лечения.

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0009836.g003

Микробиота необработанных контролей обычно показывала более низкие вариации у отдельных людей, чем между отдельными людьми в любой период выборки, как это было установлено анализом Брея-Кертиса частот OTU ( Рис. 4 и Таблица 1), подтверждающие предыдущие сообщения о стабильной индивидуальной микробиоте кишечника [1], [23], [30], [31], [32]. Однако снижение сходства индивидуальной микробиоты кишечника с течением времени наблюдалось в контрольной группе, где более высокое сходство было обнаружено в 5 из 6 проб, собранных в дни 0 и 8-13, по сравнению с днем ​​0 и годом 4 (рис.4, таблица 1). Интересно, что состав микробиоты горла у разных людей был более схожим, что позволяет предположить, что в горле человека обнаруживается более общая и избранная микробиота. Эти данные были подтверждены с помощью анализа соответствия (CA), также основанного на частотах OTU. В анализах CA не было обнаружено зависящей от времени кластеризации для сообществ горла (фиг. 5A), однако зависящее от времени снижение сходства для контрольных образцов фекалий (фиг. 6A).

Рисунок 4. Графики корреляции для элементов управления.

Графики корреляции, показывающие частоту OTU в день 0 (ось x) и день 8–13, 1 и 4 года (ось Y) в образцах горла (A) и фекалиях (B) в контроле (A, B, и C). Значения Брея-Кертиса обозначены цифрами на рисунке в виде числа. Значение Брея-Кертиса, равное 0, предполагает, что два сайта имеют одинаковый состав, а 1 означает, что эти два сайта не имеют общих видов. Цвет точек представляет разные типы: желтый, актинобактерии; зеленый, Bacteroidetes; синий, Firmicutes; красный - Proteobacteria; серый, другие типы.На рисунках показаны проценты вариации между выборками, объясняемые двумя осями.

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0009836.g004

Рис. 5. Анализ соответствия бактериального сообщества, обнаруженного в образцах горла.

Каждый график анализа соответствий представляет значения относительной численности OTU в результате пиросеквенирования 16S рРНК в день 0, день 8-13, 1 и 4 года. A: Элементы управления; A, B и C. B: пациенты, леченные антибиотиками; D, E и F.Проценты вариации между выборками, объясненные двумя осями, показаны на рисунках. В контроле A – C и пациентах D – F третья ось представляла 25%, 27%, 26%, 22%, 24% и 20% вариации.

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0009836.g005

Рис. 6. Анализ соответствия бактериального сообщества, обнаруженного в образцах фекалий.

Каждый график анализа соответствий представляет значения относительной численности OTU в результате пиросеквенирования 16S рРНК в день 0, день 8-13, 1 и 4 года.A: Элементы управления; A, B и C. B: пациенты, леченные антибиотиками; D, E и F. Проценты вариации между выборками, объясненные двумя осями, показаны на рисунках. В контроле A – C и пациентах D – F третья ось представляла 19%, 17%, 20%, 26%, 20% и 20% вариации.

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0009836.g006

Преходящие и стойкие эффекты лечения антибиотиками

В отличие от контрольной группы, согласно анализу Брея-Кертиса, микробиота горла и фекалий у пролеченных пациентов значительно отличалась от их композиций до лечения (рис.7A и 7B) и с помощью анализа CA (рис. 5B и 6B). Образец после обработки (сразу после обработки) был отделен от образца до обработки по оси CA 1, которая описывает наибольшую вариацию во всех образцах фекалий и в двух из трех образцов из горла (фиг. 6B, 5B). Спустя один и четыре года после обработки сообщества фекальных микробов частично восстановились до композиций, которые были до обработки, однако они все еще были разделены по оси CA 2 (фиг. 6B). Снижение сходства с течением времени было особенно очевидным для фекальной микробиоты пациента F и горлового сообщества пациента E (Таблица 1).Бактериальное разнообразие (индекс разнообразия Шеннона) в образцах также снизилось сразу после обработки (Таблица S5), что также отражалось на кривых разрежения (Рисунки S5 и S6). Это снижение разнообразия было наиболее выражено в образцах фекалий. Однако в более поздние периоды отбора проб бактериальное разнообразие было более сходным с тем, которое было обнаружено до обработки (таблица S5, рисунки S5 и S6).

Рисунок 7. Графики корреляции для пациентов.

Графики корреляции, показывающие частоту OTU в день 0 (ось x), день 8–13, 1 и 4 года (ось y) в образцах глотки (A) и фекалиях (B) у пациентов (D, E и F).Значения Брея-Кертиса обозначены цифрами на рисунке. Значение Брея-Кертиса, равное 0, указывает на то, что два сайта имеют одинаковый состав, а значение 1 указывает на то, что эти два сайта не имеют общих видов. Цвета точек представляют разные типы: желтый, актинобактерии; зеленый, Bacteroidetes; синий, Firmicutes; красный - Proteobacteria; серый, другие типы.

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0009836.g007

Сразу после лечения антибиотиками в средней микробиоте горла трех пациентов, получавших лечение, в основном преобладали три типа бактерий; Firmicutes (54%), Proteobacteria (33%) и Fusobacteria (4%), тогда как в их фекальных микробных сообществах преобладали только два типа; Firmicutes (78%) и Proteobacteria (19%) (отдельные значения см. В таблицах S2 и S3).Уровни актинобактерий были особенно снижены в среде горла и кишечника у всех трех субъектов сразу после лечения антибиотиками (рис. 1 и 2, таблицы S2 и S3). Этот эффект был наиболее выражен в образцах фекалий, где большинство актинобактерий принадлежало к подклассам Actinobacteridae и Coriobacteridae. В фекалиях пациентов на 0-й день было обнаружено очень мало считываний, соответствующих Bacteroidetes, или не было их вовсе, что исключает возможность сделать выводы о влиянии лечения на этот тип.

Индивидуальность ответа на антибиотики

В дополнение к общим тенденциям изменения сообщества данные пиросеквенирования показали, что на конкретных представителей микробиоты каждого человека лечение антибиотиками по-разному влияло (рис. 3A и B), предположительно из-за их уникального состава микробиоты до лечения. В целом, таксономические группы, подвергшиеся отрицательному воздействию в образцах горла, были Actinomyces и Prevotella во всех образцах и Coprococcus в двух из трех образцов пациентов (рис.3A), тогда как таксономические группы с отрицательным воздействием в большинстве образцов фекалий были Bifidobacterium , Collinsella и Ruminococcus (рис. 3B). В связи с найденными индивидуальными ответами каждый будет отдельно обсужден в следующем разделе.

Индивидуум D. Образец глотки показал уменьшение количества представителей Firmicutes сразу после лечения до только 19% от общей микробиоты (Таблица S2). Среди Firmicutes отрицательно повлиял один род Coprococcus (относительная численность от 18% до 0%).Доминирующим типом в горле этого пациента после лечения антибиотиками были Proteobacteria (61%), а примерами положительно затронутых таксономических групп в рамках этого типа были Neisseria (от относительной численности от 1% до 29%) и неклассифицированные Enterobacteriaceae ( от относительной численности от 0% до 28%) (рис. 3А). Во время отбора проб через 1 и 4 года в микробиоте горла преобладали бактерии четырех типов: Firmicutes, Proteobacteria, Actinobacteria и Bacteriodetes.Кроме того, увеличение неклассифицированных Enterobacteriaceae сохранялось у этого пациента в течение 4-летнего периода времени (рис. 3A).

В фекалиях основным эффектом было негативное воздействие на некоторых представителей Actinobacteria, где основными таксономическими группами были Bifidobacterium и Collinsella (рис. 3B). Положительное влияние на фекалии было замечено для неклассифицированных Lachnospiraceae , относительная численность которых увеличилась с 19% до 48%.

Индивидуальный E.После лечения антибиотиками относительные уровни Firmicutes увеличились в относительной численности с 53% до 81% в образцах горла этого человека (Таблица S2). Также наблюдалось увеличение количества протеобактерий после лечения, которое сохранялось и продолжало увеличиваться с течением времени (Таблица S2). Относительная численность Neisseria также увеличилась и сохранялась через год после обработки (рис. 3A). После лечения Haemophilus и Streptococcus также увеличились с 1% до 9% и с 28% до 71%, соответственно, в сообществе (рис.3А).

В фекалиях обнаруживается Enterococcus sp. в пределах типа Firmicutes были положительно затронуты сразу после обработки (рис. 3B, рис. S2), как также видно из данных T-RFLP, и увеличилась с 0 до 28% относительной численности. Однако последовательности, соответствующие Enterococcus sp. были обнаружены в более поздние периоды отбора проб.

Индивидуум F. В образцах горла относительные количества Actinobacteria и Bacteroidetes снизились, а Fusobacteria, Proteobacteria и Firmicutes увеличились после лечения антибиотиками (Таблица S2).В пределах типов Actinobacteria и Bacteroidetes относительная численность Actinomyces и Prevotella снизилась с 10% до 0% и с 12% до 3% соответственно (рис. 3A).

В образцах фекалий Proteobacteria (род Klebsiella ) имели самую высокую относительную численность после обработки (рис. 3B). Как и у особи E, относительная численность энтерококка Enterococcus sp. увеличилась сразу после лечения антибиотиками, с 0% до 11% относительного содержания (рис.3B и рис. S3), что также наблюдалось с помощью T-RFLP, тогда как относительная численность неклассифицированного Lachnospiraceae снизилась с 29% до 0%.

Долгосрочная персистенция генов устойчивости к антибиотикам

Ген устойчивости к антибиотикам, erm (B), не был обнаружен в образцах горла у пролеченных индивидуумов до лечения в день 0 (данные не показаны). Непосредственно после лечения антибиотиками ген erm (B) колебался около исходного уровня (в пределах 8–400 раз) и сохранялся на этом уровне до 4 лет.Ген erm (B) также был обнаружен в трех контролях, проанализированных во всех случаях отбора проб, и эти уровни также варьировались относительно базовых уровней (данные не показаны).

До обработки в образцах фекалий также было низкое содержание или не обнаруживаемое количество erm (B) (данные не показаны). Ген erm (B) также оставался на уровне исходного уровня в образцах фекалий от контрольной группы, за исключением субъекта A, у которого наблюдалось заметное увеличение в образце через 1 год (рис.8А). Напротив, уровни гена erm (B) резко увеличились на 3-5 порядков у субъектов, леченных антибиотиками, сразу после лечения (фиг. 8B). Спустя 1 год уровень erm (B) все еще увеличивался более чем в 1000 раз у всех трех пациентов, и через 4 года после лечения у всех пациентов, но особенно у пациентов D и F, это сохранялось (рис. 8Б).

Рис. 8. Численность erm (B) во времени.

Нормализованное кратное увеличение erm (B) по сравнению с днем ​​0 в ДНК сообщества, выделенной из образцов фекалий, для контрольных групп (A – C), не получающих никакого лечения (A), и пациентов (D – F), получающих антибиотики (B) .Каждая столбчатая диаграмма представляет собой среднее значение и стандартную ошибку нормализованного выражения erm (B) по сравнению с 16S. Нормализация проводилась, как описано ранее [8].

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0009836.g008

Обсуждение

Мы использовали комбинацию молекулярных подходов для мониторинга экологических нарушений микробиома человека у лиц, получавших кларитромицин и метронидазол. Мы обнаружили, что лечение кларитромицином и метронидазолом оказывает долгосрочное влияние на микробиоту кишечника.Меньшее разнообразие кишечной микробиоты было обнаружено в образцах глотки и фекалий сразу после лечения. Однако количество пациентов было слишком мало, чтобы подсчитать, были ли эти наблюдения значимыми или нет. Для будущих исследований было бы полезно проанализировать больше образцов до начала лечения для каждого человека, чтобы установить лучший исходный уровень.

Предыдущие исследования с использованием подходов, основанных на культивировании, показали, что эти антибиотики оказали краткосрочное экологическое воздействие на местную микробиоту кишечника [7], [20], [21].Adamsson et al. [7] обнаружили, что количество культивируемых Bifidobacterium , Clostridium и Bacteroides spp. значительно уменьшилось в кале после лечения, в то время как количество энтерококков значительно увеличилось через неделю после лечения. Они также обнаружили стойкое уменьшение количества Bifidobacterium sp. и Bacteroides sp. 4 недели после лечения. Молекулярные подходы, которые мы использовали, позволили нам более глубоко изучить влияние лечения по сравнению с культивированием.Как описано ранее [7], мы также обнаружили относительное снижение количества представителей родов Clostridia и Bifidobacteria и увеличение количества энтерококков в образцах фекалий от обработанных лиц. Незначительные последовательности, соответствующие Bacteroidetes, были обнаружены в фекалиях, собранных у пациентов в день 0. Это могло быть связано с предвзятостью в используемом методе экстракции ДНК, хотя Bacteroidetes ранее обнаруживались в больших количествах в образцах фекалий других людей с использованием тех же методов экстракции [ 8] и протоколы амплификации [29] в нашей группе.Другая возможность состоит в том, что Bacteroidetes специфически недостаточно представлен у этих индивидуумов, поскольку ранее было показано, что этот тип имеет сильную межсубъектную изменчивость [23]. Праймеры 16S рРНК, использованные для пиросеквенирования в настоящем исследовании, были оценены в предыдущем исследовании и не показали специфической систематической ошибки в отношении Bacteroidetes [24].

Несколько недавних исследований указали на недооценку актинобактерий в фекалиях по сравнению с другими типами из-за смещения праймеров [24], [33], но праймеры, использованные в настоящем исследовании, успешно амплифицировали актинобактерии [24].Все больше данных связывают некоторых представителей актинобактерий со здоровьем человека [34], [35]. Например, увеличение количества актинобактерий недавно было связано с ожирением [36]. Хотя на сегодняшний день проведено лишь ограниченное количество исследований, вместе они подчеркивают важность более подробного изучения актинобактерий. В настоящем исследовании мы обнаружили, что количество актинобактерий значительно уменьшилось, особенно в фекалиях, благодаря широко используемому лечению антибиотиками.

Мы изучили влияние режима приема антибиотиков на микробиоту в горле, а также в кишечнике.Ротовая полость имеет большую площадь поверхности с несколькими отчетливыми нишами; согласно недавнему исследованию здоровой микробиоты на разных участках тела, каждая из них предполагает наличие определенной бактериальной микробиоты [37]. Наши результаты показывают, что микробиота горла была более схожей между людьми и более стабильной после лечения антибиотиками и в течение длительных периодов, чем микробиота кишечника, что позволяет предположить, что среда горла более избирательна для конкретной микробиоты. Другие исследования также показали, что наиболее распространенные роды в горле и ротовой полости являются представителями следующих видов: Streptococcus , Gemella , Veillonella , Actinomyces , Rothia , Neisseria и Prevotella [24] . , [37].Было показано, что микробиота полости рта очень похожа на микробиоту дистального отдела пищевода, и предполагается, что она содержит сложное, но консервативное бактериальное сообщество [26].

Эффекты лечения, которые наблюдались на бактериальных сообществах в горле и кале, могут быть связаны либо с кларитромицином, либо с метронидазолом, либо с их комбинацией. Однако есть некоторые различия в бактериях-мишенях для двух антибиотиков. Уменьшение количества актинобактерий, вероятно, связано с кларитромицином, представители которого, как известно, чувствительны к этому антибиотику [38], в то время как они от природы устойчивы к метронидазолу ((http: // www.srga.org/). Напротив, метронидазол, как известно, активен против анаэробных бактерий, и оба антибиотика активны против Streptococcus . Также важно подчеркнуть, что выведение макролидов в основном осуществляется с желчью, примерно 20–30% выводится с мочой, а остальное - с калом. 10-15% метронидазола выводится с калом, а остальное - с мочой (http://www.srga.org/).

Лечение антибиотиками по-разному влияло на местную микробиоту у отдельных субъектов, получавших лечение, вероятно, из-за известного уникального состава бактериального сообщества у разных людей [1], [23], [30], [31], [32].Мы обнаружили, что микробные сообщества были более похожи в обоих местах отбора проб у отдельных людей, чем между отдельными людьми, по крайней мере, до периода отбора образцов в один год. Этот уникальный индивидуальный состав сообщества был особенно очевиден для образцов фекалий, где наблюдались более значительные различия между людьми. Также наблюдались явные временные изменения в структуре фекального сообщества, и через четыре года кишечные сообщества разошлись как в контрольной группе, так и в группе лечения.

Недавние исследования показали, что некоторые антибиотики оказывают долгосрочное воздействие на фекальную микробиоту [8], [9], [10], [11], [17], [39], [40]. Например, лечение клиндамицином привело к снижению разнообразия Bacteroides в образцах фекалий, увеличению количества устойчивых клонов Bacteroides , в частности, B. thetaiotamicron , и увеличению устойчивости erm -генов в течение двух лет после лечения [ 8]. Долгосрочные воздействия (шесть месяцев) также недавно были замечены в микробиоте кишечника после лечения ципрофлоксацином [39].Хотя большая часть микробиоты кишечника вернулась к уровням до обработки через четыре недели, некоторые таксоны не смогли восстановиться до уровней до обработки в течение периодов до 6 месяцев.

Еще одним четким признаком стойкого воздействия лечения антибиотиками на микробиоту кишечника было заметное повышение уровня гена erm (B) в образцах фекалий, которое сохранялось до четырех лет после лечения. Увеличение и устойчивость erm (B) может быть объяснено либо клональной экспансией стабильных, устойчивых изолятов, изначально присутствующих при предварительной обработке кишечной микробиоты, либо приобретением erm (B) новыми популяциями посредством горизонтального переноса генов.Было показано, что эпидемическое распространение erm (B) является причиной повышенной устойчивости к макролидам у Streptococcus pyogenes [41]. Наши результаты предполагают связь между уровнями гена erm (B) и увеличением количества энтерококков после лечения, указывая на то, что энтерококки могут быть носителями устойчивости к антибиотикам. Ранее сообщалось, что энтерококки с высокой макролидорезистентностью отбираются при лечении кларитромицином и метронидазолом, о чем свидетельствует повышение уровней erm (B) в культивируемых энтерококках после лечения [10].Один устойчивый клон сохранялся в течение трех лет без дальнейшего давления антибиотиков [10].

Это одно из первых, насколько нам известно, исследований, в которых тщательно прослеживается динамика микробиоты горла с течением времени у здоровых людей и после лечения антибиотиками. Недавно сообщалось, что при лечении кларитромицином отбираются устойчивые к макролидам бактерии в микробиоте горла [17], что подтверждает результаты, которые мы представляем здесь. Интересно, что мы обнаружили, что erm (B) был обнаружен в образцах горла как у пациентов, так и у контрольной группы в настоящем исследовании, хотя и не в большом количестве в контроле.Обнаружение низких уровней erm (B) в контрольных образцах можно объяснить предыдущим воздействием макролидов перед включением в исследование.

В заключение, обычный однонедельный режим противомикробного лечения кларитромицином и метронидазолом привел к заметным экологическим нарушениям в микробиоте горла и кишечника с потенциальными долгосрочными последствиями. Молекулярные подходы, которые мы использовали, позволили более детально отслеживать экологические нарушения из-за лечения антибиотиками, что ранее было возможно с использованием традиционных методов культивирования.В целом, наблюдения в настоящем исследовании подчеркивают важность ограничительного и правильного использования антибиотиков для предотвращения долгосрочных экологических нарушений местной микробиоты. В больничных условиях пониженная устойчивость к колонизации и постоянство устойчивости к антибиотикам могут потенциально привести к чрезмерному росту и распространению мультирезистентных потенциальных патогенных бактерий и, таким образом, увеличить риск неудачи лечения.

Материалы и методы

Заявление об этике

Письменное согласие было получено от всех участников, участвовавших в исследовании, и исследование было одобрено письменным согласием комитетом по этике человека Упсальского университета, Упсала, Швеция.

Предметы и лечение

В это исследование были включены шесть человек: три пациента из контрольной группы (A, B и C), далее называемые контрольной группой, с диагностированными диспепсическими расстройствами, которые не получали никакого лечения, и три пациента (D, E и F), которые имели язвы желудка или двенадцатиперстной кишки, и их лечили дважды в день в течение семи дней метронидазолом 400 мг, кларитромицином 250 мг и омепразолом 20 мг (дополнительная информация о пациенте в таблице S6). Ни один из пациентов не получал никакого лечения антибиотиками в течение четырех недель до начала исследования, а в течение четырехлетнего курса исследования никакое другое противомикробное лечение не разрешалось.Перед включением в исследование пациенты не получали никаких диетических ограничений или рекомендаций. Мазок из зева и образец фекалий собирали у каждого субъекта за день до лечения, сразу после (контроль A: 13 дней, контроль B: 12 ​​дней, контроль C: 13 дней, пациент D: 12 дней, пациент E: 8 дней, пациент F: 10-й день) и через один и четыре года после лечения. Все образцы хранили при -70 ° C до анализа. Этот материал был частью более крупного продольного когортного исследования, целью которого было изучение ликвидации H.pylori по стандартной схеме лечения [11].

Извлечение ДНК

ДНК было выделено из 250–500 мкл образцов горла каждого субъекта. Образцы из горла разбавляли (1-1) в 20 мМ трис-HCl (pH 8,0) и 2 мМ натрий-EDTA-буфере и центрифугировали в течение 10 мин при 5000 × g. Образцы лизировали в 180 мкл лизоцимного буфера (20 мМ Трис-HCl, pH 8,0, 2 мМ EDTA натрия, 1,2% Triton X-100 и 20 мг / мл лизоцима (Sigma-Aldrich, Schnelldorf, Германия) и инкубировали при 37 ° C). ° C в течение 1 ч. Добавляли протеиназу K и 200 мкл буфера AL из набора Qiagen DNeasy Tissue (Qiagen, Hilden, Германия), и смесь инкубировали при 56 ° C в течение 16 часов с последующей экстракцией ДНК с использованием набора Qiagen DNeasy Tissue Kit (Qiagen ) в соответствии с инструкциями производителя.ДНК экстрагировали из дубликатов 100 мг фекалий каждого субъекта с использованием набора FastDNA SPIN для почвы (BIO 101, Карлсбад, Калифорния) в соответствии с инструкциями производителя. Этап взбивания шариков выполняли в приборе FastPrep (BIO 101) 2 раза по 20 с на скорости 5,5.

Пиросеквенирование метки 16S рРНК

Гены 16S рРНК амплифицировали в 50 мкл реакции, содержащей 1X ПЦР-буфер, смесь ДНК-полимеразы dNTP PurePeak 200 мкМ (Pierce Nucleic Acid Technologies, Милуоки, Висконсин, США), 500 мкМ каждого праймера (SGS, Копинг, Швеция) и 2.5 ед. ДНК-полимеразы высокой точности PfuUltra (Stratagene La Jolla, CA, USA). Используемые пары праймеров, нацеленные на область V6 гена 16S рРНК, представляли собой 784f с адаптером B и 1061r с адаптером A и штрих-кодами последовательностей, специфичных для образца (последовательности праймера, адаптера и штрих-кода см. В дополнительной таблице S7) [24]. К каждой реакции добавляли 1 мкл экстрагированной матричной ДНК. Используемые условия ПЦР: 95 ° C в течение 5 минут, 25 циклов 95 ° C в течение 40 секунд, 55 ° C в течение 40 секунд и 72 ° C в течение 1 минуты, а затем 72 ° C в течение 7 минут.Для каждого образца проводили три реакции амплификации, а затем объединяли их вместе. Продукты ПЦР с проксимальной длиной 300 п.н. вырезали из 1% агарозного геля, окрашенного бромистым этидием, и очищали с использованием набора для экстракции геля QIAquick (Qiagen). Концентрацию и качество ДНК оценивали на Bioanalyzer 2100 (Agilent, Пало-Альто, Калифорния, США) с использованием лабораторного чипа DNA1000 (Agilent). Равные количества ДНК четырех образцов с различными последовательностями штрих-кода, специфичными для каждого образца, объединяли до конечной концентрации 10 нг / мкл.Объединенные ДНК амплифицировали в эмульсиях смеси ПЦР в масле и секвенировали на разных дорожках 16-полосного планшета PicoTiterPlate на системе Genome Sequencer FLX (Roche, Базель, Швейцария) в Шведском институте контроля инфекционных заболеваний (Сольна, Швеция). ). В дополнение к стандартной фильтрации качества последовательности, применяемой программным обеспечением прибора, были удалены считывания пиросеквенирования, которые: 1) не включали правильную последовательность праймера, 2) были короче 200 п.н. (исключая последовательность праймера) и 3) включали любые неоднозначные основания.Полученные считывания окончательно обрезали до 200 п.н. (без праймера).

Таксономическая классификация

Урезанные чтения пиросеквенирования 200 п.н. были выровнены и кластеризованы в операционные таксономические единицы (OTU) с полной кластеризацией сцепления на максимальном расстоянии внутри кластера 3% с использованием конвейера пиросеквенирования RDP (http://rdp.cme.msu.edu/) . Наиболее распространенная последовательность 454 (по одной на группу идентичных последовательностей) в одной OTU была исследована методом BLAST с параметрами по умолчанию в локальной базе данных, содержащей 269420 почти полноразмерных последовательностей бактериального гена 16S рРНК из проекта Ribosomal Database Project (RDP) v.10,7 [42]. Последовательности унаследовали таксономическую аннотацию (вплоть до уровня рода) наилучшего результата RDP, удовлетворяющего критериям идентичности ≥95% при выравнивании длиной ≥180 п.н. Если такого совпадения не обнаружено, последовательность классифицируется как «нет совпадения». Подробности относительно дизайна праймеров можно найти в предыдущей публикации [24]. Анализ редкой фракции горла и микробиоты фекалий проводили с использованием Analytical Rarefraction 1.3 (http://www.uga.edu/strata/software/).

Т-RFLP

гена 16S рРНК амплифицировали в экстрактах ДНК с использованием праймеров эубактерий fD1-FAM [43], меченных на 5'-конце 6-карбоксифлуресцеином и 926r [44] (последовательности праймеров см. В дополнительной таблице S8).Все праймеры были синтезированы компанией Invitrogen (Карлсбад, Калифорния). Амплификацию проводили в реакционной смеси объемом 50 мкл, содержащей 2,5 ед. ДНК-полимеразы Taq (Amersham Biosciences, Уппсала, Швеция), 1X буфер для ПЦР (Amersham Biosciences), 0,7 мкмоль каждого праймера, 10 нмоль каждого дезоксинуклеозидтрифосфата (Amersham Pharmacia Biotech), 2,5 мкл диметилсульфоксида, стерильная дистиллированная вода и 1 мкл матричной ДНК. Программу циклов выполняли в термоциклере Perkin-Elmer GeneAmp PCR system 2400 в следующих условиях: 95 ° C в течение 5 минут, затем 25 циклов при 95 ° C в течение 40 секунд, 55 ° C в течение 40 секунд и 72 ° C в течение 1 минута.Последний цикл завершился этапом удлинения на 7 мин. Расщепление рестриктазами, условия электрофореза и расчеты выполняли, как описано ранее [29].

ПЦР в реальном времени

Обилие генов erm (B) было проанализировано в образцах глотки и фекалий. Ген 16S рРНК использовали в качестве контрольного гена. Праймеры и зонды были сконструированы с использованием программного обеспечения Primer Express 2.0 (ABI). Ген erm (B) амплифицировали с использованием erm Bf / erm Br и зонда Taq Man (ABI).Гены 16S рРНК амплифицировали с использованием 16Sf / 16Sr и зонда Taq Man. Флуоресцентный репортерный краситель на 5'-конце зонда представлял собой 6-FAM; гаситель на 3'-конце был гасителем-1 для черной дыры (BHQ-1). Последовательности праймеров и зондов см. В дополнительной таблице S8. Все праймеры были синтезированы с использованием Invitrogen (Карлсбад, Калифорния), а зонды были синтезированы с использованием Thermo Electron GmbH (Ульм, Германия). Программа циклирования выполнялась на ABI Prism 7900HT (ABI) в следующих условиях: 2 мин при 50 ° C, 10 мин при 95 ° C, затем 40 циклов по 15 с при 94 ° C и 1 мин при 60 ° C. .Смесь ПЦР без ДНК-матрицы включали в каждый цикл в качестве отрицательного контроля. Результаты анализировали с помощью программного обеспечения SDS 2.1 (ABI). В настоящем исследовании мы нормализовали количество копий гена erm (B) на количество копий 16S, а построение кривых и расчеты проводили, как описано ранее [8].

Статистический анализ и оценка разнообразия

Индекс разнообразия Шеннона рассчитывался как −Σ log (p i ) p i [45], где p i обозначает частоту филотипа.Значимость проверялась с помощью t-критерия Вилкоксона в программе R (http://www.r-project.org/). Сходство Брея-Кертиса также рассчитывали с использованием программного обеспечения R. Анализ соответствия (CA) был выполнен на данных пиросеквенирования с использованием интерфейса General Rweb (http://pbil.univ-lyon1.fr/Rweb/). В расчетах использовались значения относительной численности каждой OTU, и были построены диаграммы разброса. 454 последовательности из образцов были сгруппированы в TMEV (http://www.tm4.org/mev.html).

Дополнительная информация

Рисунок S1.

Пики T-RFLP в образце кала пациента D. Значения относительной численности СКР, полученные с использованием общих праймеров эубактериальной 16S рРНК fD1 и 926r и рестрикционного переваривания Hae III для пациента D. TRF размером 273 п.н. представляет членов подгруппы Clostridium coccoides , таких как Clostridium clostridiiforme ATCC Eubacterium formicigenerans ATCC 27755 и TRF длиной 275 п.н. представляют Eubacterium ramulus ATCC 29099, Eubacterium rectale ATCC 33656, Eubacterium ventriosum ATCC 336560 и 90c158ola ceburia

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0009836.s001

(0,81 МБ TIF)

Рисунок S2.

Пики T-RFLP в образце кала пациента E. Значения относительной численности СКР, полученные с использованием общих праймеров эубактериальной 16S рРНК fD1 и 926r и Hae III, рестрикционного переваривания у пациента E. TRF размером 273 п.н. представляет членов подгруппы Clostridium coccoides , таких как Clostridium clostridiiforme ATCC Eubacterium formicigenerans ATCC 27755 и TRF длиной 275 п.н. представляют Eubacterium ramulus ATCC 29099, Eubacterium rectale ATCC 33656, Eubacterium ventriosum ATCC 336560 и 90c158ola ceburiaTRF длиной 285 п.н. представляет собой Enterococcus faecalis .

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0009836.s002

(0,34 МБ TIF)

Рисунок S3.

Пики T-RFLP в образце кала пациента F. Значения относительной численности СКР, полученные с использованием общих праймеров эубактериальной 16S рРНК fD1 и 926r и Hae III, рестрикционного переваривания у пациента F. TRF длиной 273 п.н. представляет членов подгруппы Clostridium coccoides , таких как Clostridium clostridiiforme ATCC Eubacterium formicigenerans ATCC 27755 и TRF длиной 275 п.н. представляют Eubacterium ramulus ATCC 29099, Eubacterium rectale ATCC 33656, Eubacterium ventriosum ATCC 336560 и 90c158ola ceburiaTRF длиной 285 п.н. представляет собой Enterococcus faecalis . TRF длиной 242 п.н. не был идентифицирован.

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0009836.s003

(0,36 МБ TIF)

Рисунок S4.

Таксономические группы, обнаруженные в образцах глотки или фекалий. Тепловые карты показывают относительную численность на образец различных таксономических групп, обнаруженных в контрольных образцах горла или фекалий. Цветная панель показывает процент относительной численности (0–70%) различных таксономических групп в пределах основных типов (Actinobacteria, Bacteroidetes, Firmicutes, Fusobacterium и Proteobacteria), обнаруженных в образцах глотки (A) и фекалиях (B) от контрольных образцов в определенные моменты времени. : день 0 (1), день 8–13 (2), 1 год (3) и 4 года (4).

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0009836.s004

(0,20 МБ TIF)

Рисунок S5.

Анализ редких фракций проб из горла. Количество выбранных филотипов как функция количества считываний в контроле (A – C) и пациентах (D – F). Временные точки отбора проб: A = День 0, B = День 8–13, C = 1 год, D = 4 года.

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0009836.s005

(0,45 МБ TIF)

Рисунок S6.

Анализ образцов кала на редкость.Количество выбранных филотипов как функция количества считываний в контроле (A – C) и пациентах (D – F). Временные точки отбора проб: A = День 0, B = День 8–13, C = 1 год, D = 4 года.

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0009836.s006

(0,44 МБ TIF)

Таблица S2.

Индивидуальные значения относительной численности (%) для доминирующих типов, обнаруженные в образцах горла с течением времени. Последовательности унаследовали таксономическую аннотацию (до уровня рода) и лучший результат RDP, удовлетворяющий критериям идентичности ≥95% при выравнивании длиной ≥180 п.н.Если такого не было, последовательность классифицируется как «нет совпадений».

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0009836.s008

(0,05 МБ DOC)

Таблица S3.

Индивидуальные значения относительной численности (%) для доминирующих типов, обнаруженные в образцах фекалий с течением времени. Последовательности унаследовали таксономическую аннотацию (до уровня рода) и лучший результат RDP, удовлетворяющий критериям идентичности ≥95% при выравнивании длиной ≥180 п.н. Если такого не было, последовательность классифицируется как «нет совпадений».

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0009836.s009

(0,04 МБ DOC)

Таблица S4.

Доминирующие таксономические группы, обнаруженные в образцах горла и фекалий. Относительная численность (в процентах) 20 наиболее доминирующих таксономических групп, обнаруженных в образцах горла и фекалий, соответственно. Суммировали численность всех OTU, принадлежащих к одному роду или неклассифицированных на одном таксономическом уровне.

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0009836.s010

(0.04 МБ DOC)

Таблица S5.

Оценка разнообразия. Индекс разнообразия Шеннона был рассчитан на основе частоты OTU. После лечения антибиотиками индекс разнообразия снизился на 8-13 день как в пробах из горла, так и в фекалиях, в то время как он оставался стабильным в пределах контроля в течение всего периода времени.

https://doi.org/10.1371/journal.pone.0009836.s011

(0,04 МБ DOC)

Вклад авторов

Задумал и спроектировал эксперименты: HJ CJ JKJ LE.Проведены эксперименты: HJ. Проанализированы данные: HJ CJ AFA JKJ LE. Предоставленные реагенты / материалы / инструменты анализа: LE. Написал статью: HJ CJ MSK JKJ LE.

Список литературы

  1. 1. Костелло Е.К., Лаубер С.Л., Хамади М., Фирер Н., Гордон Дж. И. и др. (2009) Изменчивость бактериального сообщества в среде обитания человеческого тела в пространстве и времени. Science 326: 1694–1697.
  2. 2. Гибсон Г.Р., Роберфроид М.Б. (1995) Диетическая модуляция микробиоты толстой кишки человека: введение концепции пребиотиков.J Nutr 125: 1401–1412.
  3. 3. Gill SR, Pop M, Deboy RT, Eckburg PB, Turnbaugh PJ и др. (2006) Метагеномный анализ микробиома дистального отдела кишечника человека. Наука 312: 1355–1359.
  4. 4. Round JL, Mazmanian SK (2009) Микробиота кишечника формирует иммунные реакции кишечника во время здоровья и болезни. Nat Rev Immunol.
  5. 5. Guarner F (2006) Кишечная флора в состоянии здоровья и болезней. Пищеварение 73: Suppl 15–12.
  6. 6. Hooper LV (2004) Вклад бактерий в развитие кишечника млекопитающих.Trends Microbiol 12: 129–134.
  7. 7. Adamsson I, Nord CE, Lundquist P, Sjostedt S, Edlund C (1999) Сравнительные эффекты омепразола, амоксициллина плюс метронидазола по сравнению с омепразолом, кларитромицином плюс метронидазолом на микрофлору полости рта, желудка и кишечника у пациентов, инфицированных Helicobacter pylori. J Antimicrob Chemother 44: 629–640.
  8. 8. Jernberg C, Lofmark S, Edlund C, Jansson JK (2007) Долгосрочное экологическое воздействие введения антибиотиков на микробиоту кишечника человека.Isme J 1: 56–66.
  9. 9. Sjölund M, Tano E, Blaser MJ, Andersson DI, Engstrand L (2005) Устойчивость резистентного эпидермального стафилококка после однократного курса кларитромицина. Emerg Infect Dis 11: 1389–1393.
  10. 10. Sjölund M, Wreiber K, Andersson DI, Blaser MJ, Engstrand L (2003) Долгосрочное сохранение устойчивых видов Enterococcus после антибиотиков для уничтожения Helicobacter pylori. Ann Intern Med 139: 483–487.
  11. 11. Jakobsson H, Wreiber K, Fall K, Fjelstad B, Nyren O и др.(2007) Устойчивость к макролидам нормальной микробиоты после лечения Helicobacter pylori. Scand J Infect Dis 39: 757–763.
  12. 12. Sullivan A, Edlund C, Nord CE (2001) Влияние противомикробных агентов на экологический баланс микрофлоры человека. Lancet Infect Dis 1: 101–114.
  13. 13. Курвалин П. (1994) Перенос генов устойчивости к антибиотикам между грамположительными и грамотрицательными бактериями. Антимикробные агенты Chemother 38: 1447–1451.
  14. 14.Грэм Д.Ю. (2000) Терапия Helicobacter pylori: текущее состояние и проблемы. Гастроэнтерология 118: S2–8.
  15. 15. de Boer WA, Tytgat GN (2000) Регулярный обзор: лечение инфекции Helicobacter pylori. Bmj 320: 31–34.
  16. 16. Данн Б.Е., Коэн Х., Блазер М.Дж. (1997) Helicobacter pylori. Clin Microbiol Rev 10: 720–741.
  17. 17. Jönsson M, Qvarnström Y, Engstrand L, Swedberg G (2005) Лечение кларитромицином отбирает устойчивые макролидорезистентные бактерии в комменсальной флоре горла.Int J Antimicrob Agents 25: 68–74.
  18. 18. Roberts MC (2008) Обновленная информация о генах устойчивости к макролидам, линкозамиду, стрептограмину, кетолидам и оксазолидинонам. FEMS Microbiol Lett 282: 147–159.
  19. 19. Портильо А., Руис-Ларреа Ф., Заразага М., Алонсо А., Мартинес Дж. Л. и др. (2000) Гены устойчивости к макролидам Enterococcus spp. Антимикробные агенты Chemother 44: 967–971.
  20. 20. Buhling A, Radun D, ​​Muller WA, Malfertheiner P (2001) Влияние тройной терапии против Helicobacter метронидазолом, омепразолом и кларитромицином на микрофлору кишечника.Aliment Pharmacol Ther 15: 1445–1452.
  21. 21. Танака Дж., Фукуда Й., Шинтани С., Хори К., Томита Т. и др. (2005) Влияние противомикробного лечения инфекции Helicobacter pylori на микрофлору кишечника японских макак. J Med Microbiol 54: 309–314.
  22. 22. Суау А., Боннет Р., Сутрен М., Годон Дж. Дж., Гибсон Г. Р. и др. (1999) Прямой анализ генов, кодирующих 16S рРНК из сложных сообществ, обнаруживает множество новых молекулярных видов в кишечнике человека.Appl Environ Microbiol 65: 4799–4807.
  23. 23. Eckburg PB, Bik EM, Bernstein CN, Purdom E, Dethlefsen L, et al. (2005) Разнообразие кишечной микробной флоры человека. Наука 308: 1635–1638.
  24. 24. Андерссон А.Ф., Линдберг М., Якобссон Х., Бэкхед Ф., Найрен П. и др. (2008) Сравнительный анализ микробиоты кишечника человека с помощью пиросеквенирования со штрих-кодом. PLoS ONE 3: e2836.
  25. 25. Ley RE, Peterson DA, Gordon JI (2006) Экологические и эволюционные силы, формирующие микробное разнообразие в кишечнике человека.Ячейка 124: 837–848.
  26. 26. Пей З., Бини Э.Дж., Ян Л., Чжоу М., Франсуа Ф. и др. (2004) Бактериальная биота в дистальном отделе пищевода человека. Proc Natl Acad Sci U S A 101: 4250–4255.
  27. 27. Бик Э.М., Экбург П.Б., Гилл С.Р., Нельсон К.Э., Пурдом Э.А. и др. (2006) Молекулярный анализ бактериальной микробиоты в желудке человека. Proc Natl Acad Sci U S A 103: 732–737.
  28. 28. Franks AH, Harmsen HJ, Raangs GC, Jansen GJ, Schut F, et al. (1998) Вариации бактериальных популяций в человеческих фекалиях, измеренные флуоресцентной гибридизацией in situ с группоспецифичными олигонуклеотидными зондами, нацеленными на 16S рРНК.Appl Environ Microbiol 64: 3336–3345.
  29. 29. Jernberg C, Sullivan A, Edlund C, Jansson JK (2005) Мониторинг вызванных антибиотиками изменений в микрофлоре кишечника человека и обнаружение пробиотических штаммов с использованием полиморфизма длины терминального рестрикционного фрагмента. Appl Environ Microbiol 71: 501–506.
  30. 30. Donskey CJ, Hujer AM, Das SM, Pultz NJ, Bonomo RA и др. (2003) Использование денатурирующего градиентного гель-электрофореза для анализа микробиоты стула госпитализированных пациентов.J Microbiol Methods 54: 249–256.
  31. 31. Tannock GW, Munro K, Harmsen HJ, Welling GW, Smart J и др. (2000) Анализ фекальной микрофлоры людей, потребляющих пробиотический продукт, содержащий Lactobacillus rhamnosus DR20. Appl Environ Microbiol 66: 2578–2588.
  32. 32. Zoetendal EG, Akkermans AD, De Vos WM (1998) Анализ гель-электрофореза в градиенте температуры 16S рРНК из образцов фекалий человека выявляет стабильные и специфичные для хозяина сообщества активных бактерий.Appl Environ Microbiol 64: 3854–3859.
  33. 33. Крогиус-Курикка Л., Кассинен А., Паулин Л., Корандер Дж., Макивуокко Х. и др. (2009) Анализ последовательности процентных библиотек фракций G + C фекальной бактериальной ДНК человека показывает большое количество актинобактерий. BMC Microbiol 9: 68
  34. 34. Кассинен А., Крогиус-Курикка Л., Макивуокко Х., Ринттила Т., Паулин Л. и др. (2007) Каловая микробиота пациентов с синдромом раздраженного кишечника значительно отличается от таковой здоровых людей.Гастроэнтерология 133: 24–33.
  35. 35. Мур В.Е., Мур Л.Х. (1995) Флора кишечника популяций с высоким риском рака толстой кишки. Appl Environ Microbiol 61: 3202–3207.
  36. 36. Тернбо П.Дж., Хамади М., Яцуненко Т., Кантарел Б.Л., Дункан А. и др. (2009) Основной микробиом кишечника у тучных и худых близнецов. Природа 457: 480–484.
  37. 37. Aas JA, Paster BJ, Stokes LN, Olsen I, Dewhirst FE (2005) Определение нормальной бактериальной флоры полости рта.J Clin Microbiol 43: 5721–5732.
  38. 38. Уильямс Дж. Д., Маскелл Дж. П., Шайн Х, Хрисос Дж., Сефтон А. М. и др. (1992) Сравнительная активность азитромицина, макролидов (эритромицин, кларитромицин и спирамицин) и стрептограмина RP 59500 против пероральных организмов in vitro. J Antimicrob Chemother 30: 27–37.
  39. 39. Dethlefsen L, Huse S, Sogin ML, Relman DA (2008) Распространенные эффекты антибиотика на микробиоту кишечника человека, выявленные глубоким секвенированием 16S рРНК.PLoS Biol 6: e280.
  40. 40. Löfmark S, Jernberg C, Jansson JK, Edlund C (2006) Обогащение, вызванное клиндамицином, и долгосрочное сохранение устойчивых Bacteroides spp. и гены устойчивости. J Antimicrob Chemother 58: 1160–1167.
  41. 41. Крести С., Латтанци М., Занчи А., Монтаньяни Ф., Поллини С. и др. (2002) Детерминанты устойчивости и клональное разнообразие стрептококков группы А, собранных в период повышения устойчивости к макролидам. Антимикробные агенты Chemother 46: 1816–1822.
  42. 42. Коул Дж. Р., Чай Б., Фаррис Р. Дж., Ван К., Кулам-Сайед-Мохидин А. С. и др. (2007) Проект базы данных рибосом (RDP-II): внедрение пространства myRDP и общедоступных данных с контролируемым качеством. Нуклеиновые кислоты Res 35: D169–172.
  43. 43. Weisburg WG, Barns SM, Pelletier DA, Lane DJ (1991) амплификация рибосомной ДНК 16S для филогенетического исследования. J Bacteriol 173: 697–703.
  44. 44. Muyzer G, de Waal EC, Uitterlinden AG (1993) Профилирование сложных микробных популяций с помощью анализа денатурирующего градиентного гель-электрофореза генов, амплифицированных полимеразной цепной реакцией, кодирующих 16S рРНК.Appl Environ Microbiol 59: 695–700.
  45. 45. Хайек LCaMAB (1996) Исследование природных популяций. Нью-Йорк: издательство Колумбийского университета.

Устойчивость к антибиотикам и риски для здоровья человека

Антибиотики обеспечивают эффективное лечение самых разных инфекций и болезней. К сожалению, устойчивость к антибиотикам затрудняет лечение этих заболеваний. Это также создает нагрузку на систему здравоохранения из-за увеличения количества госпитализаций и дорогостоящего лечения.Многие люди подвергаются риску, особенно те, кто находится в учреждениях длительного ухода или у которых ослаблена иммунная система.

На этой странице

Риски для здоровья человека

Устойчивость к антибиотикам - проблема общественного здравоохранения во всем мире. Число бактерий, устойчивых к антибиотикам, увеличивается.

Опасность устойчивости к антибиотикам заключается в том, что излечимые болезни, такие как пневмония, туберкулез или незначительные инфекции, могут стать неизлечимыми. Это станет большим экономическим и эмоциональным бременем для семей и нашей системы здравоохранения.

Устойчивость к антибиотикам приводит к снижению способности лечить инфекции и болезни у людей, животных и растений. Это может привести к следующим проблемам:

  • рост человеческих болезней, страданий и смертей,
  • увеличила стоимость и продолжительность лечения, а
  • усиление побочных эффектов от использования нескольких и более сильных лекарств.

Инфекции, вызванные устойчивыми бактериями, могут быть устойчивыми к нескольким антибиотикам.Разрабатывается несколько новых антибиотиков. Поэтому важно, чтобы все канадцы помогали поддерживать эффективность имеющихся у нас антибиотиков. Мы можем сделать это за счет ответственного использования антибиотиков, а также предотвращения инфекций и борьбы с ними.

Кто подвергается наибольшему риску

В целом, определенные группы людей имеют повышенный риск заражения инфекциями. Это означает, что они также подвержены повышенному риску устойчивости к антибиотикам.

В группы риска входят:

  • младенцы, особенно недоношенные, так как у них может не быть сильной иммунной системы;
  • пожилых людей, особенно проживающих в учреждениях длительного ухода или в общежитиях для пожилых людей.Это потому, что они:
    • могут быть подвержены большему количеству инфекций, чем средний человек,
    • находятся в тесном контакте со многими другими, а
    • У
    • может быть ослабленная иммунная система из-за болезни или длительного приема антибиотиков.
  • бездомных, живущих в тесноте или в антисанитарных условиях, где легко заразиться инфекциями, и
  • человек.
  • человек с ослабленной иммунной системой в результате болезни или травмы.

Группы риска, основанные на поведении и настройках, включают:

  • человек в медицинских учреждениях и детских садах или в других местах, где инфекции могут легко распространяться, особенно при несоблюдении мер профилактики и контроля инфекций,
  • человек, которые не практикуют надлежащие меры профилактики и контроля инфекций, такие как гигиена рук,
  • человек, которые не хранят, не обрабатывают и не готовят пищу безопасно,
  • человек, чьи профессии подвергают их большему риску заражения бактериями или инфекционными заболеваниями, такими как:
    • врачей,
    • медсестер,
    • ветеринаров,
    • рабочих скотобойни и мясокомбинатов,
    • фермеров.

Понимание влияния воздействия антибиотиков на микробиом человека | Геномная медицина

  • 1.

    Линч С.В., Педерсен О. Микробиом кишечника человека в здоровье и болезнях. N Engl J Med. 2016; 375 (24): 2369–79.

    CAS PubMed Google ученый

  • 2.

    Кау А.Л., Ахерн П.П., Гриффин Н.В., Гудман А.Л., Гордон Дж. Питание человека, микробиом кишечника и иммунная система.Природа. 2011. 474 (7351): 327–36.

    CAS PubMed PubMed Central Google ученый

  • 3.

    Дэвид Л.А., Морис К.Ф., Кармоди Р.Н., Гутенберг Д.Б., Баттон Дж. Э., Вулф Б. Э. и др. Диета быстро и воспроизводимо изменяет микробиом кишечника человека. Природа. 2014. 505 (7484): 559–63.

    CAS PubMed Google ученый

  • 4.

    Sharon G, Sampson TR, Geschwind DH, Mazmanian SK.Центральная нервная система и микробиом кишечника. Клетка. 2016; 167 (4): 915–32.

    CAS PubMed PubMed Central Google ученый

  • 5.

    Стокгольм Дж., Блазер М.Дж., Торсен Дж., Расмуссен М.А., Вааге Дж., Виндинг Р.К. и др. Созревание микробиома кишечника и риск астмы в детстве. Nat Commun. 2018; 9 (1): 141.

    PubMed PubMed Central Google ученый

  • 6.

    Вальдес А.М., Уолтер Дж., Сигал Э., Спектор Т.Д. Роль микробиоты кишечника в питании и здоровье. BMJ. 2018; 361: к2179.

    PubMed PubMed Central Google ученый

  • 7.

    Ллойд-Прайс Дж., Арз К., Анантакришнан А.Н., Ширмер М., Авила-Пачеко Дж., Пун Т.В. и др. Многокомпонентность микробной экосистемы кишечника при воспалительных заболеваниях кишечника. Природа. 2019; 569 (7758): 655–62.

    CAS PubMed PubMed Central Google ученый

  • 8.

    Tasnim N, Abulizi N, Pither J, Hart MM, Gibson DL. Связь микробной экосистемы кишечника с окружающей средой: зависит ли здоровье кишечника от того, где мы живем? Front Microbiol. 2017; 8: 1935.

    PubMed PubMed Central Google ученый

  • 9.

    Сталдер Т., Пресс М.О., Салливан С., Лячко И., Топ Е.М. Связывание резистома и плазмидома с микробиомом. ISME J. 2019; 13 (10): 2437–46.

    PubMed PubMed Central Google ученый

  • 10.

    Крофтс Т.С., Гаспаррини А.Дж., Дантас Г. Подходы нового поколения к пониманию и борьбе с резистомом к антибиотикам. Обзоры природы микробиологии. 2017; 15 (7): nrmicro.2017.28.

  • 11.

    Truong DT, Franzosa EA, Tickle TL, Scholz M, Weingart G, Pasolli E, et al. MetaPhlAn2 для расширенного метагеномного таксономического профилирования. Нат методы. 2015; 12 (10): 902-3-3.

    CAS PubMed Google ученый

  • 12.

    Каллахан Б.Дж., Макмерди П.Дж., Розен М.Дж., Хан А.В., Джонсон А.Дж., Холмс С.П.DADA2: вывод образца с высоким разрешением из данных ампликона Illumina. Природные методы. 2016; 13 (7): nmeth.3869.

  • 13.

    Wood DE, Lu J, Langmead B. Улучшенный метагеномный анализ с Kraken 2. Genome Biol. 2019; 20 (1): 257.

    CAS PubMed PubMed Central Google ученый

  • 14.

    Browne HP, Forster SC, Anonye BO, Kumar N, Neville BA, Stares MD, et al. Культивирование «некультивируемой» микробиоты человека обнаруживает новые таксоны и обширное спороношение.Природа. 2016; 533 (7604): 543–6.

    CAS PubMed PubMed Central Google ученый

  • 15.

    Соммер МО, Чёрч Г.М., Дантас Г. Микробиом человека содержит разнообразный резервуар генов устойчивости к антибиотикам. Вирулентность. 2010. 1 (4): 299–303.

    PubMed Google ученый

  • 16.

    Камински Дж., Гибсон М.К., Франзоза Е.А., Сегата Н., Дантас Дж., Хаттенхауэр С. Высокоспецифичное целевое функциональное профилирование микробных сообществ с помощью ShortBRED.PLoS Comput Biol. 2015; 11 (12): e1004557.

    PubMed PubMed Central Google ученый

  • 17.

    Franzosa EA, McIver LJ, Rahnavard G, Thompson LR, Schirmer M, Weingart G, et al. Функциональное профилирование метагеномов и метатранскриптомов на уровне видов. Нат Методы 2018; 15 (11): 962-8-8.

  • 18.

    Гибсон М.К., Форсберг К.Дж., Дантас Г. Улучшенная аннотация детерминант устойчивости к антибиотикам позволяет выявить кластер микробной резистентности по экологии.ISME J. 2015; 9 (1): 207–16.

    CAS PubMed Google ученый

  • 19.

    Дуррант М.Г., Ли М.М., Сираносиан Б.А., Монтгомери С.Б., Бхатт А.С. Биоинформатический анализ интегративных мобильных генетических элементов подчеркивает их роль в адаптации бактерий. Клеточный микроб-хозяин. 2020; 27 (1): 140–53 e9.

    CAS PubMed Google ученый

  • 20.

    Сберро Х., Фремин Б.Дж., Злитни С., Эдфорс Ф., Гринфилд Н., Снайдер М.П. и др.Масштабный анализ микробиомов человека позволяет выявить тысячи мелких. Novel Genes Cell. 2019; 178 (5): 1245–59 e14.

    CAS PubMed Google ученый

  • 21.

    Гилберт Дж. А., Блазер М. Дж., Капорасо Дж. Г., Янссон Дж. К., Линч С. В., Найт Р. Текущее понимание микробиома человека. Nat Med. 2018; 24 (4): 392–400.

    CAS PubMed PubMed Central Google ученый

  • 22.

    Knight R, Vrbanac A, Taylor BC, Axsenov A, Callewaert C, Debelius J, et al. Лучшие практики для анализа микробиомов. Nat Rev Microbiol. 2018; 16 (7): 410.

    CAS PubMed Google ученый

  • 23.

    Уолтер Дж., Армет А.М., Финлей Б.Б., Шанахан Ф. Установление или преувеличение причинно-следственной связи микробиома кишечника: уроки грызунов, связанных с микробиотой человека. Клетка. 2020; 180 (2): 221–32.

    CAS PubMed Google ученый

  • 24.

    Gopalakrishnan V, Spencer CN, Nezi L, Reuben A, Andrews MC, Karpinets TV, et al. Микробиом кишечника модулирует ответ на иммунотерапию анти-PD-1 у пациентов с меланомой. Наука (Нью-Йорк, Нью-Йорк). 2018; 359 (6371): 97–103.

    CAS Google ученый

  • 25.

    Смит М.И., Яцуненко Т., Манари М.Дж., Трехан И., Мкакося Р., Ченг Дж. И др. Микробиомы кишечника малавийских пар близнецов не соответствуют квашиоркору. Наука (Нью-Йорк, Нью-Йорк). 2013. 339 (6119): 548–54.

    CAS Google ученый

  • 26.

    Стюарт С.Дж., Аджами, штат Нью-Джерси, О’Брайен Д.Л., Хатчинсон Д.С., Смит Д.П., Вонг М.К. и др. Временное развитие микробиома кишечника в раннем детстве по данным исследования TEDDY. Природа. 2018; 562 (7728): 583-8-8.

    CAS PubMed PubMed Central Google ученый

  • 27.

    Бауман-Дуденхёффер А.М., Д'Суза А.В., Тарр П.И., Уорнер Б.Б., Дантас Г.Младенческая диета и прибавка в весе матери во время беременности предсказывают раннее метаболическое созревание кишечных микробиомов. Nat Med. 2018; 24 (12): 1822-9-9.

    CAS PubMed PubMed Central Google ученый

  • 28.

    Яссур М., Ватанен Т., Сильяндер Х., Хамалайнен А.М., Харконен Т., Риханен С.Дж. и др. Естественная история микробиома кишечника младенца и влияние лечения антибиотиками на разнообразие и стабильность бактериальных штаммов. Science Transl Med. 2016; 8 (343): 343ra81.

    Google ученый

  • 29.

    Винсент С., Миллер М.А., Эденс Т.Дж., Мехротра С., Дьюар К., Манжес АР. Цветение и спад: динамика кишечной микробиоты в ответ на воздействие в больнице и колонизацию или инфекцию Clostridium difficile. Микробиом. 2016; 4: 12.

    PubMed PubMed Central Google ученый

  • 30.

    D’Souza AW, Potter RF, Wallace M, Shupe A, Patel S, Sun X и др.Пространственно-временная динамика бактерий с множественной лекарственной устойчивостью на поверхностях отделений интенсивной терапии. Nat Commun. 2019; 10 (1): 4569.

    PubMed PubMed Central Google ученый

  • 31.

    Майер Л., Прутяну М., Кун М., Зеллер Г., Тельцеров А., Андерсон Е. Е. и др. Обширное влияние неантибиотических препаратов на кишечные бактерии человека. Природа. 2018; 555 (7698): 623–8.

    CAS PubMed PubMed Central Google ученый

  • 32.

    Гаспаррини А.Дж., Ван Б., Сунь Х, Кеннеди Е.А., Эрнандес-Лейва А., Ндао И.М. и др. Устойчивые метагеномные признаки госпитализации в раннем возрасте и лечения антибиотиками в микробиоте и резистоме кишечника младенца. Nat Microbiol. 2019; 4 (12): 2285–97.

    PubMed PubMed Central Google ученый

  • 33.

    Чу Д.М., Ма Дж., Принц А.Л., Энтони К.М., Сеферович М.Д., Аагаард К.М. Созревание структуры и функции сообщества микробиома младенца во многих участках тела и в зависимости от способа доставки.Nat Med. 2017; 23 (3): 314–26.

    CAS PubMed PubMed Central Google ученый

  • 34.

    Lim ES, Zhou Y, Zhao G, Bauer IK, Droit L, Ndao IM, et al. Динамика вирома кишечника человека и бактериального микробиома у младенцев в раннем периоде жизни. Nat Med. 2015; 21 (10): 1228–34.

    CAS PubMed PubMed Central Google ученый

  • 35.

    Яцуненко Т., Рей Ф. Э., Манари М. Дж., Трехан И., Домингес-Белло М. Г., Контрерас М. и др.Микробиом кишечника человека в зависимости от возраста и географии. Природа. 2012. 486 (7402): 222–7.

    CAS PubMed PubMed Central Google ученый

  • 36.

    Яссур М., Джейсон Э., Хогстром Л.Дж., Артур Т.Д., Трипати С., Сильяндер Х и др. Штаммовый анализ передачи бактерий от матери ребенку в течение первых нескольких месяцев жизни. Клеточный микроб-хозяин. 2018; 24 (1): 146-54.e4-54.e4.

  • 37.

    Ватанен Т., Плихта Д.Р., Сомани Дж., Мунк П.С., Артур Т.Д., Холл А.Б. и др.Геномная изменчивость и штамм-специфическая функциональная адаптация микробиома кишечника человека в раннем возрасте. Nat Microbiol. 2019; 4 (3): 470–9.

    CAS PubMed Google ученый

  • 38.

    Hill CJ, Lynch DB, Murphy K, Ulaszewska M, Jeffery IB, O’Shea CA, et al. Эволюция состава кишечной микробиоты от рождения до 24 недель в когорте INFANTMET. Микробиом. 2017; 5 (1): 4.

    PubMed PubMed Central Google ученый

  • 39.

    Субраманиан С., Хук С., Яцуненко Т., Хак Р., Махфуз М., Алам М.А. и др. Стойкая незрелость кишечной микробиоты у голодающих детей Бангладеш. Природа. 2014; 510 (7505): 417–21.

    CAS PubMed PubMed Central Google ученый

  • 40.

    Дэвид Л.А., Матерна А.С., Фридман Дж., Кампос-Баптиста М.И., Блэкберн М.К., Перротта А. и др. Образ жизни хозяина ежедневно влияет на микробиоту человека. Genome Biol. 2014; 15 (7): R89.

    PubMed PubMed Central Google ученый

  • 41.

    Faith JJ, Guruge JL, Charbonneau M, Subramanian S, Seedorf H, Goodman AL, et al. Долгосрочная стабильность микробиоты кишечника человека. Наука (Нью-Йорк, Нью-Йорк). 2013; 341 (6141): 1237439.

    Google ученый

  • 42.

    Caporaso JG, Lauber CL, Costello EK, Berg-Lyons D, Gonzalez A, Stombaugh J, et al. Движущиеся картинки микробиома человека. Genome Biol. 2011; 12 (5): R50.

    PubMed PubMed Central Google ученый

  • 43.

    Мехта Р.С., Абу-Али Г.С., Дрю Д.А., Ллойд-Прайс Дж., Субраманиан А., Лочхед П. и др. Стабильность фекального микробиома человека в когорте взрослых мужчин. Nat Microbiol. 2018; 3 (3): 347-55-55.

    CAS PubMed PubMed Central Google ученый

  • 44.

    McLaren MR, Willis AD, Callahan BJ. Последовательная и корректируемая систематическая ошибка в экспериментах по метагеномному секвенированию. eLife. 2019; 8e46923.

  • 45.

    Шмидер Р., Эдвардс Р.Быстрая идентификация и устранение контаминации последовательностей из наборов геномных и метагеномных данных. PLoS One. 2011; 6 (3): e17288.

    CAS PubMed PubMed Central Google ученый

  • 46.

    Дэвис Н.М., Проктор Д.М., Холмс С.П., Релман Д.А., Каллахан Б.Дж. Простая статистическая идентификация и удаление загрязняющих последовательностей в данных маркера-гена и метагеномики. Микробиом. 2018; 6 (1): 226.

    PubMed PubMed Central Google ученый

  • 47.

    Миних Дж. Дж., Сандерс Дж. Г., Амир А., Хамфри Дж., Гилберт Дж., Найт Р. Количественная оценка и понимание межкважинного загрязнения в исследованиях микробиома. mSystems. 2019; 4 (4): e00186–19.

  • 48.

    Флорес Дж. Г., Капорасо Дж. Дж., Хенли Дж. Б., Райдаут Дж. Р., Домогала Д., Чейз Дж. И др. Временная изменчивость - это индивидуальная особенность микробиома человека. Genome Biol. 2014; 15 (12): 531.

    PubMed PubMed Central Google ученый

  • 49.

    Костелло Е.К., Стагаман К., Детлефсен Л., Боханнан Б.Дж., Релман Д.А. Применение экологической теории к пониманию микробиома человека. Наука (Нью-Йорк, Нью-Йорк). 2012. 336 (6086): 1255–62.

    CAS Google ученый

  • 50.

    Ватанен Т., Франзоса Э.А., Швагер Р., Трипати С., Артур Т.Д., Вехик К. и др. Микробиом кишечника человека при диабете типа 1 с ранним началом из исследования TEDDY. Природа. 2018; 562 (7728): 589-94-94.

    CAS PubMed PubMed Central Google ученый

  • 51.

    D’Souza AW, Moodley-Govender E, Berla B, Kelkar T., Wang B, Sun X и др. Профилактика котримоксазолом увеличивает распространенность гена устойчивости и альфа-разнообразие, но снижает бета-разнообразие в кишечном микробиоме неинфицированных младенцев, контактировавших с ВИЧ. Clin Infect Dis. 2019: ciz1186.

  • 52.

    Парнанен К., Каркман А., Халтман Дж., Лира С., Бенгтссон-Пальме Дж., Ларссон Д. Дж. Дж. И др. Микробиота кишечника и грудного молока матери влияет на устойчивость кишечника младенцев к антибиотикам и мобильные генетические элементы. Nat Commun.2018; 9 (1): 3891.

    PubMed PubMed Central Google ученый

  • 53.

    Nogacka A, Salazar N, Suarez M, Milani C, Arboleya S, Solis G, et al. Влияние антимикробной профилактики во время родов на микробиоту кишечника и распространенность генов устойчивости к антибиотикам у доношенных новорожденных, родившихся через естественные родовые пути. Микробиом. 2017; 5 (1): 93.

    PubMed PubMed Central Google ученый

  • 54.

    Гибсон М.К., Ван Б., Ахмади С., Бернхэм С.-АД, Тарр П.И., Уорнер Б.Б. и др. Динамика развития микробиоты кишечника недоношенных новорожденных и резистома к антибиотикам. Природная микробиология. 2016; 1 (4): nmicrobiol201624.

  • 55.

    Бокулич Н.А., Чанг Дж., Батталья Т., Хендерсон Н., Джей М., Ли Н. и др. Антибиотики, способ родов и диета влияют на созревание микробиома в молодом возрасте. Трансляционная медицина науки. 2016; 8 (343): 343ra82.

    PubMed PubMed Central Google ученый

  • 56.

    Palleja A, Mikkelsen KH, Forslund SK, Kashani A, Allin KH, Nielsen T. и др. Восстановление кишечной микробиоты здоровых взрослых после воздействия антибиотиков. Nat Microbiol. 2018; 3 (11): 1255-65-65.

    CAS PubMed Google ученый

  • 57.

    Доан Т., Хинтервирт А., Уорден Л., Арзика А.М., Малики Р., Абду А. и др. Изменение микробиома кишечника в MORDOR I: рандомизированное исследование массового распределения азитромицина. Nat Med. 2019; 25 (9): 1370–6.

    CAS PubMed Google ученый

  • 58.

    Доан Т., Арзика А.М., Хинтервирт А., Малики Р., Чжун Л., Каммингс С. и др. Устойчивость к макролидам в MORDOR I - кластерном рандомизированном исследовании в Нигере. N Engl J Med. 2019; 380 (23): 2271–3.

    PubMed PubMed Central Google ученый

  • 59.

    Suez J, Zmora N, Zilberman-Schapira G, Mor U, Dori-Bachash M, Bashiardes S, et al.Восстановление микробиома слизистой оболочки кишечника после приема антибиотиков нарушается пробиотиками и улучшается с помощью аутологичного FMT. Клетка. 2018; 174 (6): 1406–23 e16.

    CAS PubMed Google ученый

  • 60.

    Шульман Дж., Диманд Р. Дж., Ли ХК, Дуэнас Г. В., Беннетт М. В., Гулд Дж. Б.. Использование антибиотиков в отделении интенсивной терапии новорожденных. Педиатрия. 2015; 135 (5): 826–33.

    PubMed Google ученый

  • 61.

    Cantey JB, Возняк PS, Pruszynski JE, Sanchez PJ. Снижение ненужного использования антибиотиков в отделении интенсивной терапии новорожденных (SCOUT): проспективное исследование с прерывистыми временными рядами. Lancet Infect Dis. 2016; 16 (10): 1178–84.

    PubMed Google ученый

  • 62.

    Cantey JB, Wozniak PS, Sanchez PJ. Проспективное наблюдение за использованием антибиотиков в отделении интенсивной терапии новорожденных: результаты исследования SCOUT. Pediatr Infect Dis J. 2015; 34 (3): 267–72.

    PubMed Google ученый

  • 63.

    Шульман Дж., Профит Дж., Ли ХК, Дуэнас Дж., Беннетт М.В., Паруча Дж. И др. Варианты использования антибиотиков в неонатальном периоде. Педиатрия. 2018; 142 (3): e20180115.

  • 64.

    Shipp KD, Chiang T, Karasick S, Quick K, Nguyen ST, Cantey JB. Проблемы рационального использования антибиотиков в отделении интенсивной терапии новорожденных. Am J Perinatol. 2016; 33 (5): 518–24.

    PubMed Google ученый

  • 65.

    Донг Й, Шпеер CP. Поздний неонатальный сепсис: последние события. Arch Dis Child Fetal Neonatal Ed. 2015; 100 (3): F257.

    PubMed Google ученый

  • 66.

    Брукс Б., Файрек Б.А., Миллер С.С., Шарон И., Томас Б.К., Бейкер Р. и др. Микробы в отделении интенсивной терапии новорожденных напоминают микробы, обнаруженные в кишечнике недоношенных детей. Микробиом. 2014; 2 (1): 1.

    PubMed PubMed Central Google ученый

  • 67.

    Sommer MO, Dantas G, Church GM. Функциональная характеристика резервуара устойчивости к антибиотикам в микрофлоре человека. Наука (Нью-Йорк, Нью-Йорк). 2009. 325 (5944): 1128–31.

    CAS Google ученый

  • 68.

    Цзя Б., Рафения А.Р., Алкок Б., Ваглехнер Н., Го П., Цанг К.К. и др. CARD 2017: расширение и модельно-ориентированное лечение всеобъемлющей базы данных по устойчивости к антибиотикам. Nucleic Acids Res. 2017; 45 (D1): D566 – d73.

    CAS PubMed Google ученый

  • 69.

    Fouhy F, Watkins C, Hill CJ, O’Shea CA, Nagle B., Dempsey EM, et al. Перинатальные факторы влияют на микробиоту кишечника до четырех лет после рождения. Nat Commun. 2019; 10 (1): 1517.

    PubMed PubMed Central Google ученый

  • 70.

    Стюарт С.Дж., Скит Т., Нельсон А., Фернстад С.Дж., Маррс Э.С., Перри Д.Д. и др. Микробиота и метаболом кишечника недоношенных после выписки из реанимации. Научный доклад 2015; 5: 17141.

    CAS PubMed PubMed Central Google ученый

  • 71.

    Доусон-Хан Э.Е., Микан С., Онакпоя И., Робертс Н., Кронман М., Батлер С.К. и др. Краткосрочный курс перорального лечения антибиотиками в сравнении с длительным курсом лечения инфекций в амбулаторных условиях: обзор систематических обзоров. Fam Pract. 2017; 34 (5): 511–9.

    PubMed PubMed Central Google ученый

  • 72.

    Льюис Дж. Д., Чен Э. З., Балдассано Р. Н., Отли А. Р., Гриффитс А. М., Ли Д. и др. Воспаление, антибиотики и диета как факторы стресса окружающей среды кишечного микробиома при болезни Крона у детей.Клеточный микроб-хозяин. 2015; 18 (4): 489–500.

    CAS PubMed PubMed Central Google ученый

  • 73.

    Willmann M, Vehreschild M, Biehl LM, Vogel W, Dorfel D, Hamprecht A, et al. Отчетливое влияние антибиотиков на микробиом и резистом кишечника: продольное многоцентровое когортное исследование. BMC Biol. 2019; 17 (1): 76.

    PubMed PubMed Central Google ученый

  • 74.

    Shaw LP, Bassam H, Barnes CP, Walker AS, Klein N, Balloux F. Моделирование восстановления микробиома после антибиотиков с использованием структуры ландшафта стабильности. ISME J. 2019; 13 (7): 1845–56.

    CAS PubMed PubMed Central Google ученый

  • 75.

    Raymond F, Ouameur AA, Deraspe M, Iqbal N, Gingras H, Dridi B, et al. Исходное состояние микробиома кишечника человека определяет его изменение под действием антибиотиков. ISME J. 2016; 10 (3): 707–20.

    CAS PubMed Google ученый

  • 76.

    Li J, Rettedal EA, van der Helm E, Ellabaan M, Panagiotou G, Sommer MOA. Лечение антибиотиками способствует разнообразию резистома кишечника человека. Геномика Протеомика Биоинформатика. 2019; 17 (1): 39–51.

    CAS PubMed PubMed Central Google ученый

  • 77.

    Бюлоу Э., Белло Гонсалес TDJ, Фуэнтес С., де Стинхейсен Питерс ВАА, Лахти Л., Байджанов Дж. Р. и др.Сравнительная микробиота кишечника и профили резистома у пациентов интенсивной терапии, получающих селективную деконтаминацию пищеварительного тракта, и у здоровых субъектов. Микробиом. 2017; 5 (1): 88.

    PubMed PubMed Central Google ученый

  • 78.

    Kantele A, Laaveri T, Mero S, Vilkman K, Pakkanen SH, Ollgren J, et al. Противомикробные препараты повышают риск колонизации путешественников энтеробактериями, продуцирующими бета-лактамазы расширенного спектра действия. Клинические инфекционные болезни.2015; 60 (6): 837–46.

    PubMed PubMed Central Google ученый

  • 79.

    Arcilla MS, van Hattem JM, Haverkate MR, Bootsma MCJ, van Genderen PJJ, Goorhuis A, et al. Импорт и распространение Enterobacteriaceae, продуцирующих бета-лактамазы расширенного спектра действия, международными путешественниками (исследование COMBAT): проспективное многоцентровое когортное исследование. Lancet Infect Dis. 2017; 17 (1): 78–85.

    PubMed Google ученый

  • 80.

    Gevers D, Kugathasan S, Denson LA, Vazquez-Baeza Y, Van Treuren W., Ren B, et al. Микробиом, ранее не получавший лечения, при впервые возникшей болезни Крона. Клеточный микроб-хозяин. 2014; 15 (3): 382–92.

    CAS PubMed PubMed Central Google ученый

  • 81.

    Salazar N, Valdes-Varela L, Gonzalez S, Gueimonde M, de Los Reyes-Gavilan CG. Питание и микробиом кишечника у пожилых людей. Кишечные микробы. 2017; 8 (2): 82–97.

    CAS PubMed Google ученый

  • 82.

    Салазар Н., Арболея С., Вальдес Л., Стэнтон С., Росс П., Руис Л. и др. Микробиом кишечника человека в экстремальном возрасте. Диетическое вмешательство как способ противодействия изменениям. Фронт Жене. 2014; 5: 406.

    PubMed PubMed Central Google ученый

  • 83.

    Клаэссон М.Дж., Кьюсак С., О’Салливан О., Грин-Диниз Р., де Верд Х., Фланнери Е. и др. Состав, изменчивость и временная стабильность кишечной микробиоты пожилых людей.Proc Natl Acad Sci U S. A. 2011; 108 (Приложение 1): 4586–91.

    CAS PubMed Google ученый

  • 84.

    Детлефсен Л., Релман Д.А. Неполное восстановление и индивидуальные ответы микробиоты дистальных отделов кишечника человека на повторяющееся воздействие антибиотиков. Proc Natl Acad Sci U S. A. 2011; 108 (Приложение 1): 4554–61.

    CAS PubMed Google ученый

  • 85.

    Isaac S, Scher JU, Djukovic A, Jimenez N, Littman DR, Abramson SB, et al.Краткосрочные и долгосрочные эффекты перорального ванкомицина на микробиоту кишечника человека. J Antimicrob Chemother. 2017; 72 (1): 128–36.

    CAS PubMed Google ученый

  • 86.

    Smillie CS, Sauk J, Gevers D, Friedman J, Sung J, Youngster I, et al. Отслеживание штаммов позволяет выявить детерминанты приживления бактерий в кишечнике человека после трансплантации фекальной микробиоты. Клеточный микроб-хозяин. 2018; 23 (2): 229–40 e5–40.e5.

    CAS PubMed Google ученый

  • 87.

    Лэнгдон А., Крук Н., Дантас Дж. Влияние антибиотиков на микробиом на протяжении всей разработки и альтернативные подходы к терапевтическому регулированию. Геномная медицина. 2016; 8 (1): 39.

    PubMed PubMed Central Google ученый

  • 88.

    Jernberg C, Lofmark S, Edlund C, Jansson JK. Долгосрочное воздействие антибиотиков на микробиоту кишечника человека. Микробиология (Рединг, Англия). 2010. 156 (Pt 11): 3216–23.

    CAS Google ученый

  • 89.

    Round JL, Ли С.М., Ли Дж., Тран Дж., Джабри Б., Чатила Т.А. и др. Путь Toll-подобного рецептора 2 устанавливает колонизацию комменсалом человеческой микробиоты. Наука (Нью-Йорк, Нью-Йорк). 2011. 332 (6032): 974–7.

    CAS Google ученый

  • 90.

    Tett A, Huang KD, Asnicar F, Fehlner-Peach H, Pasolli E, Karcher N, et al. Комплекс Prevotella copri состоит из четырех отдельных клад, недостаточно представленных в западных популяциях. Клеточный микроб-хозяин.2019; 26 (5): 666–79.e7.

  • 91.

    Рудгар М., Гуд Б. Х., Гаруд Н. Р., Мартис С., Авула М., Чжоу В. и др. Секвенирование с продольным связыванием при чтении показывает экологические и эволюционные реакции микробиома кишечника человека во время лечения антибиотиками. bioRxiv. 2019.

  • 92.

    Zhao S, Lieberman TD, Poyet M, Kauffman KM, Gibbons SM, Groussin M, et al. Адаптивная эволюция микробиомов кишечника здоровых людей. Клеточный микроб-хозяин. 2019; 25 (5): 656–67 e8.

    CAS PubMed PubMed Central Google ученый

  • 93.

    Isanaka S, Langendorf C, Berthe F, Gnegne S, Li N, Ousmane N и др. Обычное применение амоксициллина при неосложненной тяжелой острой недостаточности питания у детей. N Engl J Med. 2016; 374 (5): 444–53.

    CAS PubMed Google ученый

  • 94.

    Кинан Дж. Д., Бейли Р. Л., Западная СК, Арзика А. М., Харт Дж., Уивер Дж. И др. Азитромицин для снижения детской смертности в странах Африки к югу от Сахары. N Engl J Med. 2018; 378 (17): 1583–92.

    CAS PubMed PubMed Central Google ученый

  • 95.

    Trehan I, Schechtman KB, Manary MJ. Амоксициллин при тяжелой острой недостаточности питания у детей. N Engl J Med. 2016; 375 (2): 191.

    PubMed Google ученый

  • 96.

    Богоч II, Утцингер Дж., Ло, Северная Каролина, Эндрюс Дж. Р.. Массовое применение антибактериальных препаратов для снижения детской смертности: возможности, проблемы и возможные дальнейшие шаги. PLoS Negl Trop Dis. 2019; 13 (5): e0007315.

    PubMed PubMed Central Google ученый

  • 97.

    Маатауи Н., Лангендорф С., Берта Ф., Байджанов Дж. Р., ван Шайк В., Исанака С. и др. Повышенный риск приобретения и передачи энтеробактерий, продуцирующих БЛРС, у истощенных детей, подвергшихся воздействию амоксициллина. J Antimicrob Chemother. 2020; 75 (3): 709–17.

    CAS PubMed Google ученый

  • 98.

    CDC. Угрозы устойчивости к антибиотикам в США. Атланта: Департамент здравоохранения и социальных служб; 2019.

    Google ученый

  • 99.

    Woerther P-L, Angebault C, Jacquier H, Hugede H-C, Janssens A-C, Sayadi S и др. Массовое увеличение, распространение и обмен генов, кодирующих β-лактамазу расширенного спектра, среди кишечных Enterobacteriaceae у госпитализированных детей с тяжелой острой недостаточностью питания в Нигере. Clin Infect Dis. 2011; 53 (7): 677-85-85.

    CAS PubMed Google ученый

  • 100.

    Заура Э., Брандт Б.В., Тейшейра де Маттос М.Дж., Буйс М.Дж., Касперс М.П., ​​Рашид М.Ю. и др.Такое же воздействие, но два радикально разных ответа на антибиотики: устойчивость микробиома слюны по сравнению с долгосрочными микробными изменениями в кале. mBio. 2015; 6 (6): e01693–15.

    CAS PubMed PubMed Central Google ученый

  • 101.

    Детлефсен Л., Хусе С., Согин М.Л., Рельман Д.А. Всестороннее воздействие антибиотика на микробиоту кишечника человека, как показало глубокое секвенирование 16S рРНК. PLoS Biol. 2008; 6 (11): e280.

    PubMed PubMed Central Google ученый

  • 102.

    Брандт Л.Дж., Арониадис О.К., Меллоу М., Канатзар А., Келли С., Парк Т. и др. Долгосрочное наблюдение после колоноскопической трансплантации фекальной микробиоты по поводу рецидива инфекции Clostridium difficile. Am J Gastroenterol. 2012. 107 (7): 1079–87.

    PubMed Google ученый

  • 103.

    Orenstein R, Dubberke E, Hardi R, Ray A, Mullane K, Pardi DS, et al. Безопасность и долговечность RBX2660 (суспензия микробиоты) при рецидивирующей инфекции Clostridium difficile : результаты исследования PUNCH CD.Clin Infectious Dis. 2016; 62 (5): 596–602.

    Google ученый

  • 104.

    DeFilipp Z, Peled JU, Li S, Mahabamunuge J, Dagher Z, Slingerland AE, et al. Сторонняя трансплантация фекальной микробиоты после алло-HCT восстанавливает разнообразие микробиома. Blood Adv. 2018; 2 (7): 745–53.

    CAS PubMed PubMed Central Google ученый

  • 105.

    Ван И, Виесноски Д.Х., Хельминк Б.А., Гопалакришнан В., Чой К., DuPont HL и др.Трансплантация фекальной микробиоты при рефрактерном колите, связанном с ингибиторами иммунных контрольных точек. Nat Med. 2018; 24 (12): 1804-8-8.

    CAS PubMed PubMed Central Google ученый

  • 106.

    Таур Y, Койт К., Шлютер Дж., Робилотти Э., Фигероа С., Гьонбалай М. и др. Восстановление микробиоты кишечника пациентов, принимающих антибиотики, путем трансплантации аутологичной фекальной микробиоты. Science Transl Med. 2018; 10 (460): eaap9489.

  • 107.

    Hocquart M, Lagier JC, Cassir N, Saidani N, Eldin C., Kerbaj J, et al. Ранняя трансплантация фекальной микробиоты улучшает выживаемость при тяжелых инфекциях Clostridium difficile. Clin Infectious Dis. 2018; 66 (5): 645–50.

    CAS Google ученый

  • 108.

    Hourigan SK, Ahn M, Gibson KM, Perez-Losada M, Felix G, Weidner M, et al. Пересадка кала детям с Clostridioides difficile обеспечивает устойчивое снижение устойчивости к противомикробным препаратам и потенциального бремени патогенов.Открытый форум Infectious Dis. 2019; 6 (10): ofz379.

    Google ученый

  • 109.

    Миллан Б., Парк Х, Хотте Н., Матье О, Бургьер П., Томпкинс Т.А. и др. Трансплантаты фекальных микробов снижают уровень генов устойчивости к антибиотикам у пациентов с рецидивирующей инфекцией Clostridium difficile. Clin Infectious Dis. 2016; 62 (12): 1479–86.

    CAS Google ученый

  • 110.

    Вудворт М.Х., Хайден М.К., Янг В.Б., Квон Дж. Х.Роль трансплантации фекальной микробиоты в снижении колонизации кишечника устойчивыми к антибиотикам организмами: текущая ситуация и будущие направления. Открытый форум инфекционных болезней. 2019; 6 (7): ofz288.

  • 111.

    Dubberke ER, Mullane KM, Gerding DN, Lee CH, Louie TJ, Guthertz H, et al. Выведение устойчивых к ванкомицину Enterococcus одновременно с введением препарата на основе микробиоты, направленного на рецидивирующую инфекцию Clostridium difficile . Открытый форум инфекционных болезней.2016; 3 (3): ofw133.

  • 112.

    Bulow C, Langdon A, Hink T, Wallace M, Reske KA, Patel S, et al. Влияние амоксициллина-клавуланата с последующей трансплантацией аутологичной фекальной микробиоты на структуру фекального микробиома и метаболический потенциал. мСфера. 2018; 3 (6): e00588–18.

  • 113.

    Шварц Д. Д., Ребек О. Н., Дантас Г. Сложные взаимодействия между микробиомом и иммунотерапией рака. Критик Rev Clin Lab Sci. 2019; 56 (8): 567–85.

    CAS PubMed PubMed Central Google ученый

  • 114.

    Хемпель С., Ньюберри С.Дж., Махер А.Р., Ван З., Майлз Дж. Н., Шанман Р. и др. Пробиотики для профилактики и лечения диареи, связанной с антибиотиками: систематический обзор и метаанализ. Джама. 2012. 307 (18): 1959–69.

    CAS PubMed Google ученый

  • 115.

    Kabbani TA, Pallav K, Dowd SE, Villafuerte-Galvez J, Vanga RR, Castillo NE, et al. Проспективное рандомизированное контролируемое исследование влияния Saccharomyces boulardii CNCM I-745 и амоксициллина-клавуланата или комбинации на микробиоту кишечника здоровых добровольцев.Кишечные микробы. 2017; 8 (1): 17–32.

    CAS PubMed Google ученый

  • 116.

    Zmora N, Zilberman-Schapira G, Suez J, Mor U, Dori-Bachash M, Bashiardes S, et al. Индивидуальная резистентность к колонизации слизистой оболочки кишечника эмпирическими пробиотиками связана с уникальными особенностями хозяина и микробиома. Клетка. 2018; 174 (6): 1388–405.e21–405.e21.

  • 117.

    ДеФилипп З., Блум П.П., Торрес Сото М., Мансур М.К., Сатер MRA, Хантли М.Х. и др.Лекарственно-резистентная бактериемия E. coli, передающаяся при трансплантации фекальной микробиоты. N Engl J Med. 2019; 381 (21): 2043–50.

    PubMed Google ученый

  • 118.

    Администрация FaD. Информация, касающаяся дополнительных мер безопасности в отношении использования фекальной микробиоты для трансплантации - скрининг и тестирование доноров стула на организмы с множественной лекарственной устойчивостью FDA.gov2019 [обновлено 18.06.2019.

  • 119.

    Brito IL, Alm EJ.Отслеживание штаммов в микробиоме: выводы из метагеномики и моделей. Front Microbiol. 2016; 7: 712.

    PubMed PubMed Central Google ученый

  • 120.

    Ридаура В.К., Фейт Дж. Дж., Рей Ф. Е., Ченг Дж., Дункан А. Э., Кау А. Л. и др. Микробиота кишечника близнецов, не согласных с ожирением, модулирует метаболизм у мышей. Наука (Нью-Йорк, Нью-Йорк). 2013; 341 (6150): 1241214.

  • 121.

    Сполдинг С.Н., Кляйн Р.Д., Руер С., Кау А.Л., Шрайбер Х.Л., Кусумано З.Т. и др.Селективное истощение уропатогенных E. coli из кишечника антагонистом FimH. Природа. 2017; 546 (7659): 528.

  • 122.

    Дивья Ганешан С., Хоссейнидуст З. Фаговая терапия с акцентом на микробиоту человека. Антибиотики (Базель). 2019; 8 (3): 131.

  • 123.

    Молодой В.Б. Роль микробиома в здоровье и болезнях человека: введение для клиницистов. BMJ. 2017; 356: j831.

    PubMed Google ученый

  • Антибиотики изменяют микробиом кишечника и здоровье хозяина

    Кредит: Юлия Петрова / Alamy Stock Photo

    Антибиотики действуют не только на бактерии, вызывающие инфекции, но также влияют на резидентную микробиоту.Хотя этот побочный эффект давно осознали, достижения в технологиях секвенирования позволили детально изучить, как антибиотики изменяют микробиом кишечника.

    Хотя состав микробиоты кишечника варьируется от человека к человеку, сообщество каждого человека остается относительно стабильным с течением времени (этап 7). В 2008 году Релман и его коллеги изучили трех здоровых людей и показали, что лечение ципрофлоксацином влияет на численность примерно одной трети бактериальных таксонов в образцах фекалий.Эти изменения уменьшили таксономическое богатство, разнообразие и равномерность сообщества. Хотя большинство бактериальных групп восстановилось после лечения, некоторые таксоны не восстановились (даже через шесть месяцев), и уровень восстановления варьировал между индивидуумами. Последующее исследование показало, что второй курс ципрофлоксацина имел аналогичные эффекты. Не было корреляции между величиной сдвига микробиома при первом и втором сеансах лечения у любого человека; каждое обращение было очередным «броском кости».

    Из-за тесных связей между резидентной микробиотой и хозяином такое нарушение микробиоты антибиотиками может повлиять на физиологию хозяина и потенциально на его здоровье. Действительно, одно исследование показало, что введение антибиотиков молодым мышам увеличивало ожирение и уровни метаболических гормонов в крови, а трансплантация фекалий от мышей, леченных антибиотиками, мышам, свободным от микробов, передала метаболический фенотип. Помимо воздействия на метаболизм, микробиота кишечника также тесно взаимодействует с иммунной системой хозяина и влияет на нее, и, таким образом, нарушения микробиома могут повлиять на развитие ряда аутоиммунных, воспалительных и аллергических заболеваний.

    Лечение мышей антибиотиками с рождения также изменяет экспрессию генов и количество клеток, регулирующих иммунные ответы. Импульсное лечение антибиотиками увеличивало частоту диабета типа 1 у восприимчивых мышей, и относительные уровни противовоспалительных Т-клеток были ниже у этих мышей (до начала заболевания), чем у нелеченных мышей. Лечение новорожденных антибиотиками увеличивало восприимчивость взрослых мышей к псориазу, индуцированному имиквимодом.

    Аналогичные наблюдения были сделаны для астмы.У детей, которые подвергаются воздействию антибиотиков в первый год жизни, немного повышается риск развития астмы, и этот риск увеличивается с увеличением количества курсов антибиотиков. Регрессионный анализ детей с астмой показал, что раннее воздействие антибиотиков является фактором риска. Численность родов Faecalibacterium , Lachnospira , Veillonella и Rothia (FLVR) снизилась у детей в возрасте трех месяцев, которые лечились антибиотиками и позже у них развилась астма.В экспериментах по переносу фекалий от одного из этих детей добавление FLVR уменьшало тяжесть заболевания на мышиной модели астмы. Изменения в составе сообщества сопровождались изменениями метаболитов, таких как ацетат, короткоцепочечная жирная кислота, которая, как известно, влияет на метаболизм и иммунную функцию хозяина. В другом исследовании воздействие антибиотика ванкомицина в раннем возрасте действительно увеличивало иммуноглобулин Е и снижало уровни регуляторных Т-клеток у мышей.

    Исследование, посвященное нарушению микробиоты кишечника антибиотиками и риску развития воспалительного заболевания кишечника, также показало, что передача нарушенной микробиоты кишечника от матери мышей их новорожденным детенышам способствовала и ускоряла развитие воспаления кишечника у потомства.

    Определенные меры могут помочь восстановить микробное сообщество кишечника до исходного состояния, если потребуются антибиотики. Например, Элинав и его коллеги недавно обнаружили, что введение определенных пробиотиков затрудняет, а аутологичная фекальная трансплантация помогает восстановить микробиом.

    Наблюдение за тем, что микробиом кишечника может быть постоянно нарушен даже краткосрочным лечением или лечением низкими дозами антибиотиков, и что это изменение может иметь долгосрочные последствия для здоровья, предостерегает от широко распространенного и потенциально ненужного использования антибиотиков, особенно у молодых детям и беременным женщинам, и показывает, что антибиотики не следует считать безвредными.Однако это также вселяет надежды на модуляцию микробиома в качестве терапевтического лечения иммунных состояний.

    Дополнительная литература

    Willing, C.P. et al. Сдвиг баланса: влияние антибиотиков на взаимное влияние микробиоты и хозяина. Нат. Rev. Microbiol. 9 , 233–243 (2011).

    Долгосрочные эффекты антибиотиков: 5 способов увеличить количество здоровых бактерий

    Антибиотики - одно из самых важных и влиятельных медицинских творений, но чрезмерное их употребление привело к появлению «супербактерий», устойчивых к противомикробным препаратам.Обеспокоенность здоровьем человека, животных и окружающей среды.

    Они убивают вредные бактерии, но в результате они также уничтожают полезные бактерии. Когда дело доходит до ВЗК и СРК, для борьбы с инфекцией могут потребоваться антибиотики, но неправильное их употребление может еще больше ухудшить связанные с ними симптомы.

    Что лечат антибиотики?

    Термин антибиотики означает:

    «… любое химическое вещество, продуцируемое микроорганизмом, способное подавлять рост бактерий и других микроорганизмов или уничтожать их .”[1]

    Антибиотики действуют против бактерий, но не против вирусов:

    • Бактерии - это живые организмы, существующие в виде отдельных клеток. В некоторых случаях они полезны, но некоторые вредны, вызывая болезни и вторгаясь в организм, нарушая нормальные процессы в организме.
    • Вирусов нет в живых. Они растут и размножаются только после того, как вторгаются в живые клетки. Ваша иммунная система может бороться с некоторыми из них до того, как они вызовут болезнь, но другим, возможно, потребуется пройти свой курс в вашем организме [2].

    Врачи, которые более либерально относятся к антибиотикам, могут порекомендовать их, если не уверены, вызвано ли заболевание бактериями или вирусом.

    Общие побочные эффекты антибиотиков

    Назначение антибиотиков - бороться с бактериальными инфекциями, но у некоторых людей возникают отрицательные побочные эффекты.

    Краткосрочные побочные эффекты включают расстройство желудка, диарею, потерю аппетита, грибковые инфекции или молочницу полости рта [3]. К серьезным симптомам относятся аллергические реакции (затрудненное дыхание, отек в горле или во рту, сильная водянистая или кровавая диарея и дрожжевые инфекции.

    Обратитесь к врачу, если у вас возникнут побочные эффекты после приема антибиотиков. Чтобы предотвратить неправильное использование, ваш врач может назначить вам антибиотик и контролировать побочные эффекты, скорректировать дозу или назначить вам другой антибиотик.

    Если вы испытываете аллергическую реакцию , такую ​​как кожная сыпь или анафилаксия (одышка, сильная тошнота или рвота, головокружение, учащенное сердцебиение и отек лица, губ или языка), немедленно позвоните в службу экстренной помощи для получения медицинской помощи. помощь.

    Что такое чрезмерное употребление антибиотиков?

    Чрезмерное употребление антибиотиков - это когда антибиотики используются без необходимости. В результате чрезмерного использования антибиотиков устойчивость к противомикробным препаратам растет. Это вызывает серьезную глобальную угрозу здоровью людей, животных и окружающей среды. Одним из результатов является появление устойчивых к лекарствам бактерий или «супербактерий» [5].

    Устойчивость к противомикробным препаратам возникает, когда микроорганизмы (бактерии, грибки, вирусы, паразиты) становятся «умнее» и «сильнее» и развивают устойчивость к лекарствам.В результате лекарство не работает, а инфекции не лечатся, что увеличивает риск их распространения.

    « В пищевых животных антибиотики обычно используются для крупного рогатого скота, кур и свиней, и прогнозируется, что к 2030 году такое использование увеличится до 67% в наиболее густонаселенных странах мира ». [5]

    Глобальное исследование показало, что использование антибиотиков увеличилось на 65% с 2010 по 2015 год в 76 странах [6]. Чрезмерное использование антибиотиков было замечено у животных, людей, без рецепта и из-за увеличения количества поездок, плохой санитарии, а также через навоз и фекалии животных, принимавших антибиотики.

    Предотвратить чрезмерное употребление антибиотиков

    • Если вы испытываете симптомы, связанные с приемом антибиотиков, обратитесь к врачу.
    • Пройдите полный курс лечения антибиотиками
    • Не принимайте антибиотики дольше, чем указано в инструкции
    • Не принимайте антибиотики, оставшиеся после ранее выписанных рецептов

    ВЗК: могут ли быть виноваты антибиотики?

    Исследование 2011 года, опубликованное в BMJ Journal , показало связь между использованием антибиотиков и ВЗК.Это было общенациональное датское когортное исследование, в котором изучалась связь между использованием антибиотиков и ВЗК у детей [7].

    Исследователи собрали данные о назначении антибиотиков в период с 1995 по 2004 год, включая тип назначенного антибиотика и все зарегистрированные диагнозы ВЗК:

    • Данные были собраны по 577 627 детям со средним сроком наблюдения около 5,5 лет.
      • Большинство детей (84,8%) прошли хотя бы один курс антибиотиков.
    • 117 детей заболели ВЗК (50 случаев болезни Крона и 67 язвенных колитов).
    • Исследователи обнаружили, что у детей, которые принимали рецепт на антибиотики, на 84% больше вероятность развития ВЗК во время последующего наблюдения, чем у тех, кто этого не делал.

    Имейте в виду, что это исследование не доказывает, что воздействие антибиотиков вызывает ВЗК. Следует учитывать, что детям, возможно, были назначены антибиотики с большей вероятностью из-за симптомов ВЗК, не зная, что в то время они были больны ВЗК [7].

    Как увеличить количество полезных бактерий

    Повторное использование антибиотиков было связано с уменьшением количества здоровых кишечных бактерий.Без восстановления и перебалансировки кишечных бактерий вы могли бы поставить под угрозу здоровье кишечника, включая ослабленный иммунитет, проблемы с пищеварением, повышенную пищевую аллергию и повышенную чувствительность, усиление воспаления, проблемы с настроением и даже проблемы с гормонами и весом.

    Исследования показывают, что антибиотики могут уничтожать полезные здоровые бактерии и вызывать повреждение микробиома кишечника. Различные источники данных свидетельствуют о важной роли кишечной микробиоты при СРК и ВЗК [8]. Если вы принимали антибиотики, важно восстановить здоровые бактерии.

    Обратите внимание, что это общие рекомендации. Если вы страдаете от ВЗК, вам, возможно, придется проявлять большую осторожность, когда речь идет о пищевой чувствительности или реакциях, особенно если вы планируете обострение болезни. Перед изменением диеты проконсультируйтесь с врачом.

    В центре внимания ферментированные продукты

    Ферментированные продукты - это продукты, частично расщепленные микробами. Например, в йогурте бактерии сбраживают лактозу (молочный сахар), придавая йогурту более густую консистенцию и терпкий вкус.Другие примеры ферментированных продуктов включают сыр, квашеную капусту, чайный гриб, кимчи, кефир и мисо.

    Кормовые бактерии клетчатка

    Волокно питает здоровые кишечные бактерии, которые помогают им расти и размножаться. Продукты с высоким содержанием клетчатки включают орехи, семена, бобы, цельнозерновые продукты. В частности, пребиотические продукты питают здоровые бактерии. К ним относятся лук-порей, бананы, яблоки, льняное семя, лук и спаржа.

    Рассмотрите высококачественный пробиотик

    По словам доктораЛиз Липски в своей книге «Пищеварительное здоровье» стремится к тем, у кого есть Lactobacilli и Bifidobacteria . Если у вас хроническая диарея, стремитесь к Saccharomyces Boulardii . Самое главное, живы ли еще бактерии. Стремитесь купить уважаемый бренд, который ограничивает обработку и проводит стороннее тестирование.

    Ешьте меньше сахара

    Употребление большого количества обработанных пищевых продуктов и добавления сахара может уменьшить количество полезных бактерий в кишечнике.Высокое количество сахара также связано с усилением воспаления, что ухудшает симптомы ВЗК [9].

    Снижение стресса

    Управление стрессом важно для всех аспектов здоровья, включая здоровье кишечника.

    Добавить комментарий

    Ваш адрес email не будет опубликован. Обязательные поля помечены *