Современные болезни человека: Современные болезни и портрет «среднего» российского пациента — Афиша

Анкилозирующий спондилит (Болезнь Бехтерева) — ФГБНУ НИИР им. В.А. Насоновой

Анкилозирующий спондилит (АС) относится к системным воспалительным заболеваниям, при котором преимущественно поражается позвоночник. Протекающий в позвоночнике патологический процесс постепенно приводит к сращению отдельных позвонков между собой (анкилозированию), следствием чего является развитие ограничения подвижности вследствие образования анкилозов (сращений костей друг с другом). Отсюда и происходит и название болезни. Одновременно происходит окостенение связок, окружающих позвоночник. В результате позвоночник может полностью утрачивать свою гибкость и превращаться в сплошную кость.

 
Симптомы

Обычно заболевание развивается в молодом возрасте и имеет постепенное начало в виде болей в пояснице, которые со временем распространяются на другие отделы позвоночника. Боли могут возникать эпизодически, но чаще носят стойкий характер и лишь на время уменьшаются после приема лекарств.

Характер болей имеет следующие особенности:

  • боли усиливаются в покое, особенно во вторую половину ночи или утром;
  • сопровождаются скованностью;
  • уменьшаются или проходят полностью после физических упражнений;
  • быстро купируются приемом нестероидных противовоспалительных препаратов.

Изменения позвоночника распространяются обычно снизу вверх, поэтому затруднения при движении шеи появляются довольно поздно. Наряду с уменьшением гибкости позвоночника могут появится и ограничения подвижность суставов. У некоторых больных помимо изменений позвоночника появляются боли и ограничение движений в плечевых, тазобедренных, височнонижнечелюстных суставах, реже боли и припухание суставов рук и ног, боли в грудине. Эти явления могут быть умеренными и непродолжительными, но в ряде случаев они отличаются стойкостью и протекают довольно тяжело. В отличие от артритов при других заболеваниях, воспаление суставов у больных анкилозирующим спондилитом редко сопровождается их разрушением, но приводит ограничению подвижности в них.

Истинная причина возникновения АС (болезни Бехтерева) пока не ясна.

 

Внесуставные проявления

Кроме позвоночника и суставов иногда наблюдается поражение различных органов и систем (поражения сердца, почек, глаз). Наиболее часто поражаются глаза (увеит), проявляется это болью и покраснением одного глаза, слезотечением, светобоязнью, затуманиванием зрения. В таких случаях больные должны наблюдаться не только у ревматолога, но и у офтальмолога. Увеит при АС, как правило, односторонний и при адекватном лечении обычно проходит в течение 2-3 месяцев без последствий. Если своевременно не назначают адекватное лечение, то увеит может привести к осложнениям.

 
Диагностика

Во всем мире, в том числе и в России, еще 8-10 лет назад диагноз АС ставили в среднем через 7-8 лет от его начала. Это было в первую очередь связано с тем, что один из характерных и диагностически важных клинических признаков болезни — сакроилиит (воспаления крестцово-подвздошных суставов), можно было выявить только рентгенорафически.

Однако этот признак мог проявится довольно поздно, через многие годы от начала болезни. В настоящее время возможно установить диагноз на ранней стадии с использованием МРТ крестцово-подвздошных суставов, который позволяет обнаружить активное воспаление КПС на ранних сроках. Рентгеновское исследование позвоночника на ранних стадиях имеет меньшее значение для постановки диагноза, но обязательно проводится для дальнейшего сравнительного анализа выявляемых изменений по мере прогрессирования болезни, а также для исключения возможных других причин болей в позвоночнике.

При подозрении на заболевание, обязательно проводится исследование на носительство HLA-В27 (гена предрасположенности к АС), его наличие иногда является существенным аргументом в пользу диагноза АС.

Среди лабораторных методов наибольшее значение имеет определение СОЭ и С-реактивного белка (СРБ). Эти показатели дают возможность ориентировочно судить, насколько активно протекает воспалительный процесс. Однако, они не всегда правильно отражает состояние больного, и нормальные цифры СОЭ сами по себе еще не позволяют сделать заключение об отсутствии воспаления.

При первичном обследовании проводится также возможно более полное обследование пациента для выявления сопутствующих заболеваний и выявления внесуставных проявлений АС.

Основная трудность в диагностике АС – это распознать болезнь на ранних стадиях, что в большей мере зависит от анализа чисто клинических, а не структурных изменений в скелете и

от опыта и квалификации врача ревматолога.

Тесты по самодиагностике доступны по ссылке

 
Лечение

Медикаментозная терапия должна назначаться врачом специалистом, в зависимости от стадии и активности заболевания.

В настоящее время имеются все возможности для успешного лечения анкилозирующего спондилита.

Лечение должно быть комплексным и обязательно включать помимо лекарственной терапии и лечебную физкультуру (ЛФК).

Среди немедикаментозных методов лечения анкилозирующего спондилоартрита основное место занимают регулярные физические упражнения (ЛФК) и обучающие занятия, проводимые на школах пациентов. Пациент должен регулярно заниматься ЛФК. Регулярные занятия ЛФК при анкилозирующем спондилоартрите обеспечивают сохранения подвижности позвоночника и суставов. Роль других физиотерапевтических методов лечения анкилозирующего спондилоартрита таких как массаж, магнитолазаротерапия, акупунктура и др. не доказана.

Видеоуроки вы можете посмотреть по ссылке

В настоящее время в арсенале ревматологов имеются лекарственные средства, которые эффективно лечат это заболевание, особенно если его удалось диагностировать на ранних стадиях.

Сотрудничество с лечащим врачом

Пациенту АС необходимо постоянно наблюдаться у врача ревматолога, который может Вас всегда внимательно выслушать и квалифицированно помочь.

Старайтесь регулярно проходить рекомендуемое обследование, аккуратно сохраняйте медицинскую документацию, рентгеновские снимки. Приходя к врачу, готовьте заранее ваши вопросы и пожелания. Обсуждайте любые вопросы изменения лечения, а также использование околонаучных методов лечения.

В настоящее время разработано мобильное приложение ASpine для самоконтроля при болезни Бехтерева, которая работает на всех современных смартфонах. Программу можно скачать бесплатно.

Специалисты лаборатории спондилоартритов и псориатического артрита ФГБНУ НИИР им. В.А. Насоновой, являются главными экспертами в лечении и диагностике анкилозирующего спондилита (Болезни Бехтерева).

 

Запишитесь на приём к специалисту:

 

это не развлечение, а опасная болезнь

Развитие современных технологий, доступность для населения участия в азартных играх, привел нашу страну не только к изменению условий жизни, но и появлению новых психологических зависимостей.

Некоторым игровые автоматы или лотереи кажутся развлечением и безобидным средством для снятия стресса.

Агенты игровой зависимости бесконечно разнообразны. Кроме игровых автоматов, к ним относятся картежные игры (покер, Блек-Джек и др.), домино и рулетка. Азартные игры как форма досуга или развлечения существуют повсеместно, и подавляющее большинство людей иногда играют в казино, на игровых автоматах, ходят на бега, бьются об заклад, покупают лотерейные билеты. В связи с этим многие американские исследователи считают азартные игры серьезной социальной проблемой, представляющей угрозу для части населения. Проблема усугубляется тем, что в процессе игры в ряде случаев возникают расслабление, снятие эмоционального напряжения, отвлечение от неприятных проблем и игра рассматривается как приятное проведение времени. По этому механизму постепенно наступает втягивание и развивается зависимость.

В современной психологической литературе азартная игра определяется как перераспределение благ в условиях преднамеренного риска, когда одна сторона теряет, а другая сторона приобретает, без участия в производстве данных благ, при единственном детерминирующем факторе случая.

Игроманию можно определить как такую форму привычной зависимости, когда приобретение благ в результате игры случая становится главным способом удовлетворения возникающей напряженной потребности с целью обогащения.

Актуальность проблемы патологической зависимости от игр рассматривается в связи с тремя основными причинами. 1) Возникновение социальных и финансовых проблемы у патологических игроков: 23% игроков имеют финансовые проблемы, 35% разведены, у 80% нарушены межличностные отношения в браке. 2) Распространенностью противоправных действий — до 60% среди зависимых от азартных игр совершают правонарушения. 3) Высоким суицидальным риском — от 13 до 40% патологических игроков совершают попытки самоубийства, у 32-70% отмечаются суицидальные мысли.

Опрос, проведенный в прошлом году в ряде стран Европы, показывает, что 33% подростков в возрасте от 12 до 17 лет играют в бесплатные азартные игры он-лайн. Такие игры удобны и легкодоступны, а так же к ним можно получить доступ из дома, часто без родительского контроля. Их новизна, высокий уровень стимуляции и

низкий уровень физической нагрузки так же является призывом для молодых людей, многие из которых технически развиты.

Патологическое влечение к азартным играм относится к группе психических расстройств. В Международной классификации болезней 10-го пересмотра, основным диагностическим критерием данного заболевания является постоянно повторяющееся участие в азартной игре, которое продолжается и часто усугубляется, несмотря на социальные последствия.

Не во всех странах, игровая зависимость принята как болезнь. В России она внесена в официальный диагностический справочник. В США тоже. Во многих странах Европы подход к этому вопросу гораздо менее лоялен, игровая зависимость считается чем-то вроде вредной привычки.

За рубежом на проблему игровой зависимости обратили внимание около 30 лет назад. Игровая зависимость в США включена Американской ассоциацией психиатров в список психических заболеваний, которой подвержены 2-3% взрослого населения. Четыре из пяти случаев игровой зависимости приходится на мужчин (в основном в возрасте 20-30 лет), и более 90% начинают играть с подросткового возраста. Зависимые игроки идут на большие затраты денег и сил, а также предпринимают активные мыслительные усилия для достижения выигрыша.

Данная зависимость относится к нехимическим видам аддикции и известна как гэмблинг. Она проявляется в безудержном желании постоянно участвовать в бесконечных эпизодах азартной игры, превращаясь в потребность и доминанту, подавляя все другие проявления потребностей — начиная с физиологических и заканчивая высшими духовными. Показательно, что даже потребность в безопасности, базальная для человека, нейтрализуется и перестает быть движущей силой поведения в условиях охватившего азарта. Проблема характера и степени игровой зависимости, познание личностных особенностей играющего человека и характера осуществляемой психологической деструкции его в контексте вышесказанного приобретают особый смысл и актуальность.

Гемблинг (от англ. слова Gamble) — рискованное предприятие, азартная игра. Выделяют «нормальную» и патологическую разновидности гэмблинга.

Непатологический гэмблинг — действие с риском утраты чего-то ценного (обычно денег) при неопределенном исходе и надежде выиграть что-то большей ценности. Непатологических игроков еще называют социализированными азартными игроками, т.е. людьми, еще не утратившими самоконтроля в игре.

Патологический гэмблинг, согласно американской классификации DSM-IV: расстройство контроля над влечениями, характеризующееся дезадаптирующим повторяющимся повелением в виде игромании.

имеющим разрушительные последствия для семейной, профессиональной и социальной жизни. Игроманией, как правило, называют патологический гэмблинг.

Некоторыми авторами игром&ния рассматривается как частный вариант зависимого поведения. По их мнению, актуальность проблемы определяется тем, что расстройство характеризуется:

  • поражением лиц молодого возраста;
  • быстрой десоциализацией этих людей, влекущей значительный прямой и косвенный экономический ущерб для каждого из них, их семей и общества в целом;
  • высокой общественной опасностью этого расстройства — криминализацией и виктимизацией больных;
  • наличием большого числа коморбидных расстройств;
  • отсутствием единого понимания природы психопатологии, клинической динамики, подходов к терапии и профилактике данного расстройства.

В США существуют специальные критерии, по которым человека можно диагностировать как патологического игрока. Их девять: частое участие в игре и добывание денег для игры; частое участие в игре на большие суммы денег в течение более длительного периода, чем субъект намеревался; потребность увеличивать размеры и частоту ставок, чтобы достигнуть желаемого возбуждения; беспокойство или раздражительность, если игра срывается; повторная потеря денег в игре и взятие их взаймы «до завтра», чтобы отыграть потерю; неоднократные попытки уменьшить или прекратить участие в игре; учащение игры в ситуации, когда грозит выполнение своих профессиональных или социальных обязанностей; принесение в жертву некоторых важных социальных, профессиональных или увеселительных мероприятий ради игры; продолжение игры, несмотря на неспособность заплатить растущие долги.

Подводя итог, можно сказать следующее. Патологическое влечение к азартным играм относится к группе психических расстройств. Данная зависимость относится к нехимическим видам аддикции и известна как гэмблинг. Она проявляется в безудержном желании постоянно участвовать в бесконечных эпизодах азартной игры, превращаясь в потребностную доминанту, подавляя все другие проявления потребностей.

Признаки игровой зависимости: давно увлечен игрой в ущерб работе, финансовому состоянию и семейным отношениям; хочет прекратить игру, но не может остановиться; задолжал денег родным, знакомым; говорит им неправду о том, где провел время и на что тратил деньги; в случае выигрыша не может остановиться и уйти в плюсе, а продолжает игру с целью выиграть еще больше, и в результате уходит в минус. Механизм формирования игровой зависимости основан на частично неосознаваемых стремлениях, потребностях: уход от реальное™ и принятие роли.

В процессе игры возникают расслабление, снятие эмоционального напряжения, отвлечение от неприятных проблем и игра рассматривается как приятное проведение времени. По этому механизму постепенно развивается зависимость. Лдднкция к игре начинается тогда, когда после участия в ней человек продолжает с большим постоянством думать об игре и стремится снова участвовать в ней.

Факторы формирования и признаки аддикцми от азартных игр.

В случаях участия в азартных играх бывает довольно трудно определить начало становления аддмктивного процесса, так как адднкция развивается постепенно, исподволь и к ней полностью отсутствует критическое отношение.

В настоящее время можно выделить некоторые предрасполагающие факторы, создающие повышенный риск развития этой формы аддиктивного поведения. К ним относятся неправильное воспитание в семье, включая его различные варианты: недостаточную опеку, непостоянство и не прогнозируемость отношений, чрезмерную требовательность, сочетаемую с жестокостью, установки ка престижность. Большое значение имеют участие в играх родителей, знакомых, частые игры в домашней обстановке на глазах у ребенка или подростка. Имеются данные о том, что благоприятную почву для развития игровой аддикции создает «вещизм», переоценка значения материальных благ, фиксирование внимания в семье на финансовых возможностях и затруднениях, зависть к более богатым родственникам или знакомым, убеждение в том, что все проблемы в жизни связаны только с отсутствием денег.

Венгерский психоаналитик Шандор Ференци выдвинул другое объяснение, которое получило название «гипотеза инфантильного всемогущества». Ференци считал, что совсем маленький ребенок не догадывается о своей беспомощности. Лежа в кроватке, он управляет поведением взрослых, повелевая кормить, переодевать и развлекать маленького тирана. Со временем, когда ребенок учится ходить, падает и ушибается, иллюзия всемогущества начинает рассеиваться. Большинство из нас теряет чувство всемогущества к детсадовскому возрасту. Но время от времени оно вновь оживает — например, во время игры, когда игрок впадает в иллюзию, будто он может угадать номера, которые должны выпасть. Каждому, кто когда-нибудь играл в казино или на бирже, знакомо это чувство абсолютной уверенности в успехе, которое является отголоском инфантильного всемогущества.

Помимо психоаналитических существуют и другие объяснения поведения игроков. Страсть к игре связывают, например, со склонностью к риску или потребностью в острых ощущениях. Социологические исследования показывают, что в азартные игры чаще всего играют люди двух типов. Большая их часть имеет очень спокойные и даже скучные профессии (бухгалтер, библиотекарь, ветеринар), а остальные заняты профессиональной деятельностью, связанной с высоким риском (полицейские, биржевые маклеры, хирурги). Первые делают это из-за нехватки острых ощущений в повседневной жизни, а у вторых склонность к риску является, по-видимому, устойчивой чертой характера.

Генетические исследования, проводимые на детях и взрослых показали, что существуют определенные различия в интенсивности синтеза эндорфинов в популяции людей. Оказалось, что существуют ферменты (катализаторы), которые разрушают опиоидные пептиды. У людей, подверженных состоянию зависимости, активность этого фермента повышена, вследствие чего наблюдается внутренний дефицит опиоидов, которые обеспечивают состояние удовольствия и положительных эмоций.

Человек чаще всего эту зависимость любит, потому что она приносит ему удовольствие. Чаще всего любая зависимость, в том числе и игровая, фиксируется на состоянии комфорта, в случае игроков • это выигрыш. Игра заполняет собой в сознании и в жизни игрока некую пустую нишу, потребность в заполнении которой очень высока. Это может быть нехватка любви, внимания, восхищения.

Вместе с тем, выявлено несколько основных причин появления игромании (лудомании, игровой зависимости).

Прежде всего, это чувство одиночества. Чувство одиночества заставляет человека впервые прибегнуть к игре, а полученные впечатления и ощущения в процессе игры заставляют вернуться к ней в очередной раз.

Чувство неудовлетворенности. Эго чувство заставляет человека проявлять себя в игре. Являясь недостаточно реализованным в реальной жизни, недовольным собой, человек пытается выразиться в игре, где гораздо легче стать «победителем», чем в реальной жизни. И чем успешнее его результаты в игре, тем больше ему хочется вернуться к ней вновь и вновь.

Чувство легкой наживы. Это касается в первую очередь азартных игр, таких, как игровые автоматы, игры в казино и прочие. Получив один раз выифыш, и ощутив приток адреналина от обладания столь легко доставшимися деньгами, человек пытается повторить свой успех в игре, который зачастую не удается.

Легкая податливость разного рода зависимостям. И громами* (лудомания, игровая зависимость) является риском для людей, имеющих любые другие зависимости, например, наркотическую или алкогольную.

Психические расстройства разной степени и характеристики. Люди, некогда лечившиеся от психических расстройств также подвержены такому заболеванию, как игромания (лудомания, игровая зависимость). Установлен высокий уровень их податливости азартным играм, вследствие чего и возникает игромания (лудомания).

Лица с игровой зависимостью имеют следующие личностные особенности:

  • высокую «социальную смелость» — склонность к риску, расторможенность, аномальный стиль поведения;
  • «подверженность чувствам» — склонность к непостоянству, подверженность влиянию случая и обстоятельств, снижение соблюдения общепринятых норм и запретов в поведении н межличностных контактах;
  • «экспрессивность» — эмоциональная дезориентация мышления, спонтанная вера в удачу;
  • «напряженность» • активная неудовлетворенность стремлений;
  • «неустойчивость самоконтроля» — конфликтность представлений о себе; неадекватность самооценки (независимо от возрастной группы).

Устойчивые ремиссии в основном отмечались у лиц с высоким реабилитационным потенциалом, благополучным преморбндом, монозависимостъю. состоящие в браке, имеющие постоянную работу, участвующие в продолжительных лечебно-реабилитационных программах.

Следует помнить, что игромания (лудомания) — это достаточно серьезное заболевание. И, если вы обнаружили признаки игроманни (лудомании) у своего родственника, знакомого или близкого человека, следует незамедлительно принимать меры по его лечению. Иначе игромания (лудомания) может привести к непоправимым последствиям.

Лечением игромаиии занимаются врачи-психиатры-иаркологи, психотерапевты и успех лечения зависит в первую степень от того, насколько истинным является желание пациента излечиться и как врач заинтересует пациента на преодоление этого недуга. В первую очередь лечение должно быть последовательным и непрерывным. Очень важно при таком заболевании, как игромания, лечение которой должно проводиться при полном согласии больного, участие родственников и близких людей пациента.

Поддержка со стороны близких поможет значительно быстрее и эффективннее справиться с этим недугом.

СПИСОК организаций, оказывающих помощь при игравой зависимости на территори г. Минска и Минской области:  

  1. ГУ «Республиканский научно-практический центр психического здоровья» 220053 г. Минск Долгиновский тракт, 152 8(017)3353066, 2898910
  2. УЗ «Городской клинический наркологический диспансер» г. Минск 220035, ул. Гастелло 16 8(017) 2034702, 2030422, 2509062
  3. УЗ «Минский областной клинический центр «Психиатрия-наркология» 220013 г. Минск, П.Бровки 7 8(017) 3318496, 3317970   
  4. УЗ «Молодеченский психоневрологический диспансер»  223310 г. Молодечно ул. В.Гастинец 58 (801765)80504, 80405
  5. УЗ «Солигорскмй психоневрологический диспансер»  223710 г. Солигорск ул. Коржа 1  (801740)220068, 220076   
  6. УЗ «Борисовский психоневрологический диспансер»   222120 г. Борисов ул. Связная, 47  (801779)932500

Сохранить

Сохранить

Сохранить

Сохранить

Сохранить

Сохранить

Сохранить

Неуязвимые.

«В Мире науки» №3, 2021

Существуют ли люди, от природы не подверженные инфекционным заболеваниям? В американском блокбастере «Заражение», который многие сегодня называют пророческим, нам показывают историю распространения некоего нового природного вируса, на наших глазах поражающего огромное количество людей. Практически все умирают — вирус оказывается высококонтагиозным и патологичным. Однако один из главных героев, персонаж Мэтта Деймона, не заболел, хотя находился в самом эпицентре эпидемии. Почему он оказался не подверженным этому вирусу? Можно ли объяснить такой феномен с научной точки зрения? Действительно ли одни люди рискуют заразиться, а другим это по какой-то причине не грозит? Если да, то можно ли использовать это свойство на благо всего человечества? Эти вопросы мы задали нашим экспертам.

Виталий Васильевич Зверев, академик, заведующий кафедрой микробиологии, вирусологии и иммунологии Сеченовского университета, научный руководитель НИИ вакцин и сывороток им. И.И. Мечникова:

Вы задаете непростые вопросы. Вирусов — огромное разнообразие, и мы знаем далеко не все. Но теоретически такое вполне возможно. Мы все знаем, насколько тяжелое заболевание ВИЧ- инфекция и какой серьезной проблемой становится ее широкое распространение. Но ведь известно. что есть люди, которые заражаются, но никогда не болеют. Их очень мало. Это те люди, которые имеют мутацию в гене — рецепторе к этому вирусу. Таких людей больше всего среди финно-угорских народов. У них вирус попадает в организм, но там не размножается, не заражает клетки и люди не болеют. К сожалению, это один из тех немногих случаев, которые нам известны.

Конечно, то, как люди переносят заболевание, во многом зависит от дозы заражения. Каждый вирус имеет свой уровень контагиозности. Например, для того чтобы человек заболел корью, не нужно большое количество вируса. Или та же самая ВИЧ-инфекция. Здесь очень важно, какое количество вируса попадает в организм человека, и тогда иммунная система с этим справляется или не справляется.

Наши последние исследования как раз нацелены на то, чтобы не убивать вирус, который попадает в организм человека, а ограничивать его количество, чтобы можно было создать иммунитет к нему, но при этом не болеть тяжело. Это один из возможных подходов.

А вообще здесь можно действовать на три мишени. Ведь что такое заражение вирусом? Это сам вирус; это тот рецептор, к которому вирус присоединяется; и, наконец, это иммунная система человека, который борется с этим вирусом. Для того чтобы понять, заболеет человек или нет, нужно изучить эти три позиции. Сейчас пришел новый коронавирус, а завтра придет какой-нибудь кишечный вирус или что-то еще. Каждый раз это новые пути заражения, новый источник инфекции.

Можно сколько угодно создавать противовирусные препараты, но они будут работать только против того вируса, с которым мы боремся, а с новым они уже бороться никак не смогут.

То же самое касается рецепторов. Все рецепторы вирусов имеют определенную функцию. Один из них у коронавируса, шиповидный белок-рецептор на поверхности вириона — это рецептор для связывания с ангиотензинпревращающим белком-рецептором на поверхности клеток человека. Это важнейший рецептор, который играет огромную роль в нашей жизнедеятельности. Можно, конечно, заблокировать на какое-то время эти рецепторы, но это тоже будет не очень хорошо. А можно, например, сделать упор на то, чтобы найти те точки иммунной системы, которые отвечают за развитие вируса, чтобы подавить его и одновременно вызвать небольшой иммунный ответ.

Это именно то, чем мы занимаемся вместе с Институтом общей генетики РАН и с новосибирским Институтом химической биологии и фундаментальной медицины СО РАН, с академиком В.В. Власовым. Дело в том, что ни один вирус не несет все то, что ему необходимо для развития. Он использует клеточные ферменты, белки человека, которые участвуют в регуляции иммунной системы. И можно на какое-то время прервать этот процесс, добившись таким образом того, что человек будет к этому вирусу какое-то время невосприимчив. Мы не можем надолго заблокировать компоненты иммунной системы. Но их можно будет отключить на короткий период, чтобы остановить процесс. Такие работы активно ведутся.

Виталий Васильевич, всем нам известны истории, когда вся семья заболела, а один человек — нет. Почему такое происходит? Ему просто повезло или у него тоже какая-то мутация? Есть ли какие-то научные исследования на эту тему?

Научных исследований на эту тему было не так много, и их трудно проводить. Мы же не можем специально заразить человека и посмотреть, как он будет себя чувствовать. Но такие семейные случаи, о которых вы говорите, действительно широко известны. Это касается и коронавируса. Что мы тут знаем наверняка? Как я уже сказал, многое зависит от дозы. Далее, известно, что дети заражаются, но. как правило, не болеют или болеют очень легко. Могу сказать по своей семье — у меня двое внуков. Мы все переболели, и все по-разному, причем независимо от возраста. У кого-то были пневмонии, у кого-то — только потеря вкуса. У меня всего один день была температура. Я даже не лечился ничем, а уровень антител у меня почти такой же, как у тех, кто переболел с серьезными симптомами. А вот дети вообще бессимптомно болели, при том, что уровень иммуноглобулина G y них выше, чем у тех, кто болел тяжело. Это особенность иммунной системы, и таких людей немало.

А как вы можете это объяснить? Почему так происходит? Знаю, что ваш сын болел достаточно тяжело, хотя он моложе вас.

Многое зависит от того, как человек заразился. У меня в организм, видимо, попало небольшое количество вируса, с которым моя иммунная система справилась. А у сына был очень тесный контакт с пациенткой, которая тяжело болела. У нее была коронавирусная пневмония, и он делал ей искусственное дыхание. То есть у него огромная доза вируса попала моментально, причем сразу в глубокие отделы дыхательных путей. От этого многое зависит — где вирус начинает размножаться. Плюс состояние иммунной системы. Это то, что мы сейчас и пытаемся искать: как, каким образом, какие гены включить, какие выключить, чтобы человек эту инфекцию перенес легко и даже незаметно. Это вопрос для изучения, но это очень перспективные исследования и они сейчас проводятся во всем мире.

Может быть, надо изучать эти мутации, которые позволяют таким людям не болеть, и каким-то образом использовать эти знания для остальных?

Все правильно. Это надо пытаться делать. Что касается ВИЧ, мы знаем про эту мутацию. Но ее искусственно пока сделать нельзя, да и надо ли — вот вопрос. Люди с этими мутациями наверняка имеют какой-то другой дефект. Все взаимосвязано. Поэтому все научные работы в этом направлении необходимы, но очень аккуратные, чтобы, пытаясь помочь, не навредить еще больше.

Николай Иванович Брико, академик, директор Института общественного здоровья, заведующий кафедрой эпидемиологии Сеченовского университета, главный эпидемиолог Минздрава России:

Николай Иванович, сегодняшняя наша тема — устойчивость к различным возбудителям болезней. Правда ли, что у разных людей эта восприимчивость разная, а есть люди вообще невосприимчивые к тем или иным возбудителям?

Да, сегодня накоплено достаточно фактического материала, который свидетельствует о гетерогенности человеческой популяции и разной восприимчивости не только к инфекционным болезням, но и вообще к любой патологии. Сегодня много данных, которые говорят о разной степени чувствительности или устойчивости к различным патогенам, с которыми сталкивается человек, как инфекционной, так и неинфекционной природы. Есть тут и гендерные различия. Мы знаем, что в этом «повинен» белок, ответственный за активацию клеточного иммунитета. Ген, обеспечивающий выработку этого белка, находится на Х-хромосоме, но, как известно, у женщин две Х-хромосомы, поэтому они могут болеть реже мужчин.

Изменчивость вирусов в значительной степени определяется адаптацией к условиям репродукции и механизмам противовирусной защиты клеток хозяина. На уровне популяций адаптация связана с особенностями типа HLA, определяющих специфичность распознавания вирусных антигенов. Генетический профиль популяции и уровень разнообразия гаплотипов HLA не только влияют на уровень заболеваемости, но и могут определять судьбу целых этнических групп населения, их численность и показатели преждевременной смертности. В такой многонациональной стране, как Россия, этот подход должен стать основой профилактического направления практической медицины.

Есть ли какие-то данные о нынешнем коронавирусе? Кто болеет чаще?

Мы получили и продолжаем получать много информации, которая характеризует и возбудитель, и патогенез заболевания. Выстроена довольно четкая схема и лечения, и профилактики. Но многие вопросы остаются неясными, до конца не изученными, и особенно это касается вопросов генетики. Есть данные о том, что мужчины болеют тяжелее, умирают чаще. Известны возрастные различия в восприятии инфекции. Но повторяю: это та область, которую надо изучать.

Мы знаем, что есть люди, невосприимчивые к ВИЧ-инфекции. А есть ли люди, резистентные к коронавирусной инфекции?

Мы пока не можем однозначно ответить на этот вопрос относительно COVID-19. Информации пока недостаточно. Но, скорее всего, такие люди есть. В отношении ВИЧ-инфекции есть, это известно. Этот факт связывают с определенными генами, которые кодируют рецепторные молекулы, используемые ВИЧ для проникновения в клетку. Они уже идентифицированы. Инактивация одного из генов блокирует инфицирование вирусом. Это чрезвычайно важное направление. В Китае впервые отредактирован геном человеческого эмбриона, в результате чего на свет появились генетически модифицированные близнецы. Что сделал ученый? Используя технологию CRISPRCas9, он удалил в эмбрионах гены, которые кодируют CCR5. Тем самым он сообщил этому эмбриону низкий риск заражения ВИЧ-инфекцией.

Но редактирование гена — это очень опасная вещь. Тот же ген CCR5 отвечает не только за восприимчивость к ВИЧ-инфекции. Оказалось, что он способствует нормальной работе лейкоцитов, и тут появляется риск заражения вирусом лихорадки Западного Нила. Вообще, использование этих технологий очень рискованно, потому что они не только удаляют этот ген, но и вносят какие-то изменения в ДНК. Это создает огромные этические проблемы, хотя, повторю, такие исследования имеют чрезвычайно большие перспективы. Устанавливая какую-то предрасположенность, мы видим, посредством каких генов это может реализоваться.

Как вы думаете, сколько может быть в процентном отношении людей, невосприимчивых к новой коронавирусной инфекции?

Это очень непростой вопрос, особенно применительно к новой, неизученной болезни. Однако, опираясь на исторический опыт, мы можем сказать, что даже такие мощные эпидемии, как черная оспа или легочная чума, затрагивали не всех людей. Умирало 20-30%, может быть, больше. Но остальные выживали и приобретали иммунитет. Определенная часть населения сталкивалась с возбудителем, но оставалась устойчивой к нему.

Как их вычислить? Думаю, тут надо учитывать данные, полученные в процессе реализации программ вакцинации. В человеческой популяции есть 5-10% людей, которые сильно реагируют на антигены, и есть примерно столько же слабо реагирующих. Эти данные надо учитывать, и тут мы подходим в какой-то мере к персонификации. Это один из разделов так называемой 5Р-медицины, о которой мы сейчас все чаще говорим. Предиктивная. предупредительная, предсказательная медицина, как и персонализированная, невозможна сегодня без генетических исследований.

Все люди обладают уникальной ДНК, а значит, и личным набором предрасположенностей и рисков. Предсказывать патологию и находить способы профилактики и лечения сегодня возможно только на основе генетических исследований. В последние 20-30 лет мы видим здесь фантастический взлет. Сегодня настала эпоха постгеномных исследований — это метагеномика, протеомика, транскриптомика, метаболомика, метагеномика и т.д. Известно уже более 150 лекарственных препаратов с указанием на генетический маркер. Современные достижения генетики человека делают возможным последовательное выведение системы профилактической медицины на уровень генетической персонализации.

Как вы думаете, может ли настать момент, когда человек приходит в поликлинику к своему участковому врачу, а тот говорит: «Вам обязательно надо сделать прививку от гриппа, потому что у вас высокая предрасположенность к тяжелому течению этого заболевания; а вот от коронавирусной инфекции необязательно — у вас нет к ней склонности»?

Я верю, что наступит этот момент. И это не очень далекое будущее. Препараты, которые уже используются, влияют на гены, предрасполагающие к развитию различных онкологических заболеваний, системных поражений. Накоплено немало данных применительно к инфекционным болезням. Думаю, в ближайшем будущем у каждого из нас будет генетический паспорт, в котором будет записано, какие гены связаны с риском того или иного заболевания. Сегодня в стадии реализации находится задача генетического анализа для определения риска развития социально значимых болезней. Здесь важно определение фенотипических проявлений ранних стадий заболевания, выделение групп повышенного риска на основе индивидуальных генетических особенностей. На базе развития генетики сформировалась новая наука — эпигенетика. Ее суть заключается в возможности корректировать работу генов человека образом жизни, питанием и профилактикой. Это означает, что. приоткрыв тайны организма пациента, врач сосредоточивает усилия на профилактике вероятных заболеваний и патологий пациента взамен традиционного лечения уже существующих болезней. Это позволяет сохранять здоровье на долгие годы и отодвигать процессы старения клеток. Таким образом, медицина будущего строится на основе подбора индивидуальных процедур, программ, препаратов и доз медикаментов, которые будут эффективны для конкретного человека.

Константин Валерьевич Крутовский, ведущий научный сотрудник Института общей генетики им. Н.И. Вавилова РАН. профессор кафедры геномики и биоинформатики и руководитель Научно-образовательного центра геномных исследований Сибирского федерального университета, профессор Геттингенского университета:

Константин Валерьевич, известно, что есть люди, устойчивые к тем или иным типам возбудителей инфекции. Во многом именно генетика может ответить на вопрос, каким людям грозит то или иное инфекционное заболевание, а каким нет. Как вы думаете, есть ли будущее у генетики в предсказании опасности вирусных заболеваний у конкретных людей?

Это вопрос персонифицированной медицины, когда на основании индивидуальных геномов человека мы можем предсказывать предрасположенность к тем или иным болезням. Чисто гипотетически можно на основании индивидуального генома человека сделать вывод, есть ли склонность к каким-либо аутоиммунным заболеваниям или пониженный иммунитет к разным патогенным. Такие исследования уже активно проводятся, и, конечно, в перспективе на их основе можно будет делать надежные предсказания.

Но тут есть еще один важный вопрос — врожденная устойчивость к болезням. Почему одни люди не заболевают даже при контакте с вирусами или болеют в очень легкой форме, а другие нет? В чем причина такого феномена? Может быть, человек когда-то уже контактировал с этим вирусом? Существует врожденный клеточный иммунитет.

Есть очень интересные исследования по эпигеномике, говорящие о том, что приобретенная устойчивость тоже может передаваться — необязательно на уровне замен нуклеотидов в ДНК, но через эпигенетические механизмы, через обратимые химические модификации нуклеотидов и хроматина.

С чем это связано? Врожденное ли это? Может быть, это обусловлено также тем, что у человека уже известны четыре вида коронавирусов — два альфа- и два бета-коронавируса, с которыми он давно и относительно мирно сосуществует? Причем бета-коронавирусы — это группа, к которой принадлежит SARS CoV-2. Они уже есть у человека, давно открыты и обычно вызывают легкие респираторные заболевания. То есть они адаптировались к организму человека. И, возможно, тот иммунитет, который к ним вырабатывается, особенно у тех людей, которые переболели этими коронавирусами, включает как некий бонус устойчивость к новому для человека коронавирусу.

Это одно из возможных научных объяснений, но этот вопрос надо изучать. Если предположение верно, у нас появляется надежда, что и нынешний вирус тоже адаптируется. Вирусу вообще невыгодно убивать хозяина, потому что с его гибелью он погибает сам. Эволюционно он заинтересован наносить минимальный вред, но при этом быть максимально инфекционным, то есть заразным. Поэтому естественный отбор отбирает те мутации, которые снижают его летальность, патогенность, но увеличивают его контагиозность. И у нас есть много примеров таких вирусов: некоторые аденовирусы, коронавирусы, вирусы гриппа и др.

Но ведь не со всеми вирусами так произошло.

Да, не со всеми. С вирусами оспы, кори, полиомиелита этого не случилось. Поэтому надо вакцинироваться. Я считаю, что вакцинирование — это гражданский долг каждого, потому что защищаешь не только себя, но и других. Это помогает создать так называемый популяционный иммунитет, который позволит прервать текущую пандемию. Чем быстрее и чем больше людей переболеет или вакцинируется, тем лучше. Но лучше не болеть, поскольку это вызывает и тяжелые осложнения, и жертвы.

Знаю, что сейчас очень много колеблющихся. Люди боятся вакцинации, не доверяют ей. Думаю, всем, кто вакцинируется, необходимо давать специальную медицинскую страховку на случай возможных осложнений. Они редкие, но могут быть. Такая страховка важна, чтобы была медицинская гарантированная помощь, какое-то финансирование или даже существенная компенсация. Подобную программу должно предусмотреть государство, заинтересованное в массовой вакцинации.

Верно ли я понимаю, что развитие вирусологии без генетики сегодня невозможно?

Да, все верно. Без генетики сегодня ни одна биологическая дисциплина не может нормально развиваться, поскольку это основа основ: ведь гены регулируют все функции организма. Генетика, я считаю, — одна из ключевых биологических дисциплин. Это наука о наследственности и изменчивости у всех живых организмов, где есть гены, есть ДНК, есть генетический контроль, где совершаются мутации, возникает изменчивость, а на ее основе происходят адаптация и эволюция. Понимание этих механизмов, адаптации и эволюции, того, как вирус эволюционирует, без генетики, конечно, невозможно. Как и создание вакцин, имеющих минимальное количество побочных последствий, невозможно себе представить без генетики.

Для создания таких современных, высокоэффективных и безопасных вакцин надо знать устройство генома, его последовательности, а сейчас это можно делать на уровне генетического текста, прочитывая его с помощью секвенирования. Сегодня научились выделять именно те фрагменты белка, которые вызывают наиболее сильный иммунный ответ, но минимальные побочные эффекты. Это так называемые пептидные вакцины, например «ЭпиВакКорона», разработанная в центре «Вектор». Их не надо путать с так называемыми векторными вакцинами, которые используют другой принцип. Благодаря молекулярной генетике, геномике и генной инженерии в этой области также достигнут громадный прогресс.

Одна из таких векторных вакцин — наш «Спутник V». В основе этой вакцины — модифицированный и неспособный к репликации относительно безопасный для человека аденовирус, в него встроен S-ген от SARSCoV-2, кодирующий шиповидный белок, на который образуются антитела и формируется иммунитет. В данном случае аденовирус служит только носителем, вектором, призванным доставить ген коронавируса внутрь клетки, где он будет экспрессироваться, и на него будут нарабатываться антитела, таким образом формируя иммунитет.

Есть еще более продвинутые вакцины на основе только одного или двух генов SARSCoV-2 в виде матрицы мРНК, когда эта матрица внутри липидной наночастицы через инъекцию вводится в организм и затем проникает внутрь клетки, где идет ее считывание и происходит синтез специфичного белка, характерного для коронавируса. На него в результате и формируется иммунитет.

Думаю, в будущем наука и медицина придут к тому, что человек сможет узнать, нужна ли ему вакцинация от той или иной вирусной инфекции (и какую вакцину ему нужно предпочесть) или ему эта болезнь не грозит, потому что у него есть врожденный или приобретенный иммунитет к ней. А пока наука не научилась предсказывать это быстро и точно, необходимо массово вакцинироваться.

Беседовала Наталия Лескова

Фото: scientificrussia.ru


Ссылка на публикацию: scientificrussia.ru

Влияние истории эволюции на здоровье и болезни человека

  • 1.

    Альфельди Дж. и Линдблад-Тох К. Сравнительная геномика как инструмент для понимания эволюции и болезней. Рез. генома. 23 , 1063–1068 (2013).

    ПабМед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 2.

    Медоуз, Дж. Р. С. и Линдблад-Тох, К. Анализ эволюции и болезней с использованием сравнительной геномики позвоночных. Нац.Преподобный Жене. 18 , 624–636 (2017).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 3.

    Shendure, J. et al. Секвенирование ДНК в 40 лет: прошлое, настоящее и будущее. Природа 550 , 345–353 (2017).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 4.

    Karczewski, K.J. et al. Спектр мутационных ограничений количественно определен по вариациям у 141 456 человек. Природа 581 , 434–443 (2020).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 5.

    Bycroft, C. et al. Ресурс UK Biobank с глубоким фенотипированием и геномными данными. Природа 562 , 203–209 (2018).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 6.

    Dewey, F. E. et al. Распределение и клиническое влияние функциональных вариантов в 50 726 последовательностях полного экзома из исследования DiscovEHR. Наука 354 , aaf6814 (2016).

    ПабМед Google Scholar

  • 7.

    McCarty, C.A. et al. Сеть eMERGE: консорциум биорепозиториев, связанных с данными электронных медицинских карт для проведения геномных исследований. БМС Мед. Геномика 4 , 13 (2011).

    ПабМед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 8.

    Тимпсон, Н.Дж., Гринвуд, К.М.Т., Соранзо, Н., Лоусон, Д.Дж. и Ричардс, Дж.Б. Генетическая архитектура: форма генетического вклада в человеческие черты и болезни. Нац. Преподобный Жене. 19 , 110–124 (2018).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 9.

    Орландо Л., Гилберт М. Т. П. и Виллерслев Э. Реконструкция древних геномов и эпигеномов. Нац. Преподобный Жене. 16 , 395–408 (2015).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 10.

    Скоглунд П. и Мэтисон И. Древняя геномика современного человека: первое десятилетие. год. Преподобный Геномикс Хам. Жене. 19 , 381–404 (2018).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 11.

    Ramamoorthy, A., Yee, S.W. & Karnes, J. Открытие генетической архитектуры болезней человека для точной медицины. клин. Перевод науч. 12 , 3–5 (2019).

    ПабМед Google Scholar

  • 12.

    Стернс, С. К. и Меджитов, Р. Эволюционная медицина (Sinauer Associates, 2016). Этот базовый учебник представляет собой введение в область эволюционной медицины .

  • 13.

    Carroll, S.P. et al. Применение эволюционной биологии для решения глобальных проблем. Наука 346 , 1245993 (2014).

    ПабМед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 14.

    Young, MJ & Copeland, WC Механизм репликации митохондриальной ДНК человека и болезни. Курс. мнение Жене. Дев. 38 , 52–62 (2016).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 15.

    Муньос С. и Мендес Дж. Стресс репликации ДНК: от молекулярных механизмов до болезней человека. Хромосома 126 , 1–15 (2017).

    ПабМед Google Scholar

  • 16.

    Акерманн М., Чао Л., Бергстрем С. Т. и Доебели М. Об эволюционном происхождении старения. Aging Cell 6 , 235–244 (2007).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 17.

    Флэтт Т. и Партридж Л. Горизонты эволюции старения. БМС Биол. 16 , 93 (2018).

    ПабМед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 18.

    Рокас, А. Истоки многоклеточности и ранняя история набора генетических инструментов для развития животных. год. Преподобный Жене. 42 , 235–251 (2008).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 19.

    Albuquerque, T. A. F., Drummond do Val, L., Доэрти, А. и де Магальяйнс, Дж. П. От людей к гидре: модели рака на древе жизни. биол. Ред. 93 , 1715–1734 (2018).

    ПабМед Google Scholar

  • 20.

    Креспи Б. и Саммерс К. Эволюционная биология рака. Тренды Экол. Эвол. 20 , 545–552 (2005).

    ПабМед Google Scholar

  • 21.

    Кинзлер, К. В. и Фогельштейн, Б. Гены предрасположенности к раку. Привратники и сторожа. Природа 386 , 761 (1997).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 22.

    Мичор Ф., Иваса Ю. и Новак М.А. Динамика прогрессирования рака. Нац. Преподобный Рак 4 , 197–205 (2004).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 23.

    Домазет-Лошо, Т. и Таутц, Д. Филостратиграфическое отслеживание генов рака предполагает связь с появлением многоклеточности у метазоа. БМС Биол. 8 , 66 (2010).

    ПабМед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 24.

    Томас, Ф. и др. Применение экологической и эволюционной теории к раку: долгий и извилистый путь. Эволюция. заявл. 6 , 1–10 (2013).

    ПабМед Google Scholar

  • 25.

    Vogelstein, B. et al. Ландшафты генома рака. Наука 340 , 1546–1558 (2013).

    Google Scholar

  • 26.

    Актипис, К.А. и Нессе, Р.М. Эволюционные основы биологии рака. Эволюция. заявл. 6 , 144–159 (2013).

    ПабМед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 27.

    Gerlinger, M. et al. Рак: эволюция в течение жизни. год. Преподобный Жене. 48 , 215–236 (2014).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 28.

    Энрикес-Навас, П. М., Войтковяк, Дж. В. и Гейтенби, Р. А. Применение эволюционных принципов к терапии рака. Рак Рез. 75 , 4675–4680 (2015).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 29.

    Герстунг, М.и другие. Эволюционная история 2658 видов рака. Природа 578 , 122–128 (2020). В этом исследовании анализируется эволюция соматических мутационных процессов и реконструируется история жизни 38 различных типов рака на основе полногеномных последовательностей 2658 опухолей .

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 30.

    Hibino, T. et al. Репертуар иммунных генов, закодированный в геноме пурпурного морского ежа. Дев. биол. 300 , 349–365 (2006).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 31.

    Джонс, Дж. Д. Г. и Дангл, Дж. Л. Иммунная система растений. Природа 444 , 323–329 (2006).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 32.

    Флайник, М. Ф. и Касахара, М. Происхождение и эволюция адаптивной иммунной системы: генетические события и давление отбора. Нац. Преподобный Жене. 11 , 47–59 (2010).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 33.

    Chuong, E.B., Elde, N.C. & Feschotte, C. Регуляторная эволюция врожденного иммунитета посредством кооптации эндогенных ретровирусов. Наука. 351 , 1083–1087 (2016). Это исследование представляет собой пример совместного использования древних геномных элементов (эндогенных ретровирусов) для создания новых регуляторных элементов в иммунной системе млекопитающих .

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 34.

    Dunne, D. W. & Cooke, A. Взгляд червя на иммунную систему: последствия для эволюции аутоиммунных заболеваний человека. Нац. Преподобный Иммунол. 5 , 420–426 (2005).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 35.

    Шубин Н., Табин С. и Кэрролл С. Глубокая гомология и истоки эволюционной новизны. Природа 457 , 818–823 (2009).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 36.

    Шубин, Н. Ваша внутренняя рыба: путешествие в 3,5-миллиардную историю человеческого тела (Knopf Doubleday, 2008).

  • 37.

    Гернси, М. В., Чуонг, Э. Б., Корнелис, Г., Ренфри, М. Б. и Бейкер, Дж. К. Молекулярная консервация плацентации и лактации сумчатых и плацентарных. eLife 6 , e27450 (2017).

    ПабМед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 38.

    Эббот П. и Капра Дж. А. Что такое плацентарное млекопитающее? Многие функции развития у сумчатых и плацентарных млекопитающих выполняются разными тканями, но с одинаковыми генами. eLife 6 , e30994 (2017).

    ПабМед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 39.

    Кац, П.С. «Модельные организмы» в свете эволюции. Курс. биол. 26 , Р649–Р650 (2016).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 40.

    Болкер, Дж. А. Выбор моделей: эволюция и выбор видов для поступательных исследований. Поведение мозга. Эвол. 93 , 82–91 (2019). В этом обзоре представлены рекомендации по учету эволюционного контекста при выборе модельных организмов для поступательных исследований .

    ПабМед Google Scholar

  • 41.

    Bart van der Worp, H. et al. Могут ли животные модели болезней достоверно информировать об исследованиях человека? PLoS Мед. 7 , 1–8 (2010).

    Google Scholar

  • 42.

    Мак, И.В.Ю., Эваниев, Н. и Герт, М. Трудности перевода: модели на животных и клинические испытания в лечении рака. утра. Дж. Пер. Рез. 6 , 114–118 (2014).

    ПабМед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 43.

    Каулин, А. Ф. и Мэйли, К. С. Парадокс Пето: рецепт эволюции для предотвращения рака. Тренды Экол. Эвол. 26 , 175–182 (2011).

    ПабМед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 44.

    Tollis, M. et al. Вернуться в море, стать огромным, победить рак: анализ геномов китообразных, включая сборку горбатого кита ( Megaptera novaeangliae ). Мол. биол. Эвол. 36 , 1746–1763 (2019).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 45.

    Сулак, М. и др. Увеличение количества копий TP53 связано с эволюцией увеличения размера тела и усиленной реакцией на повреждение ДНК у слонов. eLife 5 , e11994 (2016).

    ПабМед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 46.

    Васкес, Дж. М., Сулак, М., Чигурупати, С. и Линч, В. Дж. Ген зомби LIF у слонов активируется TP53, чтобы вызвать апоптоз в ответ на повреждение ДНК. Cell Rep. 24 , 1765–1776 (2018). Это исследование находит молекулярное объяснение парадокса Пето — почему у слонов не высокий уровень заболеваемости раком, учитывая их большое количество клеток? — в рефункционализации LIF6 псевдогена с проапоптотическими функциями .

    КАС пабмед Google Scholar

  • 47.

    О’Бленесс, М., Сирлз, В.Б., Варки, А., Ганье, П. и Сикела, Дж.М. Эволюция генетических и геномных особенностей, уникальных для человеческой линии. Нац. Преподобный Жене. 13 , 853–866 (2012).

    ПабМед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 48.

    Паттерсон Н., Рихтер Д. Дж., Гнерре С., Ландер Э.С. и Райх, Д. Генетические доказательства сложного видообразования человека и шимпанзе. Природа 441 , 1103–1108 (2006).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 49.

    Crespi, B.J. & Go, M.C. Диаметральные заболевания отражают эволюционно-генетические компромиссы: данные психиатрии, неврологии, ревматологии, онкологии и иммунологии. Эволюция. Мед. Общественное здравоохранение 2015 , 216–253 (2015). В этой статье описывается широкое влияние генетических компромиссов на различные заболевания человека .

    ПабМед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 50.

    Stearns, S.C. Компромиссы в эволюции истории жизни. Функц. Экол. 3 , 259 (1989).

    Google Scholar

  • 51.

    Риклефс Р. Э. и Викельски М. Связь физиологии и истории жизни. Тренды Экол. Эвол. 17 , 462–468 (2002).

    Google Scholar

  • 52.

    Зера, А. Дж. и Харшман, Л. Г. Физиология компромиссов в жизненном цикле животных. год. Преподобный Экол. Сист. 32 , 95–126 (2001).

    Google Scholar

  • 53.

    Brady, S.P. et al. Понимание дезадаптации путем объединения экологической и эволюционной точек зрения. утра. Нац. 194 , 495–515 (2019).

    ПабМед Google Scholar

  • 54.

    Эллисон, П. Т. Эволюционные компромиссы. Эволюция. Мед. Здравоохранение 2014 , 93 (2014).

    ПабМед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 55.

    Al-Nbaheen, M. et al. Стромальные (мезенхимальные) стволовые клетки человека из костного мозга, жировой ткани и кожи обнаруживают различия в молекулярном фенотипе и потенциале дифференцировки. Stem Cell Rev. Rep. 9 , 32–43 (2013).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 56.

    Jacqueline, C. et al. Рак: болезнь на перекрестке компромиссов. Эволюция. заявл. 10 , 215–225 (2017).

    ПабМед Google Scholar

  • 57.

    Маркес-Боне, Т. и Эйхлер, Э. Э. Эволюция сегментарных дупликаций человека и гипотеза основного дупликона. Гавань Колд Спринг. Симпозиум Квант. биол. 74 , 355–362 (2009).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 58.

    Деннис, М. Ю. и Эйхлер, Э. Э. Адаптация и эволюция человека путем сегментарного дублирования. Курс. мнение Жене. Дев. 41 , 44–52 (2016).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 59.

    Фиддес, И.Т. и др. Гены NOTCh3NL , специфичные для человека, влияют на передачу сигналов Notch и корковый нейрогенез. Cell 173 , 1356–1369.e22 (2018).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 60.

    Suzuki, I.K. et al. Гены NOTCh3NL , специфичные для человека, расширяют корковый нейрогенез посредством регуляции Delta/Notch. Cell 173 , 1370–1384.e16 (2018).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 61.

    Guerrier, S. et al. Домен F-BAR srGAP2 индуцирует выпячивания мембраны, необходимые для миграции и морфогенеза нейронов. Сотовый 138 , 990–1004 (2009).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 62.

    Dennis, M.Y. et al. Эволюция специфичных для человека нейральных генов SRGAP2 путем неполной сегментарной дупликации. Cell 149 , 912–922 (2012).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 63.

    Флорио, М. и др. Ген, специфичный для человека ARHGAP11B , способствует базальной амплификации предшественников и расширению неокортекса. Наука 347 , 1465–1470 (2015).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 64.

    Antonacci, F. et al. Палиндромные дупликоны ядра GOLGA8 способствуют микроделеции хромосомы 15q13.3 и эволюционной нестабильности. Нац. Жене. 46 , 1293–1302 (2014).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 65.

    Сикела, Дж. М. и Сирлз Квик, В. Б. Геномные компромиссы: являются ли аутизм и шизофрения высокой ценой человеческого мозга? Гул. Жене. 137 , 1–13 (2018).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 66.

    Шринивасан, С. и др. Генетические маркеры эволюции человека обогащены шизофренией. биол. Психиатрия 80 , 284–292 (2016).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 67.

    Полиманти, Р. и Гелернтер, Дж. Широко распространенные признаки положительного отбора в аллелях общего риска, связанных с расстройством аутистического спектра. Генетика PLoS. 13 , 1–14 (2017).

    Google Scholar

  • 68.

    Сюй, К., Шадт, Э. Э., Поллард, К. С., Руссос, П. и Дадли, Дж. Т. Геномные и сетевые паттерны генетической изменчивости шизофрении в регионах с ускоренной эволюцией человека. Мол. биол. Эвол. 32 , 1148–1160 (2015).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 69.

    Doan, R. N. et al. Мутации в ускоренных областях человека нарушают познание и социальное поведение. Cell 167 , 341–354.e12 (2016).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 70.

    Sharp, P. M. & Hahn, B.H. Эволюция ВИЧ-1 и происхождение СПИДа. Фил. Транс. Р. Соц. B 365 , 2487–2494 (2010).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 71.

    Нгуен, Д. Х., Уртадо-Зиола, Н., Ганье, П. и Варки, А. Потеря экспрессии Siglec на Т-лимфоцитах в ходе эволюции человека. Проц. Натл акад. науч. США 103 , 7765–7770 (2006 г.).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 72.

    Soto, P.C., Karris, M.Y., Spina, C.A., Richman, D.D. & Varki, A. Внутренний клеточный механизм с участием Siglec-5, связанный с различными исходами инфекции ВИЧ-1 в Т-клетках CD4 человека и шимпанзе. Дж. Мол. Мед. 91 , 261–270 (2013).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 73.

    Арора, Г., Полаварапу, Н. и Макдональд, Дж. Ф. Привел ли естественный отбор к повышению когнитивных способностей у людей к повышенному риску рака? Мед.Гипотезы 73 , 453–456 (2009).

    ПабМед Google Scholar

  • 74.

    Варки, Н. М. и Варки, А. О явной редкости эпителиального рака у содержащихся в неволе шимпанзе. Фил. Транс. Р. Соц. Б 370 , 20140225 (2015).

    ПабМед Google Scholar

  • 75.

    Варки А. Потеря N -гликолилнейраминовой кислоты у людей: механизмы, последствия и влияние на эволюцию гоминидов. Годб. физ. Антропол. 44 , 54–69 (2001).

    Google Scholar

  • 76.

    Chou, H.H. et al. Мутация в гидроксилазе CMP-сиаловой кислоты человека произошла после расхождения Homo Pan . Проц. Натл акад. науч. США 95 , 11751–11756 (1998).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 77.

    Ирие А., Коямат С., Кодзуцуми Ю., Кавасаки Т. и Судзуки А. Молекулярная основа отсутствия N -гликолилнейраминовой кислоты у людей. Дж. Биол. хим. 273 , 15866–15871 (1998).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 78.

    Martin, M.J., Rayner, J.C., Gagneux, P., Barnwell, J.W. & Varki, A. Эволюция различий между человеком и шимпанзе в восприимчивости к малярии: связь с генетической потерей человеком N -гликолилнейраминовой кислоты. Проц. Натл акад. науч. США 102 , 12819–12824 (2005 г.).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 79.

    Varki, A. & Gagneux, P. Специфическая для человека эволюция мишеней сиаловой кислоты: объяснение тайны злокачественной малярии? Проц. Натл акад. науч. США 106 , 14739–14740 (2009 г.).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 80.

    Дэн Л. и др. Адаптация хозяина бактериального токсина из патогена человека Salmonella typhi . Cell 159 , 1290–1299 (2014).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 81.

    Варки, А. Уникальная человеческая эволюция генетики и биологии сиаловой кислоты. Проц. Натл акад. науч. США 107 , 8939–8946 (2010 г.). В этой статье показано, что гены, участвующие в биологии сиаловой кислоты, являются «горячей точкой» генетических и физиологических изменений в ходе недавней эволюции, что имеет значение для специфических заболеваний человека .

    КАС пабмед Google Scholar

  • 82.

    Quach, H. & Quintana-Murci, L. Жизнь в адаптивном мире: геномное вскрытие рода Homo и его иммунный ответ. Дж. Экспл. Мед. 214 , 877–894 (2017).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 83.

    Quintana-Murci, L. Иммунология человека через призму эволюционной генетики. Cell 177 , 184–199 (2019).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 84.

    Селуанов А., Гладышев В. Н., Вийг Ю., Горбунова В. Механизмы резистентности к раку у долгоживущих млекопитающих. Нац. Преподобный Рак 18 , 433–441 (2018).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 85.

    Хе, С. и Шарплесс, Н.E. Старение в норме и при болезни. Ячейка 169 , 1000–1011 (2017).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 86.

    Coppola, L. et al. Биобанкинг в здравоохранении: эволюция и будущие направления. Дж. Пер. Мед. 17 , 172 (2019).

    ПабМед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 87.

    Боутон, Э.и другие. Биобанки и электронные медицинские карты: обеспечение рентабельности исследований. Науч. Перевод Мед. 6 , 234 см3 (2014 г.).

    ПабМед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 88.

    Bush, W. S., Oetjens, M. T. & Crawford, D. C. Распутывание взаимосвязей между геномом и феномом человека с использованием общефеномальных ассоциативных исследований. Нац. Преподобный Жене. 17 , 129–145 (2016).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 89.

    ван Манен, Д. и др. Полногеномное ассоциативное сканирование у ВИЧ-1-инфицированных лиц, выявляющее варианты, влияющие на течение заболевания. PLoS ONE 6 , e22208 (2011).

    ПабМед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 90.

    Саэс-Сирион, А. и Панчино, Г. Контролеры ВИЧ: генетически детерминированный или индуцируемый фенотип? Иммунол. Ред. 254 , 281–294 (2013).

    ПабМед Google Scholar

  • 91.

    Макларен, П.Дж. и др. Полиморфизмы большого эффекта объясняют большую часть генетического вклада хозяина в изменчивость вирусной нагрузки ВИЧ-1. Проц. Натл акад. науч. США 112 , 14658–14663 (2015).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 92.

    Парэм, П. и Охта, Т. Популяционная биология представления антигена молекулами МНС класса I. Наука 272 , 67–74 (1996).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 93.

    Клепиела, П. и др. Доминирующее влияние HLA-B в опосредовании потенциальной коэволюции ВИЧ и HLA. Природа 432 , 769–774 (2004).

    Google Scholar

  • 94.

    Martin, M.P. et al. Врожденное партнерство подтипов HLA-B и KIR3DL1 против ВИЧ-1. Нац. Жене. 39 , 733–740 (2007).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 95.

    De Groot, N.G. et al. Защитные от СПИДа молекулы HLA-B*27/B*57 и MHC класса I шимпанзе нацелены на аналогичные консервативные области ВИЧ-1/SIVcpz. Проц. Натл акад. науч. США 107 , 15175–15180 (2010 г.).

    ПабМед Google Scholar

  • 96.

    Фан, С., Хансен, М. Е. Б., Ло, Ю. и Тишкофф, С. А. Выход на глобальный уровень путем адаптации к местным условиям: обзор недавней адаптации человека. Наука 354 , 54–59 (2016).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 97.

    Marciniak, S. & Perry, G. H. Использование древних геномов для изучения истории адаптации человека. Нац. Преподобный Жене. 18 , 659–674 (2017).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 98.

    Nielsen, R. et al. Отслеживание заселения мира с помощью геномики. Природа 541 , 302–310 (2017).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 99.

    Azevedo, L., Serrano, C., Amorim, A. & Cooper, D. N. Межвидовой полиморфизм у людей и человекообразных обезьян обычно поддерживается путем уравновешивающего отбора, который модулирует иммунный ответ хозяина. Гул. Геномика 9 , 21 (2015).

    ПабМед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 100.

    Гравель, С. Когда отбор эффективен? Генетика 203 , 451–462 (2016).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 101.

    Prüfer, K. et al. Полная последовательность генома неандертальца из Горного Алтая. Природа 505 , 43–49 (2014).

    ПабМед Google Scholar

  • 102.

    Верно Б.и Эйки, Дж. М. Воскрешение выживших неандертальцев из геномов современного человека. Наука 343 , 1017–1021 (2014).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 103.

    Чен, Л., Вольф, А. Б., Фу, В., Ли, Л. и Эйки, Дж. М. Выявление и интерпретация явного неандертальского происхождения у африканских людей. Cell 180 , 677–687.e16 (2020).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 104.

    Хаммер, М.Ф., Вернер, А.Е., Мендес, Ф.Л., Уоткинс, Дж.К. и Уолл, Дж.Д. Генетические доказательства архаичной примеси в Африке. Проц. Натл акад. науч. США 108 , 15123–15128 (2011 г.).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 105.

    Hsieh, P.H. et al. Анализ данных полного генома на основе моделей раскрывает сложную эволюционную историю, включающую архаичную интрогрессию у центральноафриканских пигмеев. Рез. генома. 26 , 291–300 (2016).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 106.

    Lachance, J. et al. Эволюционная история и адаптация на основе полных геномных последовательностей различных африканских охотников-собирателей. Cell 150 , 457–469 (2012).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 107.

    Кейнан, А. и Кларк, А. Г. Недавний взрывной рост человеческой популяции привел к избытку редких генетических вариантов. Наука 336 , 740–743 (2012).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 108.

    Fu, W. & Akey, J.M. Отбор и адаптация в геноме человека. год. Преподобный Геном. Гум. Жене. 14 , 467–489 (2013).

    КАС Google Scholar

  • 109.

    Uricchio, L.H., Zaitlen, N.A., Ye, C.J., Witte, J.S. & Hernandez, R.D. Отбор и взрывной рост изменяют генетическую архитектуру и препятствуют обнаружению причинных редких вариантов. Рез. генома. 26 , 863–873 (2016). Это исследование демонстрирует, как недавняя демографическая и избирательная история человеческих популяций создает проблемы для идентификации и интерпретации генетических вариантов, вызывающих заболевания .

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 110.

    Фу, К. и др. Пересмотренная шкала времени эволюции человека, основанная на древних митохондриальных геномах. Курс. биол. 23 , 553–559 (2013).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 111.

    Do, R. et al. Нет доказательств того, что отбор менее эффективен в удалении вредных мутаций у европейцев, чем у африканцев. Нац. Жене. 47 , 126–131 (2015).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 112.

    Саймонс, Ю. Б., Турчин, М. К., Причард, Дж. К. и Селла, Г. Нагрузка вредоносных мутаций не зависит от недавней истории популяции. Нац. Жене. 46 , 220–224 (2014).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 113.

    Саймонс, Ю. Б. и Селла, Г. Влияние недавней популяционной истории на нагрузку вредных мутаций у людей и их близких эволюционных родственников. Курс.мнение Жене. Дев. 41 , 150–158 (2016).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 114.

    Селла, Г. и Бартон, Н. Х. Размышление об эволюции сложных признаков в эпоху полногеномных ассоциативных исследований. год. Преподобный Геномикс Хам. Жене. 20 , 461–493 (2019).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 115.

    Ким, М. С., Патель, К. П., Тенг, А. К., Беренс, А. Дж. и Лашанс, Дж. Риски генетических заболеваний могут быть неправильно оценены среди населения мира. Геном Биол. 19 , 179 (2018).

    ПабМед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 116.

    Рис, Дж. С., Кастеллано, С. и Андрес, А. М. Геномика локальной адаптации человека. Тенденции Жене. 36 , 415–428 (2020).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 117.

    Уэрта-Санчес, Э. и др. Адаптация к высоте у тибетцев, вызванная интрогрессией денисовской ДНК. Природа 512 , 194–197 (2014).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 118.

    Мэтисон И. и др. Полногеномные закономерности отбора у 230 древних евразийцев. Природа 528 , 499–503 (2015).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 119.

    Ди Риенцо, А. и Хадсон, Р. Р. Эволюционная структура распространенных заболеваний: модель наследственной восприимчивости. Тенденции Жене. 21 , 596–601 (2005).

    ПабМед Google Scholar

  • 120.

    Манус, М. Б. Эволюционное несоответствие. Эволюция. Мед. Общественное здравоохранение 2018 , 190–191 (2018).

    ПабМед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 121.

    Гибсон Г. Деканализация и происхождение сложных заболеваний. Нац. Преподобный Жене. 10 , 134–140 (2009).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 122.

    Lachance, J. Ассоциированные с заболеванием аллели в полногеномных ассоциативных исследованиях обогащены производными низкочастотными аллелями по сравнению с HapMap и нейтральными ожиданиями. БМС Мед. Геномика 3 , 57 (2010).

    ПабМед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 123.

    Квятковски, Д. П. Как малярия повлияла на геном человека и что генетика человека может рассказать нам о малярии. утра. Дж. Хам. Жене. 77 , 171–192 (2005).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 124.

    Minster, R.L. et al. Экономный вариант CREBRF сильно влияет на индекс массы тела самоанцев. Нац. Жене. 48 , 1049–1054 (2016). В этой статье утверждается, что узкие места и экстремальные условия прошлого создали у самоанцев «экономный» вариант гена, который метаболически полезен во время голодания, но может способствовать риску ожирения в современных условиях .

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 125.

    Nédélec, Y. et al. Генетическое происхождение и естественный отбор определяют популяционные различия в иммунных реакциях на патогены. Cell 167 , 657–669.e21 (2016). Эта работа показывает, что воспалительная реакция человека различается в зависимости от истории эволюции (включая локальную адаптацию и архаичную интрогрессию) человеческих популяций .

    ПабМед Google Scholar

  • 126.

    Raj, T. et al. Аллели общего риска воспалительных заболеваний являются мишенями недавней положительной селекции. утра. Дж. Хам. Жене. 92 , 517–529 (2013).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 127.

    Барбер, М. Ф., Ли, Э. М., Гриффин, Х. и Эльде, Н. К. Быстрая эволюция факторов иммунного ответа типа 2 приматов, связанных с восприимчивостью к астме. Геном Биол. Эвол. 9 , 1757–1765 (2017).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 128.

    Smallwood, T.B. et al. Иммуномодуляция гельминтов при аутоиммунных заболеваниях. Фронт. Иммунол. 8 , 453 (2017).

    ПабМед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 129.

    Соботкова К. и др. Гельминтотерапия — с точки зрения паразитов. Тенденции Паразитол. 35 , 501–515 (2019).

    ПабМед Google Scholar

  • 130.

    Харрис К. и Нильсен Р. Генетическая цена неандертальской интрогрессии. Генетика 203 , 881–891 (2016).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 131.

    Юрик И., Эшбахер С. и Куп Г. Сила отбора против неандертальской интрогрессии. Генетика PLoS. 12 , 1–25 (2016).

    Google Scholar

  • 132.

    Dannemann, M., Andrés, A.M. & Kelso, J. Интрогрессия неандертальских и денисовских гаплотипов способствует адаптивным вариациям Toll-подобных рецепторов человека. утра. Дж. Хам. Жене. 98 , 22–33 (2016).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 133.

    Simonti, CN. Фенотипическое наследие смешения современных людей и неандертальцев. Наука 351 , 737–742 (2016). В этой статье используется большая когорта биобанков, чтобы продемонстрировать, что смешение неандертальцев и предков современных евразийцев влияет на риск заболевания .

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 134.

    Quach, H. et al. Генетическая адаптация и примесь неандертальцев сформировали иммунную систему человеческих популяций. Cell 167 , 643–656.e17 (2016).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 135.

    Даннеманн, М. и Келсо, Дж. Вклад неандертальцев в фенотипическую изменчивость современных людей. утра. Дж. Хам. Жене. 101 , 578–589 (2017).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 136.

    Санкарараман, С. и др. Геномный ландшафт предков неандертальцев у современных людей. Природа 507 , 354–357 (2014).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 137.

    Санкарараман, С., Маллик, С., Паттерсон, Н. и Райх, Д. Комбинированный ландшафт денисовского и неандертальского происхождения у современных людей. Курс. биол. 26 , 1241–1247 (2016).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 138.

    Маккой, Р. К., Уэйкфилд, Дж. и Эйки, Дж. М. Воздействие неандертальских интрогрессивных последовательностей на ландшафт экспрессии генов человека. Cell 168 , 916–927.e12 (2017).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 139.

    Макартур Э., Ринкер Д. К. и Капра Дж.A. Количественная оценка вклада неандертальской интрогрессии в наследуемость сложных признаков. Препринт в bioRxiv https://doi.org/10.1101/2020.06.08.140087 (2020).

    Артикул Google Scholar

  • 140.

    Сков Л. и др. Природа неандертальской интрогрессии раскрыта с помощью 27 566 исландских геномов. Природа 582 , 78–83 (2020).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 141.

    Rinker, D.C. et al. Неандертальская интрогрессия вновь представила функциональные наследственные аллели, утраченные в евразийских популяциях. Нац. Экол. Эвол. 4 , 1332–1341 (2020).

    ПабМед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 142.

    Расимо, Ф., Марнетто, Д. и Уэрта-Санчес, Э. Признаки архаичной адаптивной интрогрессии в современных человеческих популяциях. Мол. биол. Эвол. 34 , 296–317 (2017).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 143.

    Bigham, A.W. & Lee, F.S. Адаптация человека к высокогорью: передовая генетика встречается с путем HIF. Гены Дев. 28 , 2189–2204 (2014).

    ПабМед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 144.

    Deschamps, M. et al. Геномные сигнатуры селективного давления и интрогрессии архаичных гомининов на гены врожденного иммунитета человека. утра. Дж. Хам. Жене. 98 , 5–21 (2016).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 145.

    Энард Д. и Петров Д. А. Доказательства того, что РНК-вирусы стимулировали адаптивную интрогрессию между неандертальцами и современными людьми. Cell 175 , 360–371.e13 (2018).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 146.

    Гиттельман, Р. М. и др. Примесь архаичного гоминина облегчила адаптацию к окружающей среде за пределами Африки. Курс. биол. 26 , 3375–3382 (2016).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 147.

    Zeberg, H. & Pääbo, S. Основной генетический фактор риска тяжелого течения COVID-19 унаследован от неандертальцев. Природа 587 , 610–612 (2020).

    ПабМед Google Scholar

  • 148.

    Khera, A.V. et al. Полногеномные полигенные баллы для распространенных заболеваний выявляют людей с риском, эквивалентным моногенным мутациям. Нац. Жене. 50 , 1219–1224 (2018). В этом исследовании разрабатываются PRS для пяти распространенных заболеваний и утверждается, что эти показатели могут стратифицировать пациентов на клинически значимые группы риска .

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 149.

    Попеджой, А.Б. и Фуллертон, С. М. Геномика не справляется с разнообразием. Природа 538 , 161–164 (2016).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 150.

    Келли, Д. Э., Хансен, М. Е. Б. и Тишкофф, С. А. Глобальная изменчивость в экспрессии генов и ценность разнообразной выборки. Курс. мнение Сист. биол. 1 , 102–108 (2017).

    ПабМед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 151.

    Hindorff, L.A. et al. Приоритет разнообразия в исследованиях геномики человека. Нац. Преподобный Жене. 19, 175–185 (2018).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 152.

    Куанса, Э. и МакГрегор, Н. В. К разнообразию в геномике: появление нейрогеномики в Африке? Геномика 110 , 1–9 (2018).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 153.

    Мостафави Х. и др. Переменная точность прогнозирования полигенных оценок в группе предков. eLife 9 , e48376 (2020).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 154.

    Torkamani, A., Wineinger, N.E. & Topol, E.J. Личная и клиническая полезность показателей полигенного риска. Нац. Преподобный Жене. 19 , 581–590 (2018).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 155.

    Мартин, А. Р. и др. Демографическая история человека влияет на предсказание генетического риска в различных популяциях. утра. Дж. Хам. Жене. 100 , 635–649 (2017). Это исследование демонстрирует, что PRS для восьми фенотипов с использованием существующей сводной статистики GWAS несовместимы для популяций, которые генетически далеки от исходной популяции GWAS .

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 156.

    Мартин, А. Р. и др. Клиническое использование текущих показателей полигенного риска может усугубить различия в состоянии здоровья. Нац. Жене. 51 , 584–591 (2019).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 157.

    Сируго Г., Уильямс С. М. и Тишкофф С. А. Недостающее разнообразие в генетических исследованиях человека. Cell 177 , 26–31 (2019).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 158.

    Петровски, С. и Гольдштейн, Д. Б. Неравное представление генетической изменчивости среди групп предков создает неравенство в области здравоохранения в применении точной медицины. Геном Биол. 17 , 157 (2016).

    ПабМед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 159.

    Kessler, M.D. et al. Проблемы и различия в применении персонализированной геномной медицины к популяциям африканского происхождения. Нац. коммун. 7 , 12521 (2016).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 160.

    Maisano Delser, P. & Fuselli, S. Человеческие локусы, участвующие в биотрансформации лекарств: всемирная генетическая изменчивость, структура популяции и фармакогенетические последствия. Гул. Жене. 132 , 563–577 (2013).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 161.

    Мадиан, А. Г., Уилер, Х. Э., Джонс, Р. Б. и Долан, М. Э. Связь генетической изменчивости человека с изменчивостью реакции на лекарства. Тенденции Жене. 28 , 487–495 (2012).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 162.

    Huo, D. et al. Сравнение молекулярных особенностей рака молочной железы и выживаемости африканского и европейского происхождения в Атласе генома рака. JAMA Oncol. 3 , 1654–1662 (2017).

    ПабМед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 163.

    Carlson, C.S. et al. Обобщение и разбавление ассоциации результатов европейского GWAS в популяциях неевропейского происхождения: исследование PAGE. PLoS Биол. 11 , e1001661 (2013).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 164.

    Manrai, A.K. et al. Генетические ошибочные диагнозы и потенциальные различия в состоянии здоровья. Н. англ. Дж. Мед. 375 , 655–665 (2016). В этой статье демонстрируется неправильная классификация «причинных» вариантов гипертрофической кардиомиопатии у разных людей на основании отсутствия разнообразия в существующих генетических базах данных .

    ПабМед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 165.

    Линч, М. Мутация и исключительность человека: наш будущий генетический груз. Генетика 202 , 869–875 (2016). В этой статье исследуются последствия недавнего устранения многих факторов избирательного давления со стороны естественной среды на геном человека, риск заболевания и прецизионную медицину .

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 166.

    Lachance, J. et al. Генетический автостоп и узкие места в популяции способствуют неравенству в отношении рака предстательной железы у мужчин африканского происхождения. Рак Рез. 78 , 2432–2443 (2018). Этот анализ показывает, что гаплотипы с защитным действием против рака предстательной железы, возможно, увеличились до более высокой частоты в неафриканских популяциях из-за отбора по соседним вариантам, связанным с пигментацией кожи .

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 167.

    Маркес-Луна, К. и др. Мультиэтнические полигенные показатели риска улучшают прогнозирование риска в различных группах населения. Жен. Эпидемиол. 41 , 811–823 (2017).

    ПабМед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 168.

    Shi, H. et al. Локализация компонентов общей трансэтнической генетической архитектуры сложных признаков по сводным данным GWAS. утра. Дж. Хам. Жене. 106 , 805–817 (2020).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 169.

    Кроуфорд, Н.Г. и др. Локусы, связанные с пигментацией кожи, выявлены в африканских популяциях. Наука. 358 , eaan8433 (2017).

    ПабМед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 170.

    Fumagalli, M. et al. Гренландские инуиты демонстрируют генетические признаки диеты и адаптации к климату. Наука 349 , 1343–1347 (2015).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 171.

    Асгари, С. и др. Положительно выбранный миссенс-вариант FBN1 уменьшает рост у перуанцев. Природа 582 , 234–239 (2020).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 172.

    Ли, Ю. Р. и Китинг, Б. Дж. Трансэтнические полногеномные исследования ассоциаций: преимущества и проблемы картирования в различных популяциях. Геном Мед. 6 , 1–14 (2014).

    КАС Google Scholar

  • 173.

    Кук, Дж. П. и Моррис, А. П. Мультиэтническое исследование ассоциации всего генома идентифицирует новый локус для предрасположенности к диабету 2 типа. евро. Дж. Хам. Жене. 24 , 1175–1180 (2016).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 174.

    Mägi, R. et al. Трансэтническая мета-регрессия полногеномных ассоциативных исследований, учитывающая родословную, увеличивает возможности для открытий и улучшает разрешение точного картирования. Гул. Мол. Жене. 26 , 3639–3650 (2017).

    ПабМед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 175.

    Fernández-Rhodes, L. et al. Трансэтническое точное картирование генетических локусов для индекса массы тела в различных предковых популяциях популяционной архитектуры с использованием исследования геномики и эпидемиологии (PAGE) выявляет доказательства множественных сигналов в установленных локусах. Гул. Жене. 136 , 771–800 (2017).

    ПабМед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 176.

    Hiby, S.E. et al. Комбинации генов KIR матери и генов HLA-C плода влияют на риск преэклампсии и репродуктивный успех. Дж. Экспл. Мед. 200 , 957–965 (2004).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 177.

    Yang, J. et al. Оценка генетической дисперсии с вмененными вариантами обнаруживает незначительную отсутствующую наследственность для роста человека и индекса массы тела. Нац. Жене. 47 , 1114–1120 (2015).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 178.

    Корбетт, С., Куртиоль, А., Луммаа, В., Мурад, Дж. и Стернс, С. Переход к современности и хронические заболевания: несоответствие и естественный отбор. Нац. Преподобный Жене. 19 , 419–430 (2018).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 179.

    Rodríguez, J.A. et al. Антагонистическая плейотропия и накопление мутаций влияют на старение и болезни человека. Нац. Экол. Эвол. 1 , 1–5 (2017).

    Google Scholar

  • 180.

    Byars, S.G. et al. Генетические локусы, ассоциированные с болезнью коронарных артерий, свидетельствуют об отборе и антагонистической плейотропии. Генетика PLoS. 13 , e1006328 (2017).

    ПабМед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 181.

    Глюкман, П. Д. и Хэнсон, Массачусетс. Времена перемен: эволюция полового созревания. Мол. Клетка. Эндокринол. 254–255 , 26–31 (2006).

    ПабМед Google Scholar

  • 182.

    Арнольд А. Дж. и Фриструп К. Теория эволюции путем естественного отбора: иерархическое расширение. Палеобиология 8 , 113–129 (1982).

    Google Scholar

  • 183.

    Футуйма, Д. Дж. Эволюционные ограничения и экологические последствия. Эволюция 64 , 1865–1884 (2010).

    ПабМед Google Scholar

  • 184.

    Gluckman, P. & Hanson, M. Developmental Origins of Health and Disease (Cambridge Univ. Press, 2006).

  • 185.

    Баррейро, Л. Б. и Кинтана-Мурси, Л. От эволюционной генетики к иммунологии человека: как отбор формирует гены защиты хозяина. Нац. Преподобный Жене. 11 , 17–30 (2010).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 186.

    Фэй, Дж. К. Последствия болезни при адаптации человека. Заяв. Перевод Геномика 2 , 42–47 (2013).

    КАС Google Scholar

  • 187.

    Франк, С. А. и Креспи, Б. Дж. Патология, возникшая в результате эволюционного конфликта, с теорией Х-хромосомы и аутосомного конфликта из-за половых антагонистических признаков. Проц. Натл акад. науч. США 108 , 10886–10893 (2011 г.).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 188.

    Abbot, P. & Rokas, A. Беременность млекопитающих. Курс. биол. 27 , Р127–Р128 (2017).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 189.

    Aungst, H. et al. in Power, M. & Schulkin J. в Интеграция эволюционной биологии в медицинское образование: для студентов, клиницистов и ученых, занимающихся вопросами охраны здоровья матери и ребенка, Ch.5 (под ред. Шулкин, Дж. и Пауэр, М.) 91–118 (Oxford Univ. Press, 2019).

  • 190.

    Redman, CWG & Sargent, I.L. Иммунология преэклампсии. утра. Дж. Репрод. Иммунол. 63 , 534–543 (2010).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 191.

    Than, N.G. et al. Подход комплексной системной биологии выявляет новые материнские и плацентарные пути развития преэклампсии. Фронт. Иммунол. 9 , 1661 (2018).

    ПабМед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 192.

    Bergmann, A. et al. Снижение циркулирующего растворимого Flt-1 облегчает симптомы, подобные преэклампсии, у мышиной модели. Дж. Сотовый. Мол. Мед. 14 , 1857–1867 (2010).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 193.

    Туранов А.А. и соавт. Модуляция РНКи плацентарного sFLT1 для лечения преэклампсии. Нац. Биотехнолог. 36 , 1164–1173 (2018).

    КАС Google Scholar

  • 194.

    Robertson, S. A. Предотвращение преэклампсии путем подавления растворимого Flt-1? Н. англ. Дж. Мед. 380 , 1080–1082 (2019).

    ПабМед Google Scholar

  • 195.

    Мурджани П., Аморим К.Э.Г., Арндт П.Ф. и Пшеворски М. Изменение молекулярных часов приматов. Проц. Натл акад. науч. США 113 , 10607–10612 (2016).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 196.

    Маринич, М. и Линч, В. Дж. Ослабление ограничения и функциональное расхождение рецептора прогестерона (PGR) в стволовой линии человека. Генетика PLoS. 16 , e1008666 (2020).

    ПабМед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 197.

    Зеберг, Х., Келсо, Дж. и Паабо, С. Рецептор прогестерона неандертальца. Мол. биол. Эвол. 37 , 2655–2660 (2020).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 198.

    Clark, A.G. et al. Положительный отбор в геноме человека, выведенный из ортологичных выравниваний генов человека, шимпанзе и мыши. Гавань Колд Спринг. Симп. Квант. биол. 68 , 479–486 (2003).

    Google Scholar

  • 199.

    Chen, C. et al. Рецептор прогестерона человека демонстрирует признаки адаптивной эволюции, связанной с его способностью действовать как фактор транскрипции. Мол. Филогенет. Эвол. 47 , 637–649 (2008).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 200.

    LaBella, A.L. et al. Учет разнообразных эволюционных сил выявляет мозаичные модели отбора локусов преждевременных родов у человека. Нац.коммун. 11 , 3731 (2020). В этой статье показано, что мозаика различных факторов отбора сформировала генетические локусы, влияющие на риск преждевременных родов, распространенного сложного заболевания .

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 201.

    Шмидт, А., Моралес-Прието, Д. М., Пастушек, Дж., Фрёлих, К. и Маркерт, У. Р. Только у людей есть человеческие плаценты: молекулярные различия между мышами и людьми. J. Репрод. Иммунол. 108 , 65–71 (2015).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 202.

    Hammer, A. Иммунологическая регуляция инвазии трофобласта. J. Репрод. Иммунол. 90 , 21–28 (2011).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 203.

    Erlebacher, A. Иммунология интерфейса мать-плод. год.Преподобный Иммунол. 31 , 387–411 (2013).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 204.

    Robinson, D. P. & Klein, S. L. Беременность и связанные с беременностью гормоны изменяют иммунные реакции и патогенез заболевания. Гормоны Поведение. 62 , 263–271 (2012).

    КАС Google Scholar

  • 205.

    Куртис А.П., Рид Дж.С.и Джеймисон, Д. Дж. Беременность и инфекции. Н. англ. Дж. Мед. 370 , 2211–2218 (2014).

    ПабМед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 206.

    Hiby, S.E. et al. Материнские активирующие KIR защищают от репродуктивной недостаточности человека, опосредованной фетальным HLA-C2. Дж. Клин. Вкладывать деньги. 120 , 4102–4110 (2010).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 207.

    Моффет А., Чазара О., Колуччи Ф. и Джонсон М. Х. Вариации материнских генов KIR и HLA-C плода при репродуктивной недостаточности: слишком рано для клинического вмешательства. Репрод. Биомед. Онлайн 33 , 763–769 (2016).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 208.

    Мун, Дж. М., Капра, Дж. А., Эббот, П. и Рокас, А. Иммунная регуляция при плацентарной беременности: живорождение совместно с новыми иммунными генами и генной регуляцией. BioEssays 41 , 12 (2019).

    Google Scholar

  • 209.

    Muehlenbachs, A., Fried, M., Lachowitzer, J., Mutabingwa, T.K. & Duffy, P.E. Естественный отбор аллелей FLT1 и их связь с устойчивостью к малярии внутриутробно. Проц. Натл акад. науч. США 105 , 14488–14491 (2008 г.).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 210.

    Andersson, D.I. et al. Устойчивость к антибиотикам: воплощение эволюционных принципов в клиническую реальность. FEMS микробиол. 44 , 171–188 (2020).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 211.

    Enriquez-Navas, P. M. et al. Использование эволюционных принципов для продления контроля опухоли в доклинических моделях рака молочной железы. Науч. Перевод Мед. 8 , 327ra24 (2016).

    ПабМед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 212.

    Гейтенби, Р. А. и Браун, Дж. С. Интеграция эволюционной динамики в терапию рака. Нац. Преподобный Клин. Онкол. 17 , 675–686 (2020).

    ПабМед Google Scholar

  • 213.

    Fairlamb, A.H., Gow, N.A.R., Matthews, K.R. & Waters, A.P. Лекарственная устойчивость эукариотических микроорганизмов. Нац. микробиол. 1 , 16092 (2016).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 214.

    Ли, Р., Чен, Ю., Ричи, М. Д. и Мур, Дж. Х. Электронные медицинские карты и полигенные оценки риска для прогнозирования риска заболевания. Нац. Преподобный Жене. 21 , 493–502 (2020).

    КАС пабмед Google Scholar

  • 215.

    Duncan, L. et al. Анализ использования и эффективности оценки полигенного риска в различных человеческих популяциях. Нац. коммун. 10 , 3328 (2019).

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • Вымирание неандертальцев связано с человеческими болезнями — ScienceDaily

    Выросший в Израиле Гили Гринбаум проводил экскурсии по местным пещерам, где когда-то жили неандертальцы, и вместе с другими удивлялся, почему наши дальние родственники внезапно исчезли около 40 000 лет назад.Сейчас Гринбаум, ученый из Стэнфорда, думает, что у него есть ответ.

    В новом исследовании, опубликованном в журнале Nature Communications , Гринбаум и его коллеги предполагают, что сложные модели передачи болезней могут объяснить не только то, как современные люди смогли уничтожить неандертальцев в Европе и Азии всего за несколько тысяч лет, но и, возможно, более загадочно, почему конец не наступил раньше.

    «Наше исследование показывает, что болезни могли сыграть более важную роль в вымирании неандертальцев, чем считалось ранее.Возможно, они даже являются основной причиной того, что современные люди — единственная группа людей, оставшаяся на планете», — сказал Гринбаум, первый автор исследования и научный сотрудник Стэнфордского факультета биологии.

    Медленное убийство

    Археологические данные свидетельствуют о том, что первоначальная встреча между евразийскими неандертальцами и выскочкой нового человеческого вида, который недавно покинул Африку — нашими предками — произошла более 130 000 лет назад в Восточном Средиземноморье в регионе, известном как Левант.

    Тем не менее, прошли десятки тысяч лет, прежде чем неандертальцы начали исчезать, а современные люди вышли за пределы Леванта. Почему это заняло так много времени?

    Используя математические модели передачи болезней и потоков генов, Гринбаум и международная группа сотрудников продемонстрировали, как уникальные болезни, которыми страдали неандертальцы и современные люди, могли создать невидимый барьер для болезней, препятствующий набегам на вражескую территорию.В пределах этой узкой контактной зоны, центром которой был Левант, где произошел первый контакт, неандертальцы и современные люди сосуществовали в нестабильном равновесии, которое длилось десятки тысячелетий.

    По иронии судьбы, то, что могло выйти из тупика и в конечном итоге позволило нашим предкам вытеснить неандертальцев, было сближением двух наших видов в результате скрещивания. Люди-гибриды, рожденные от этих союзов, могли нести связанные с иммунитетом гены обоих видов, которые медленно распространялись бы в популяциях современных людей и неандертальцев.

    По мере распространения этих защитных генов бремя болезни или последствия инфекции в этих двух группах постепенно уменьшались. В конце концов, был достигнут переломный момент, когда современные люди приобрели достаточный иммунитет, чтобы они могли выходить за пределы Леванта и углубляться на территорию неандертальцев с минимальными последствиями для здоровья.

    В этот момент другие преимущества, которые современные люди могли иметь по сравнению с неандертальцами, такие как более смертоносное оружие или более сложные социальные структуры, могли бы приобрести большее значение.«Как только определенный порог превышен, бремя болезни больше не играет роли, и могут вступить в силу другие факторы», — сказал Гринбаум.

    Почему мы?

    Чтобы понять, почему современные люди заменили неандертальцев, а не наоборот, исследователи смоделировали, что произойдет, если набор тропических болезней, которыми питались наши предки, окажется более смертоносным или более многочисленным, чем те, что переносятся неандертальцами.

    «Гипотеза состоит в том, что бремя болезней в тропиках было больше, чем бремя болезней в регионах с умеренным климатом.Асимметрия бремени болезней в зоне контакта могла благоприятствовать современным людям, прибывшим туда из тропиков», — сказал соавтор исследования Ноа Розенберг, профессор Стэнфордского университета популяционной генетики и общества в Школе гуманитарных и естественных наук.

    Согласно моделям, даже небольшие различия в бремени болезней между двумя группами с самого начала будут увеличиваться со временем, в конечном итоге давая преимущество нашим предкам. «Возможно, к тому времени, когда современные люди были почти полностью освобождены от дополнительного бремени неандертальских болезней, неандертальцы все еще были очень уязвимы для современных человеческих болезней», — сказал Гринбаум. «Более того, по мере того, как современные люди продвигались глубже в Евразию, они столкнулись бы с популяциями неандертальцев, которые не получили никаких защитных иммунных генов в результате гибридизации».

    Исследователи отмечают, что сценарий, который они предлагают, аналогичен тому, что произошло, когда европейцы прибыли в Америку в 15-м и 16-м веках и уничтожили местное население своими более сильными болезнями.

    Если эта новая теория о гибели неандертальцев верна, то подтверждающие доказательства можно найти в археологических записях.«Мы прогнозируем, например, что плотность неандертальцев и современных людей в Леванте в период их сосуществования будет ниже по сравнению с тем, что было раньше, и по сравнению с другими регионами», — сказал Гринбаум.

    неандертальцев, возможно, умерли от болезней, занесенных людьми из Африки | Неандертальцы

    Болезни и инфекции, передавшиеся предкам современных людей, когда они перебрались из Африки в Европу, возможно, помогли уничтожить неандертальцев, которые ранее доминировали на континенте.

    Несчастные неандертальцы, которые только выработали устойчивость к болезням своей европейской среды, скорее всего, были инфицированы бактерией, вызывающей язву желудка, вирусом, вызывающим генитальный герпес, ленточных червей и туберкулез.

    Воздействие на неандертальцев было охарактеризовано как катастрофическое учеными, стоящими за новым исследованием, которые опубликовали свои выводы в Американском журнале физической антропологии. Болезни и инфекции, которым подвергались охотники-собиратели, сделали бы их менее способными находить достаточно пищи и оставаться здоровыми.Болезни распространялись бы через половой контакт между двумя видами.

    Исследователи из Кембриджского и Оксфордского университетов Брукс, которые изучали геномы патогенов и древнюю ДНК, теперь считают, что некоторые инфекционные заболевания намного старше, чем считалось ранее.

    Доктор Шарлотта Хоулдкрофт из отдела биологической антропологии Кембриджа сказала: «Люди, мигрировавшие из Африки, были значительным резервуаром тропических болезней. Для неандертальского населения Евразии, адаптированного к этой географической инфекционной среде, контакт с новыми патогенами, занесенными из Африки, мог быть катастрофическим.

    Хаулдкрофт, который также занимается изучением современных инфекций в больнице на Грейт-Ормонд-стрит, сказал, что в результате не произошло бы быстрого истребления местного населения, как это произошло, когда европейцы прибыли в Америку в 15 веке.

    «Вероятнее всего, у каждой из небольших групп неандертальцев были свои собственные инфекционные катастрофы, которые ослабляли группу и склоняли чашу весов против выживания», — сказала она.

    Исследователи описывают Helicobacter pylori , бактерию, вызывающую язву желудка, как весьма вероятно, что она была передана людьми неандертальцам.По оценкам, он впервые заразил людей в Африке от 88 000 до 116 000 лет назад, а в Европе — 52 000 лет назад.

    Herpes simplex 2 , вирус, вызывающий генитальный герпес, является еще одним вероятным кандидатом. Свидетельства в геноме болезни предполагают, что она была передана людям в Африке 1,6 млн лет назад от другого, в настоящее время неизвестного вида гоминидов, который, в свою очередь, заразился от шимпанзе.

    Хоулдкрофт и ее коллега Саймон Андердаун из Oxford Brookes оспаривают мнение о том, что распространение инфекционных заболеваний резко возросло с развитием сельского хозяйства около 8000 лет назад, когда более плотные и оседлые человеческие популяции сосуществовали с домашним скотом.

    Вместо этого они считают, что многие болезни, которые, как традиционно считалось, заражаются людьми от стадных животных, на самом деле были среди людей гораздо раньше и передавались от них к животным.

    «Охотники-собиратели жили небольшими группами собирателей. Например, неандертальцы жили группами от 15 до 30 человек. Таким образом, болезнь вспыхивала бы спорадически, но не могла бы распространиться очень далеко. Когда появилось сельское хозяйство, у этих болезней были идеальные условия для взрыва, но они уже были вокруг», — сказала она.

    Ученые давно озадачены исчезновением неандертальцев, вида, очень близкого по форме тела и размеру мозга к современным людям, которые в значительной степени вымерли около 40 000 лет назад, доминировав в Европе на протяжении тысячелетий.

    Неандертальцы не исчезли бесследно. Недавние исследования, предполагающие, что до 3% ДНК современных евразийцев принадлежит неандертальцам, опровергли более ранние теории о том, что эти два вида не спаривались.

    Понимание редких и распространенных заболеваний в контексте эволюции человека | Геномная биология

  • 1.

    Причард Дж.К. Ответственны ли редкие варианты за предрасположенность к сложным заболеваниям? Am J Hum Genet. 2001; 69: 124–37.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 2.

    Pritchard JK, Cox NJ. Аллельная архитектура генов болезней человека: распространенное заболевание — распространенный вариант… или нет? Хум Мол Жене. 2002; 11: 2417–23.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 3.

    Manolio TA, Collins FS, Cox NJ, Goldstein DB, Hindorff LA, Hunter DJ, et al. Выявление недостающей наследственности сложных заболеваний. Природа. 2009; 461: 747–53.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 4.

    McCarthy MI, Abecasis GR, Cardon LR, Goldstein DB, Little J, Ioannidis JP, et al. Полногеномные ассоциативные исследования сложных признаков: консенсус, неопределенность и проблемы. Нат Рев Жене. 2008; 9: 356–69.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 5.

    Reich DE, Lander ES. Об аллельном спектре болезней человека. Тенденции Жене. 2001; 17: 502–10.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 6.

    Цвик М.Е., Катлер Д.Дж., Чакраварти А. Закономерности генетической изменчивости менделевских и сложных признаков. Annu Rev Genomics Hum Genet. 2000; 1: 387–407.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 7.

    Шорк Н.Дж., Мюррей С.С., Фрейзер К.А., Тополь Э.Дж. Общие и редкие аллельные гипотезы сложных заболеваний. Curr Opin Genet Dev. 2009;19:212–9.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 8.

    Бодмер В., Бонилла К. Общие и редкие варианты многофакторной восприимчивости к распространенным заболеваниям. Нат Жене. 2008; 40: 695–701.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 9.

    Гольдштейн ДБ. Общие генетические вариации и черты человека. N Engl J Med. 2009; 360:1696–8.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 10.

    Zhu Q, Ge D, Maia JM, Zhu M, Petrovski S, Dickson SP, et al. Полногеномное сравнение функциональных свойств редких и распространенных генетических вариантов человека. Am J Hum Genet. 2011; 88: 458–68.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 11.

    Лу Ю. Ф., Гольдштейн Д. Б., Ангрист М., Каваллери Г. Персонализированная медицина и генетическое разнообразие человека. Колд Спринг Харб Перспект Мед. 2014;4:a008581.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья КАС Google Scholar

  • 12.

    Ди Риенцо А. Популяционно-генетические модели распространенных заболеваний. Curr Opin Genet Dev. 2006; 16: 630–6.

    ПабМед Статья КАС Google Scholar

  • 13.

    Креспи БЖ. Появление человеко-эволюционной медицинской геномики. Приложение Эвол. 2011;4:292–314.

    ПабМед Статья Google Scholar

  • 14.

    Abecasis GR, Auton A, Brooks LD, DePristo MA, Durbin RM, Handsaker RE, et al. Интегрированная карта генетических вариаций из 1092 геномов человека. Природа. 2012; 491:56–65.

    ПабМед Статья КАС Google Scholar

  • 15.

    Консорциум проекта «1000 геномов». Глобальный справочник по генетической изменчивости человека. Природа. 2015;26:68–74.

    Google Scholar

  • 16.

    Расимо Ф., Санкарараман С., Нильсен Р., Уэрта-Санчес Э. Доказательства архаичной адаптивной интрогрессии у людей. Нат Рев Жене. 2015;16:359–71.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 17.

    Келсо Дж., Пруфер К.Древние люди и происхождение современного человека. Curr Opin Genet Dev. 2014;29:133–138.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 18.

    Veeramah KR, Hammer MF. Влияние полногеномного секвенирования на реконструкцию истории человеческой популяции. Нат Рев Жене. 2014; 15:149–62.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 19.

    Новембре Дж., Рамачандран С.Перспективы структуры человеческой популяции на пороге эры секвенирования. Annu Rev Genomics Hum Genet. 2011;12:245–74.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 20.

    Хенн Б.М., Кавалли-Сфорца Л.Л., Фельдман М.В. Великая человеческая экспансия. Proc Natl Acad Sci U S A. 2012;109:17758–64.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 21.

    Соуза В., Пейшль С., Экскофье Л. Влияние расширения ареала на существующее геномное разнообразие человека. Curr Opin Genet Dev. 2014;29:22–30.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 22.

    Ломюллер К.Е. Распространение вредных генетических вариаций в популяциях человека. Curr Opin Genet Dev. 2014;29:139–46.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 23.

    Нильсен Р., Хеллманн И., Хубиш М., Бустаманте С., Кларк А.Г. Недавняя и продолжающаяся селекция в геноме человека. Нат Рев Жене. 2007; 8: 857–68.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 24.

    Sabeti PC, Schaffner SF, Fry B, Lohmueller J, Varilly P, Shamovsky O, et al. Положительный естественный отбор в родословной человека. Наука. 2006; 312:1614–20.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 25.

    Чжон С., Ди Риенцо А. Адаптация к местным условиям в современных человеческих популяциях. Curr Opin Genet Dev. 2014; 29:1–8.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 26.

    Витти Дж.Дж., Гроссман С.Р., Сабети ПК. Обнаружение естественного отбора в геномных данных. Анну Рев Жене. 2013;47:97–120.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 27.

    Key FM, Teixeira JC, de Filippo C, Andres AM.Выгодное разнообразие поддерживается уравновешивающим отбором у людей. Curr Opin Genet Dev. 2014; 29С:45–51.

    Артикул КАС Google Scholar

  • 28.

    Гроссман С.Р., Андерсен К.Г., Шляхтер И., Тебризи С., Винницки С., Йен А. и др. Выявление недавних адаптаций в крупномасштабных геномных данных. Клетка. 2013; 152:703–13.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 29.

    Баррейро Л.Б., Кинтана-Мурси Л. От эволюционной генетики к иммунологии человека: как отбор формирует гены защиты хозяина. Нат Рев Жене. 2010; 11:17–30.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 30.

    Brinkworth JF, Barreiro LB. Вклад естественного отбора в современную восприимчивость к хроническим воспалительным и аутоиммунным заболеваниям. Курр Опин Иммунол. 2014; 31:66–78.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 31.

    Карлссон Э.К., Квятковски Д.П., Сабети П.С. Естественный отбор и инфекционные заболевания в популяциях человека. Нат Рев Жене. 2014;15:379–93.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 32.

    Blekhman R, Man O, Herrmann L, Boyko AR, Indap A, Kosiol C, et al. Естественный отбор генов, лежащих в основе предрасположенности человека к болезням. Карр Биол. 2008; 18:883–9.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 33.

    Эйр-Уокер А., Кейтли, полиция. Высокая частота вредных геномных мутаций у гоминидов. Природа. 1999; 397: 344–7.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 34.

    Крюков Г.В., Пеннаккио Л.А., Сюняев С.Р. Большинство редких миссенс-аллелей вредны для человека: значение для комплексных исследований заболеваний и ассоциаций. Am J Hum Genet. 2007; 80: 727–39.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 35.

    Boyko AR, Williamson SH, Indap AR, Degenhardt JD, Hernandez RD, Lohmueller KE, et al. Оценка эволюционного влияния мутаций аминокислот в геноме человека. Генетика PLoS. 2008;4:e1000083.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья КАС Google Scholar

  • 36.

    Eyre-Walker A, Keightley PD. Распределение фитнес-эффектов новых мутаций. Нат Рев Жене. 2007; 8: 610–8.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 37.

    Bustamante CD, Fledel-Alon A, Williamson S, Nielsen R, Hubisz MT, Glanowski S, et al. Естественный отбор по генам, кодирующим белок, в геноме человека. Природа. 2005; 437:1153–7.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 38.

    Кимура М., Маруяма Т., Кроу Дж.Ф. Мутационный груз в небольших популяциях. Генетика. 1963; 48: 1303–12.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 39.

    Охта Т. Слегка вредные мутантные замены в эволюции. Природа. 1973; 246: 96–98.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 40.

    Акаши Х., Осада Н., Охта Т. Слабый отбор и эволюция белков. Генетика. 2012; 192:15–31.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 41.

    Coventry A, Bull-Otterson LM, Liu X, Clark AG, Maxwell TJ, Crosby J, et al. Глубокое повторное секвенирование выявляет избыток редких недавних вариантов, что соответствует взрывному росту популяции. Нац коммун. 2010; 1:131.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья КАС Google Scholar

  • 42.

    Март Г.Т., Ю Ф., Индап А.Р., Гаримелла К., Гравель С., Леонг В.Ф. и др. Функциональный спектр вариаций низкочастотного кодирования. Геном биол. 2011;12:R84.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 43.

    Кейнан А., Кларк А.Г. Недавний взрывной рост человеческой популяции привел к избытку редких генетических вариантов. Наука. 2012;336:740–3.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 44.

    Nelson MR, Wegmann D, Ehm MG, Kessner D, St Jean P, Verzilli C, et al. Обилие редких функциональных вариантов в 202 генах-мишенях для лекарств, секвенированных у 14 002 человек. Наука. 2012; 337:100–4.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 45.

    Теннессен Дж. А., Бигэм А. В., О’Коннор Т. Д., Фу В., Кенни Э. Э., Гравел С. и др. Эволюция и функциональное влияние редкой вариации кодирования в результате глубокого секвенирования экзомов человека. Наука. 2012; 337:64–9.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 46.

    Fu W, O’Connor TD, Jun G, Kang HM, Abecasis G, Leal SM, et al. Анализ 6515 экзомов показывает недавнее происхождение большинства вариантов, кодирующих белок человека. Природа.2013; 493:216–20.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 47.

    Лек М., Карчевский К.Дж., Миникель Э.В., Самоча К.Е., Бэнкс Э., Феннелл Т. и соавт. Анализ генетической изменчивости, кодирующей белок, у 60 706 человек. Природа. 2016; 536: 285–91.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 48.

    Агарвала В., Фланник Дж., Сюняев С., Го TDC, Альтшулер Д. Оценка эмпирических границ генетической архитектуры сложных заболеваний.Нат Жене. 2013;45:1418–27.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 49.

    Гибсон Г. Редкие и распространенные варианты: двадцать аргументов. Нат Рев Жене. 2011;13:135–45.

    Артикул КАС Google Scholar

  • 50.

    Махер М.С., Уриккио Л.Х., Торгерсон Д.Г., Эрнандес Р.Д. Популяционная генетика редких вариантов и сложных заболеваний. Хам Херед.2012;74:118–28.

    ПабМед Статья Google Scholar

  • 51.

    Gravel S, Henn BM, Gutenkunst RN, Indap AR, Marth GT, Clark AG, et al. Демографическая история и редкое совместное использование аллелей среди человеческих популяций. Proc Natl Acad Sci U S A. 2011;108:11983–8.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 52.

    Lohmueller KE, Indap AR, Schmidt S, Boyko AR, Hernandez RD, Hubisz MJ, et al.Пропорционально более опасная генетическая изменчивость в европейских популяциях, чем в африканских. Природа. 2008; 451:994–7.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 53.

    Peischl S, Dupanloup I, Kirkpatrick M, Excoffier L. О накоплении вредных мутаций во время расширения ареала. Мол Экол. 2013;22:5972–82.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 54.

    Eyre-Walker A. Эволюция в области здравоохранения и медицины. Коллоквиум Саклера: генетическая архитектура сложного признака и ее последствия для исследований приспособленности и полногеномных ассоциаций. Proc Natl Acad Sci U S A. 2010;107 Suppl 1:1752–6.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 55.

    Аджубей И.А., Шмидт С., Пешкин Л., Раменский В.Е., Герасимова А., Борк П. и др. Метод и сервер для прогнозирования повреждающих миссенс-мутаций.Нат Методы. 2010;7:248–9.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 56.

    Cooper GM, Stone EA, Asimenos G, Program NCS, Green ED, Batzoglou S, et al. Распределение и интенсивность рестрикции в геномной последовательности млекопитающих. Геном Res. 2005; 15:901–13.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 57.

    Кумар П., Хеникофф С., Нг ПК.Прогнозирование влияния кодирования несинонимичных вариантов на функцию белка с использованием алгоритма SIFT. Нат Проток. 2009;4:1073–81.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 58.

    Dong C, Wei P, Jian X, Gibbs R, Boerwinkle E, Wang K, et al. Сравнение и интеграция методов прогнозирования вредоносности несинонимичных SNV в исследованиях секвенирования всего экзома. Хум Мол Жене. 2015;24:2125–37.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 59.

    Кирхер М., Виттен Д.М., Джейн П., О’Роак Б.Дж., Купер Г.М., Шендур Дж. Общая схема оценки относительной патогенности генетических вариантов человека. Нат Жене. 2014;46:310–5.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 60.

    Itan Y, Shang L, Boisson B, Ciancanelli MJ, Markle JG, Martinez-Barricarte R, et al. Пороговое значение значимости мутации: пороговые значения на уровне генов для предсказания вариантов.Нат Методы. 2016;13:109–10.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 61.

    Gutenkunst RN, Hernandez RD, Williamson SH, Bustamante CD. Вывод совместной демографической истории нескольких популяций на основе многомерных данных о частоте SNP. Генетика PLoS. 2009;5:e1000695.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья КАС Google Scholar

  • 62.

    До Р., Балик Д., Ли Х., Аджубей И., Сюняев С., Райх Д. Нет доказательств того, что отбор менее эффективен в удалении вредных мутаций у европейцев, чем у африканцев. Нат Жене. 2015;47:126–31.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 63.

    Fu W, Gittelman RM, Bamshad MJ, Akey JM. Характеристики нейтральных и вредных вариаций кодирования белков среди людей и популяций. Am J Hum Genet.2014;95:421–36.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 64.

    Simons YB, Turchin MC, Pritchard JK, Sella G. Нагрузка вредоносных мутаций не зависит от недавней истории популяции. Нат Жене. 2014;46:220–4.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 65.

    Henn BM, Botigue LR, Bustamante CD, Clark AG, Gravel S.Оценка мутационной нагрузки в геномах человека. Нат Рев Жене. 2015;16:333–43.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 66.

    Casals F, Hodgkinson A, Hussin J, Idaghdour Y, Bruat V, de Maillard T, et al. Полноэкзомное секвенирование выявляет быстрое изменение частоты редких функциональных вариантов в исходной популяции людей. Генетика PLoS. 2013;9:e1003815.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 67.

    Lim ET, Wurtz P, Havulinna AS, Palta P, Tukiainen T, Rehnstrom K, et al. Распространение и медицинские последствия вариантов потери функции в финской популяции основателей. Генетика PLoS. 2014;10:e1004494.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья КАС Google Scholar

  • 68.

    Henn BM, Botigue LR, Peischl S, Dupanloup I, Lipatov M, Maples BK, et al. Расстояние от Африки к югу от Сахары предсказывает мутационную нагрузку в различных геномах человека.Proc Natl Acad Sci U S A. 2016;113:E440–9.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 69.

    Клопфштейн С., Куррат М., Экскофье Л. Судьба мутаций, плывущих на волне расширения ареала. Мол Биол Эвол. 2006; 23: 482–90.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 70.

    Ломюллер К.Е. Влияние демографии и отбора населения на генетическую архитектуру сложных признаков.Генетика PLoS. 2014;10:e1004379.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья КАС Google Scholar

  • 71.

    Сегурел Л., Кинтана-Мурси Л. Сохранение иммунного разнообразия за счет древнего наследования и смешения. Курр Опин Иммунол. 2014;30С:79–84.

    Артикул КАС Google Scholar

  • 72.

    Шайнфельдт Л.Б., Тишкофф С.А. Недавняя адаптация человека: геномные подходы, интерпретация и понимание.Нат Рев Жене. 2013; 14: 692–702.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 73.

    Притчард Дж. К., Ди Риенцо А. Адаптация — не только зачистками. Нат Рев Жене. 2010;11:665–7.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 74.

    Притчард Дж. К., Пикрелл Дж. К., Куп Г. Генетика адаптации человека: жесткие, мягкие и полигенная адаптация.Карр Биол. 2010;20:R208–15.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 75.

    Harris EE, Meyer D. Молекулярная подпись отбора, лежащего в основе адаптации человека. Am J Phys Антропол. 2006; Suppl 43:89–130

  • 76.

    Quintana-Murci L, Barreiro LB. Роль естественного отбора в менделевских признаках человека. Энн Н.Ю. Академия наук. 2010;1214:1–17.

    ПабМед Статья Google Scholar

  • 77.

    Сиддл К.Дж., Кинтана-Мурси Л. Долгая гонка Красной Королевы: человеческая адаптация к давлению патогенов. Curr Opin Genet Dev. 2014; 29С:31–8.

    Артикул КАС Google Scholar

  • 78.

    Bersaglieri T, Sabeti PC, Patterson N, Vanderploeg T, Schaffner SF, Drake JA, et al. Генетические сигнатуры сильного недавнего положительного отбора по гену лактазы. Am J Hum Genet. 2004; 74:1111–20.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 79.

    Tishkoff SA, Reed FA, Ranciaro A, Voight BF, Babbitt CC, Silverman JS, et al. Конвергентная адаптация персистенции лактазы человека в Африке и Европе. Нат Жене. 2007; 39:31–40.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 80.

    Enattah NS, Jensen TG, Nielsen M, Lewinski R, Kuokkanen M, Rasinpera H, et al. Независимая интродукция двух аллелей лактазной персистенции в популяции человека отражает различную историю адаптации к молочной культуре.Am J Hum Genet. 2008; 82: 57–72.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 81.

    Итан Ю., Пауэлл А., Бомонт М.А., Бургер Дж., Томас М.Г. Истоки персистенции лактазы в Европе. PLoS Comput Biol. 2009;5:e1000491.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья КАС Google Scholar

  • 82.

    Ranciaro A, Campbell MC, Hirbo JB, Ko WY, Froment A, Anagnostou P, et al.Генетическое происхождение устойчивости лактазы и распространение скотоводства в Африке. Am J Hum Genet. 2014; 94: 496–510.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 83.

    Белеза С., Сантос А.М., МакЭвой Б., Алвес И., Мартиньо С., Кэмерон Э. и др. Сроки осветления пигментации у европейцев. Мол Биол Эвол. 2013;30:24–35.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 84.

    Miller CT, Beleza S, Pollen AA, Schluter D, Kittles RA, Shriver MD, et al. Цис-регуляторные изменения экспрессии лиганда Kit и параллельная эволюция пигментации у колюшки и человека. Клетка. 2007; 131:1179–89.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 85.

    Norton HL, Kittles RA, Parra E, McKeigue P, Mao X, Cheng K, et al. Генетические доказательства конвергентной эволюции светлой кожи у европейцев и выходцев из Восточной Азии.Мол Биол Эвол. 2007; 24: 710–22.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 86.

    Lamason RL, Mohideen MA, Mest JR, Wong AC, Norton HL, Aros MC, et al. SLC24A5, предполагаемый катионообменник, влияет на пигментацию рыбок данио и человека. Наука. 2005; 310:1782–6.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 87.

    Hancock AM, Witonsky DB, Alkorta-Aranburu G, Beall CM, Gebremedhin A, Sukernik R, et al.Адаптации к избирательному давлению, опосредованному климатом у людей. Генетика PLoS. 2011;7:e1001375.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 88.

    Yi X, Liang Y, Huerta-Sanchez E, Jin X, Cuo ZX, Pool JE и др. Секвенирование 50 экзомов человека выявило адаптацию к большой высоте. Наука. 2010; 329:75–8.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 89.

    Бигэм А., Бауше М., Пинто Д., Мао X, Эйки Дж. М., Мей Р. и др. Выявление признаков естественного отбора в популяциях Тибета и Анд с использованием данных плотного сканирования генома. Генетика PLoS. 2010;6:e1001116.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья КАС Google Scholar

  • 90.

    Simonson TS, Yang Y, Huff CD, Yun H, Qin G, Witherspoon DJ и др. Генетические свидетельства высотной адаптации в Тибете. Наука. 2010;329:72–5.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 91.

    Hancock AM, Witonsky DB, Gordon AS, Eshel G, Pritchard JK, Coop G, et al. Адаптации к климату в генах-кандидатах для распространенных нарушений обмена веществ. Генетика PLoS. 2008;4:e32.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья КАС Google Scholar

  • 92.

    Алькорта-Аранбуру Г., Билл К.М., Витонски Д.Б., Гебремедин А., Притчард Дж.К., Ди Риенцо А.Генетическая архитектура адаптации к большой высоте в Эфиопии. Генетика PLoS. 2012;8:e1003110.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 93.

    Coop G, Pickrell JK, Novembre J, Kudaravalli S, Li J, Absher D, et al. Роль географии в адаптации человека. Генетика PLoS. 2009;5:e1000500.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья КАС Google Scholar

  • 94.

    Barreiro LB, Ben-Ali M, Quach H, Laval G, Patin E, Pickrell JK, et al. Эволюционная динамика человеческих Toll-подобных рецепторов и их различный вклад в защиту хозяина. Генетика PLoS. 2009;5:e1000562.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья КАС Google Scholar

  • 95.

    Deschamps M, Laval G, Fagny M, Itan Y, Abel L, Casanova JL, et al. Геномные сигнатуры селективного давления и интрогрессии архаичных гомининов на гены врожденного иммунитета человека.Am J Hum Genet. 2016;98:5–21.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 96.

    Фумагалли М., Сирони М. Изменчивость генома человека, естественный отбор и инфекционные заболевания. Курр Опин Иммунол. 2014;30C:9–16.

    Артикул КАС Google Scholar

  • 97.

    Karlsson EK, Harris JB, Tabrizi S, Rahman A, Shlyakhter I, Patterson N, et al.Естественный отбор в бангладешской популяции из эндемичной по холере дельты реки Ганг. Sci Transl Med. 2013;5:192ra86.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 98.

    Квятковский Д.П. Как малярия повлияла на геном человека и что генетика человека может рассказать нам о малярии. Am J Hum Genet. 2005; 77: 171–92.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 99.

    Лааюни Х., Остинг М., Луизи П., Иоана М., Алонсо С., Рикано-Понсе И. и др. Конвергентная эволюция в популяциях европейцев и рома показывает давление, оказываемое чумой на Toll-подобные рецепторы. Proc Natl Acad Sci U S A. 2014;111:2668–73.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 100.

    Луичароэн С., Патин Э., Пол Р., Нучпрайун И., Витунпанич Б., Пирапиттайамонгкол С. и др. Положительно выбранная мутация G6PD-Mahidol снижает плотность Plasmodium vivax у выходцев из Юго-Восточной Азии.Наука. 2009; 326:1546–9.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 101.

    Manry J, Laval G, Patin E, Fornarino S, Itan Y, Fumagalli M, et al. Эволюционная генетическая диссекция интерферонов человека. J Эксперт Мед. 2011; 208:2747–59.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 102.

    Мукерджи С., Саркар-Рой Н., Вагенер Д.К., Маджумдер П.П.Признаки естественного отбора неодинаковы для генов врожденной иммунной системы, но доминирующим признаком является очищающий отбор. Proc Natl Acad Sci U S A. 2009;106:7073–8.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 103.

    Quintana-Murci L, Clark AG. Популяционные генетические инструменты для анализа врожденного иммунитета у людей. Нат Рев Иммунол. 2013;13:280–93.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 104.

    Sabeti PC, Reich DE, Higgins JM, Levine HZ, Richter DJ, Schaffner SF, et al. Обнаружение недавней положительной селекции в геноме человека по структуре гаплотипа. Природа. 2002; 419:832–7.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 105.

    Сирони М., Клеричи М. Гигиеническая гипотеза: эволюционная перспектива. микробы заражают. 2010;12:421–7.

    ПабМед Статья Google Scholar

  • 106.

    Vasseur E, Boniotto M, Patin E, Laval G, Quach H, Manry J, et al. Эволюционный ландшафт цитозольных микробных сенсоров у человека. Am J Hum Genet. 2012;91:27–37.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 107.

    Власюк Г., Нахман М.В. Адаптация и ограничение Toll-подобных рецепторов у приматов. Мол Биол Эвол. 2010;27:2172–86.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 108.

    Чон С., Алькорта-Аранбуру Г., Баснят Б., Неупане М., Витонски Д.Б., Притчард Дж.К. и др. Примесь облегчает генетическую адаптацию к большой высоте в Тибете. Нат Коммунс. 2014;5:3281.

    Google Scholar

  • 109.

    Pickrell JK, Coop G, Novembre J, Kudaravalli S, Li JZ, Absher D, et al. Сигналы недавнего положительного отбора во всемирной выборке человеческих популяций. Геном Res. 2009; 19: 826–37.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 110.

    Sabeti PC, Varilly P, Fry B, Lohmueller J, Hostetter E, Cotsapas C, et al. Полногеномное обнаружение и характеристика положительного отбора в популяциях человека. Природа. 2007; 449: 913–8.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 111.

    Танг К., Торнтон К.Р., Стоункинг М. Новый подход к использованию сканирования генома для обнаружения недавней положительной селекции в геноме человека. PLoS биол. 2007;5:e171.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья КАС Google Scholar

  • 112.

    Войт Б.Ф., Кударавалли С., Вен Х., Притчард Дж.К. Карта недавнего положительного отбора в геноме человека. PLoS биол. 2006;4:e72.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 113.

    Carlson CS, Thomas DJ, Eberle MA, Swanson JE, Livingston RJ, Rieder MJ, et al. Геномные области, демонстрирующие положительный отбор, идентифицированы по данным плотного генотипа. Геном Res. 2005; 15:1553–65.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 114.

    Келли Дж.Л., Мадей Дж., Калхун Дж.С., Суонсон В., Эйки Дж.М. Геномные сигнатуры положительного отбора у людей и ограничения подходов, отличающихся от других. Геном Res. 2006; 16:980–9.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 115.

    Barreiro LB, Laval G, Quach H, Patin E, Quintana-Murci L. Естественный отбор привел к дифференциации популяций современных людей. Нат Жене. 2008;40:340–5.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 116.

    Chen H, Patterson N, Reich D. Дифференциация населения как тест для выборочных зачисток. Геном Res. 2010;20:393–402.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 117.

    Jin W, Xu S, Wang H, Yu Y, Shen Y, Wu B, et al. Полногеномное обнаружение естественного отбора у афроамериканцев до и после смешения. Геном Res. 2012;22:519–27.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 118.

    Вейр Б.С., Кардон Л.Р., Андерсон А.Д., Нильсен Д.М., Хилл В.Г. Показатели структуры человеческой популяции показывают неоднородность среди областей генома. Геном Res. 2005; 15:1468–76.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 119.

    Акей Дж.М., Чжан Г., Чжан К., Джин Л., Шрайвер М.Д. Исследование карты SNP с высокой плотностью на наличие сигнатур естественного отбора. Геном Res. 2002; 12:1805–14.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 120.

    Акей Дж.М. Построение геномных карт положительного отбора у человека: куда двигаться дальше? Геном Res. 2009; 19: 711–22.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 121.

    Williamson SH, Hubisz MJ, Clark AG, Payseur BA, Bustamante CD, Nielsen R. Локализация недавней адаптивной эволюции в геноме человека. Генетика PLoS. 2007;3:e90.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья КАС Google Scholar

  • 122.

    Fagny M, Patin E, Enard D, Barreiro LB, Quintana-Murci L, Laval G. Изучение возникновения классических селективных зачисток у людей с использованием наборов данных полногеномного секвенирования. Мол Биол Эвол. 2014; 31:1850–68.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 123.

    Hernandez RD, Kelley JL, Elyashiv E, Melton SC, Auton A, McVean G, et al. Классические выборочные зачистки были редкостью в недавней эволюции человека. Наука. 2011;331:920–4.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 124.

    Гранка Дж.М., Хенн Б.М., Жиньу К.Р., Кидд Дж.М., Бустаманте К.Д., Фельдман М.В. Ограниченные доказательства классических выборочных зачисток африканских популяций. Генетика. 2012; 192:1049–64.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 125.

    Vernot B, Stergachis AB, Maurano MT, Vierstra J, Neph S, Thurman RE, et al.Персональная и популяционная геномика регуляторных вариаций человека. Геном Res. 2012; 22:1689–97.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 126.

    Фрейзер HB. Экспрессия генов вызывает локальную адаптацию у людей. Геном Res. 2013; 23:1089–96.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 127.

    Пикрелл Дж.К.Совместный анализ функциональных геномных данных и полногеномные ассоциативные исследования 18 человеческих признаков. Am J Hum Genet. 2014; 94: 559–73.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 128.

    Шауб М.А., Бойл А.П., Кундайе А., Бацоглу С., Снайдер М. Связь ассоциаций болезней с регуляторной информацией в геноме человека. Геном Res. 2012; 22:1748–59.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 129.

    Накагоме С., Алькорта-Аранбуру Г., Амато Р., Хоуи Б., Питер Б.М., Хадсон Р.Р. и др. Оценка возраста сигналов отбора в разные эпохи истории человечества. Мол Биол Эвол. 2016; 33: 657–69.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 130.

    Питер Б.М., Уэрта-Санчес Э., Нильсен Р. Отличие выборочных зачисток от постоянной вариации и мутации de novo. Генетика PLoS. 2012;8:e1003011.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 131.

    Allentoft ME, Sikora M, Sjogren KG, Rasmussen S, Rasmussen M, Stenderup J, et al. Популяционная геномика Евразии бронзового века. Природа. 2015; 522:167–72.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 132.

    Мэтисон И., Лазаридис И., Роланд Н., Маллик С., Паттерсон Н., Руденберг С.А. и др. Полногеномные закономерности отбора у 230 древних евразийцев. Природа. 2015; 528: 499–503.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 133.

    Берг Дж. Дж., Куп Г. Популяционный генетический сигнал полигенной адаптации. Генетика PLoS. 2014;10:e1004412.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья КАС Google Scholar

  • 134.

    Turchin MC, Chiang CW, Palmer CD, Sankararaman S, Reich D, Hirschhorn JN. Свидетельство широко распространенного отбора по изменчивости стояния в Европе по SNP, связанным с ростом. Нат Жене. 2012;44:1015–9.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 135.

    Мессер П.В., Петров Д.А. Популяционная геномика быстрой адаптации мягкими выборочными зачистками. Тенденции Экол Эвол. 2013; 28: 659–69.

    ПабМед Статья Google Scholar

  • 136.

    Charlesworth D. Балансирующий отбор и его влияние на последовательности в близлежащих регионах генома. Генетика PLoS. 2006;2:e64.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья КАС Google Scholar

  • 137.

    Кляйн Дж., Сато А., Нагл С., О’ХУигин С. Молекулярный межвидовой полиморфизм. Annu Rev Ecol Syst. 1998; 29:1–21.

    Артикул Google Scholar

  • 138.

    Эллисон АС. Защита, обеспечиваемая серповидно-клеточным признаком, против субтертианской малярийной инфекции. Br Med J. 1954; 1: 290–4.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 139.

    Кляйн Дж., Сатта Й., О’ХУигин С., Такахата Н.Молекулярное происхождение главного комплекса гистосовместимости. Анну Рев Иммунол. 1993; 11: 269–95.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 140.

    Hughes AL, Nei M. Паттерн замены нуклеотидов в локусах класса I главного комплекса гистосовместимости выявляет сверхдоминантный отбор. Природа. 1988; 335: 167–70.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 141.

    Prugnolle F, Manica A, Charpentier M, Guegan JF, Guernier V, Balloux F. Селекция, управляемая патогенами, и всемирное разнообразие HLA класса I. Карр Биол. 2005; 15:1022–1027.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 142.

    Segurel L, Thompson EE, Flutre T, Lovstad J, Venkat A, Margulis SW, et al. Группа крови системы АВО является межвидовым полиморфизмом у приматов. Proc Natl Acad Sci U S A. 2012;109:18493–8.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 143.

    Кальяни Р., Герини Ф.Р., Фумагалли М., Рива С., Альярди С., Галимберти Д. и др. Трансспецифический полиморфизм в ZC3HAV1 поддерживается длительным уравновешивающим отбором и может придавать предрасположенность к рассеянному склерозу. Мол Биол Эвол. 2012;29:1599–613.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 144.

    Леффлер Э.М., Гао З., Пфайфер С., Сегурел Л., Аутон А., Венн О. и соавт. Несколько примеров древнего уравновешивающего отбора, общего между людьми и шимпанзе.Наука. 2013; 339:1578–82.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 145.

    Teixeira JC, de Filippo C, Weihmann A, Meneu JR, Racimo F, Dannemann M, et al. Долгосрочный балансирующий отбор в LAD1 поддерживает межвидовой полиморфизм миссенс у людей, шимпанзе и бонобо. Мол Биол Эвол. 2015; 32:1186–96.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 146.

    Single RM, Martin MP, Gao X, Meyer D, Yeager M, Kidd JR и др. Глобальное разнообразие и доказательства совместной эволюции KIR и HLA. Нат Жене. 2007; 39:1114–9.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 147.

    Андрес А.М., Хубиш М.Дж., Индап А., Торгерсон Д.Г., Дегенхардт Д.Д., Бойко А.Р. и соавт. Мишени балансирующего отбора в геноме человека. Мол Биол Эвол. 2009; 26: 2755–64.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 148.

    Де Джорджио М., Лохмюллер К.Е., Нильсен Р. Основанный на модели подход к выявлению признаков древнего уравновешивающего отбора в генетических данных. Генетика PLoS. 2014;10:e1004561.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья КАС Google Scholar

  • 149.

    Rasmussen MD, Hubisz MJ, Gronau I, Siepel A. Полногеномный вывод графов рекомбинации предков. Генетика PLoS. 2014;10:e1004342.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья КАС Google Scholar

  • 150.

    Феррер-Адметла А., Бош Э., Сикора М., Маркес-Боне Т., Рамирес-Сориано А., Мунтаселл А. и др. Балансирующий отбор является основной силой, формирующей эволюцию генов врожденного иммунитета. Дж Иммунол. 2008; 181:1315–22.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 151.

    Bronson PG, Mack SJ, Erlich HA, Slatkin M. Основанный на последовательности подход демонстрирует, что уравновешивающий отбор в классических локусах человеческого лейкоцитарного антигена (HLA) является асимметричным.Хум Мол Жене. 2013;22:252–61.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 152.

    Андрес А.М., Деннис М.Ю., Кречмар В.В., Кэннонс Д.Л., Ли-Лин С.К., Херл Б. и др. Балансирующий отбор поддерживает форму ERAP2, которая подвергается нонсенс-опосредованному распаду и влияет на презентацию антигена. Генетика PLoS. 2010;6:e1001157.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья КАС Google Scholar

  • 153.

    Norman PJ, Abi-Rached L, Gendzekhadze K, Korbel D, Gleimer M, Rowley D, et al. Необычная селекция рецептора естественных клеток-киллеров KIR3DL1/S1 у африканцев. Нат Жене. 2007; 39:1092–9.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 154.

    Fumagalli M, Fracassetti M, Cagliani R, Forni D, Pozzoli U, Comi GP, et al. Эволюционная история кластера генов селектина у людей. Наследственность (Эдинб). 2012;109:117–26.

    КАС Статья Google Scholar

  • 155.

    Hollox EJ, Броня JA. Направленный и балансирующий отбор в бета-дефенсинах человека. БМС Эвол Биол. 2008; 8:113.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья КАС Google Scholar

  • 156.

    Леонарди М., Либрадо П., Дер Саркисян С., Шуберт М., Альфархан А.Х., Алькураиши С.А. и др. Эволюционные закономерности и процессы: уроки древней ДНК. Сист биол. 2016. Дои: 10.1093/sysbio/syw059

  • 157.

    Хабер М., Меццавилла М., Сюэ Ю., Тайлер-Смит С. Древняя ДНК и переписывание истории человечества: щадьте бритву Оккама. Геном биол. 2016;17:1.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья КАС Google Scholar

  • 158.

    Ваттатил С., Акей Дж.М. Небольшие количества архаичных примесей дают большое представление об истории человечества. Клетка. 2015;163:281–4.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 159.

    Wong SH, Gochhait S, Malhotra D, Pettersson FH, Teo YY, Khor CC, et al. Лепра и адаптация человеческого толл-подобного рецептора 1. PLoS Pathog. 2010;6:e1000979.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья КАС Google Scholar

  • 160.

    Uciechowski P, Imhoff H, Lange C, Meyer CG, Browne EN, Kirsten DK, et al. Восприимчивость к туберкулезу связана с полиморфизмом TLR1, приводящим к отсутствию экспрессии TLR1 на клеточной поверхности.Дж. Лейкок Биол. 2011;90:377–88.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 161.

    Broushaki F, Thomas MG, Link V, Lopez S, van Dorp L, Kirsanow K, et al. Геномы раннего неолита из восточной части Плодородного полумесяца. Наука. 2016; 353:499–503.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 162.

    Хофманова З., Крейцер С., Хелленталь Г., Селл С., Дикманн Ю., Диез-Дель-Молино Д. и др.Ранние земледельцы со всей Европы были прямыми потомками жителей Эгейского моря эпохи неолита. Proc Natl Acad Sci U S A. 2016;113:6886–91.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 163.

    Nielsen R, Hubisz MJ, Hellmann I, Torgerson D, Andres AM, Albrechtsen A, et al. Дарвиновские и демографические силы, воздействующие на гены, кодирующие белок человека. Геном Res. 2009; 19: 838–49.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 164.

    Джорджи Б., Войт Б.Ф., Букан М. От мыши к человеку: эволюционный геномный анализ человеческих ортологов основных генов. Генетика PLoS. 2013;9:e1003484.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 165.

    Баттл А., Мостафави С., Чжу Х., Поташ Дж.Б., Вайсман М.М., Маккормик С. и др. Характеристика генетической основы разнообразия транскриптомов посредством секвенирования РНК 922 человек. Геном Res. 2014; 24:14–24.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 166.

    Gerstein MB, Kundaje A, Hariharan M, Landt SG, Yan KK, Cheng C, et al. Архитектура регуляторной сети человека, полученная из данных ENCODE. Природа. 2012; 489:91–100.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 167.

    Fraser HB, Hirsh AE, Steinmetz LM, Scharfe C, Feldman MW.Скорость эволюции в сети белковых взаимодействий. Наука. 2002; 296:750–2.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 168.

    Джордан И.К., Марино-Рамирес Л., Вольф Ю.И., Кунин Е.В. Сохранение и коэволюция в безмасштабной сети коэкспрессии генов человека. Мол Биол Эвол. 2004;21:2058–70.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 169.

    Torgerson DG, Boyko AR, Hernandez RD, Indap A, Hu X, White TJ, et al.Эволюционные процессы, воздействующие на кандидаты в цис-регуляторные области у людей, выведены из паттернов полиморфизма и дивергенции. Генетика PLoS. 2009;5:e1000592.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья КАС Google Scholar

  • 170.

    Katzman S, Kern AD, Bejerano G, Fewell G, Fulton L, Wilson RK, et al. Ультраконсервативные элементы генома человека являются ультраселективными. Наука. 2007; 317:915.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 171.

    Дрейк Дж. А., Берд С., Немеш Дж., Томас Д. Д., Ньютон-Че С., Реймонд А. и др. Консервативные некодирующие последовательности являются выборочно ограниченными, а не мутационными холодными точками. Нат Жене. 2006; 38: 223–7.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 172.

    Казанова Дж.Л., Абель Л., Кинтана-Мурси Л. Человеческие TLR и IL-1R в защите хозяина: естественные выводы из эволюционной, эпидемиологической и клинической генетики. Анну Рев Иммунол. 2011;29:447–91.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 173.

    Алкаис А., Кинтана-Мурси Л., Талер Д.С., Шурр Э., Абель Л., Казанова Дж.Л. Жизнеугрожающие инфекционные заболевания детского возраста: моногенные врожденные ошибки иммунитета? Энн Н.Ю. Академия наук. 2010;1214:18–33.

    ПабМед Статья Google Scholar

  • 174.

    Boisson-Dupuis S, Kong XF, Okada S, Cypowyj S, Puel A, Abel L, et al.Врожденные ошибки STAT1 человека: аллельная гетерогенность определяет разнообразие иммунологических и инфекционных фенотипов. Курр Опин Иммунол. 2012; 24: 364–78.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 175.

    Перес де Диего Р., Санчо-Шимизу В., Лоренцо Л., Пуэль А., Планкулен С., Пикард С. и др. Дефицит адапторной молекулы TRAF3 человека приводит к нарушению ответа Toll-подобного рецептора 3 и восприимчивости к энцефалиту простого герпеса.Иммунитет. 2010;33:400–11.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 176.

    Казанова Дж. Л., Абель Л., Кинтана-Мурси Л. Иммунология, преподаваемая генетикой человека. Cold Spring Harb Symp Quant Biol. 2013;78:157–72.

    ПабМед Статья Google Scholar

  • 177.

    Колонна В., Аюб К., Чен Ю., Пагани Л., Луизи П., Пибус М. и др. Области генома человека с исключительно высоким уровнем популяционной дифференциации идентифицированы из 911 полногеномных последовательностей.Геном биол. 2014;15:R88.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 178.

    Corona E, Chen R, Sikora M, Morgan AA, Patel CJ, Ramesh A, et al. Анализ генетической основы болезней в контексте всемирных человеческих отношений и миграции. Генетика PLoS. 2013;9:e1003447.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 179.

    Young JH, Chang YP, Kim JD, Chretien JP, Klag MJ, Levine MA, et al. Дифференциальная восприимчивость к гипертензии обусловлена ​​отбором во время экспансии за пределы Африки. Генетика PLoS. 2005;1:e82.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья КАС Google Scholar

  • 180.

    Chen R, Corona E, Sikora M, Dudley JT, Morgan AA, Moreno-Estrada A, et al. Аллели риска диабета 2 типа демонстрируют крайнюю направленную дифференциацию среди человеческих популяций по сравнению с другими заболеваниями.Генетика PLoS. 2012;8:e1002621.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 181.

    Андерсен К.Г., Шилахтер И., Табризи С., Гроссман С.Р., Хаппи К.Т., Сабети П.С. Сканирование всего генома свидетельствует о положительном отборе генов, связанных с лихорадкой Ласса. Philos Trans R Soc Lond B Biol Sci. 2012; 367: 868–77.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 182.

    Key FM, Питер Б., Деннис М.Ю., Уэрта-Санчес Э., Тан В., Прокунина-Олссон Л. и др. Отбор варианта, связанного с улучшенным клиренсом вируса, приводит к локальной адаптивной псевдогенизации интерферона лямбда 4 (IFNL4). Генетика PLoS. 2014;10:e1004681.

    ПабМед ПабМед Центральный Статья КАС Google Scholar

  • 183.

    Фумагалли М., Сирони М., Поццоли У., Феррер-Адметла А., Паттини Л., Нильсен Р. Признаки генетической адаптации к окружающей среде определяют патогены как основное селективное давление в ходе эволюции человека.Генетика PLoS. 2011;7:e1002355.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 184.

    Dudley JT, Kim Y, Liu L, Markov GJ, Gerold K, Chen R, et al. Варианты геномных болезней человека: нейтральное эволюционное объяснение. Геном Res. 2012; 22:1383–94.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 185.

    Нил СП. Сахарный диабет: «экономный» генотип, нанесший ущерб «прогрессу»? Am J Hum Genet.1962; 14: 353–62.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Google Scholar

  • 186.

    Fumagalli M, Pozzoli U, Cagliani R, Comi GP, Riva S, Clerici M, et al. Паразиты представляют собой основную селективную силу для генов интерлейкинов и формируют генетическую предрасположенность к аутоиммунным заболеваниям. J Эксперт Мед. 2009; 206:1395–408.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 187.

    Радж Т., Кучру М., Реплогле Дж. М., Райчаудхури С., Незнакомец Б. Е., Де Джагер П.Л. Аллели общего риска воспалительных заболеваний являются мишенями недавней положительной селекции. Am J Hum Genet. 2013;92:517–29.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 188.

    Жернакова А., Эльберс С.С., Ферверда Б., Романос Дж., Трынка Г., Дюбуа П.С. и соавт. Эволюционный и функциональный анализ локусов риска целиакии показывает, что Sh3B3 является защитным фактором против бактериальной инфекции.Am J Hum Genet. 2010;86:970–7.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 189.

    Уриккио Л.Х., Зайтлен Н.А., Йе К.Дж., Витте Дж.С., Эрнандес Р.Д. Отбор и взрывной рост изменяют генетическую архитектуру и затрудняют обнаружение причинных редких вариантов. Геном Res. 2016; 26: 863–73.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 190.

    Field Y, Boyle EA, Telis N, Gao Zu, Gaulton KJ, Golan D, et al. Обнаружение адаптации человека за последние 2000 лет. Наука. 13 октября 2016 г. Доступно по адресу: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pubmed/27738015 [Epub перед печатью]

  • 191.

    Пруфер К., Расимо Ф., Паттерсон Н., Джей Ф., Санкарараман С. , Сойер С. и др. Полная последовательность генома неандертальца из Горного Алтая. Природа. 2014; 505:43–9.

    ПабМед Статья КАС Google Scholar

  • 192.

    Мейер М., Кирхер М., Гансауг М.Т., Ли Х., Расимо Ф., Маллик С. и др. Последовательность генома с высоким охватом архаичного денисовца. Наука. 2012; 338: 222–6.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 193.

    Green RE, Krause J, Briggs AW, Maricic T, Stenzel U, Kircher M, et al. Черновая последовательность генома неандертальца. Наука. 2010;328:710–22.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 194.

    Санкарараман С., Маллик С., Даннеманн М., Пруфер К., Келсо Дж., Паабо С. и др. Геномный ландшафт предков неандертальцев у современных людей. Природа. 2014; 507:354–7.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 195.

    Рейх Д., Грин Р.Э., Кирхер М., Краузе Дж., Паттерсон Н., Дюран Э.Ю. и др. Генетическая история архаичной группы гоминидов из Денисовой пещеры в Сибири. Природа. 2010; 468:1053–60.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 196.

    Райх Д., Паттерсон Н., Кирхер М., Дельфин Ф., Нандинени М.Р., Пугач И. и др. Примесь Денисовой и первые современные расселения людей в Юго-Восточную Азию и Океанию. Am J Hum Genet. 2011; 89: 516–28.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 197.

    Вернот Б., Эйки Дж.М. Сложная история смешения современных людей и неандертальцев. Am J Hum Genet. 2015; 96: 448–53.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 198.

    Вернот Б., Эйки Дж.М. Воскрешение выживших неандертальцев из геномов современного человека. Наука. 2014; 343:1017–21.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 199.

    Санкарараман С., Маллик С., Паттерсон Н., Райх Д. Комбинированный ландшафт денисовского и неандертальского происхождения у современных людей. Карр Биол. 2016;26:1241–7.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 200.

    Simonti CN, Vernot B, Bastarache L, Bottinger E, Carrell DS, Chisholm RL, et al. Фенотипическое наследие смешения современных людей и неандертальцев. Наука. 2016; 351:737–41.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 201.

    Huerta-Sanchez E, Jin X, Asan, Bianba Z, Peter BM, Vinckenbosch N, et al. Адаптация к высоте у тибетцев, вызванная интрогрессией денисовской ДНК. Природа. 2014; 512:194–7.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 202.

    Abi-Rached L, Jobin MJ, Kulkarni S, McWhinnie A, Dalva K, Gragert L, et al. Формирование иммунной системы современного человека за счет межрегионального смешения с архаичным человеком. Наука. 2011; 334:89–94.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 203.

    Mendez FL, Watkins JC, Hammer MF.Гаплотип в STAT2 Интрогрессировал от неандертальцев и служит кандидатом положительного отбора в Папуа-Новой Гвинее. Am J Hum Genet. 2012; 91: 265–74.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • 204.

    Mendez FL, Watkins JC, Hammer MF. Глобальная генетическая изменчивость в OAS1 свидетельствует об архаичных примесях в меланезийских популяциях. Мол Биол Эвол. 2012;29:1513–20.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 205.

    Mendez FL, Watkins JC, Hammer MF. Неандертальское происхождение генетической изменчивости кластера генов иммунитета ОАС. Мол Биол Эвол. 2013;30:798–801.

    КАС пабмед Статья Google Scholar

  • 206.

    Даннеманн М., Андрес А.М., Келсо Дж. Интрогрессия неандертальских и денисовских гаплотипов способствует адаптивным вариациям человеческих Toll-подобных рецепторов. Am J Hum Genet. 2016;98:22–33.

    КАС пабмед ПабМед Центральный Статья Google Scholar

  • Человеческие болезни могли погубить неандертальцев | Умные новости

    Федерико Гамбарини/dpa/Corbis

    В последнее десятилетие исследователи поняли, что взаимодействие между древними людьми и неандертальцами было намного сложнее, чем считалось ранее.Мало того, что Homo sapiens конкурировали с неандертальцами за ресурсы, мы широко скрещивались с нашими двоюродными братьями-гоминидами, межвидовая связь, которая дала некоторым современным людям от одного до четырех процентов ДНК неандертальца. Новое исследование показывает, что люди, вероятно, тоже кое-что передали неандертальцам: тропические болезни.

    Исследование, опубликованное в Американском журнале физической антропологии , предполагает, что волны древних людей, путешествующих из Африки в твердыню неандертальцев в Европе, вероятно, передавались с такими насекомыми, как туберкулез, герпес, ленточные черви и язвы желудка.

    «Люди, мигрировавшие из Африки, были значительным резервуаром тропических болезней», — говорит в пресс-релизе автор исследования Шарлотта Хоулдкрофт из отдела биологической антропологии Кембриджского университета. «Для неандертальского населения Евразии, адаптированного к этой географической среде инфекционных заболеваний, воздействие новых патогенов, занесенных из Африки, могло быть катастрофическим».

    Предполагалось, что многие инфекционные заболевания возникли после развития сельского хозяйства, которое позволило людям скапливаться в городах и регулярно контактировать с домашними животными.Но недавние исследования геномов инфекционных заболеваний показывают, что они возникли на десятки тысяч или миллионы лет раньше. Хотя исследователи не нашли прямых доказательств передачи болезней между людьми и неандертальцами, в документе предполагается, что эти новые временные рамки для болезней означают, что люди, скорее всего, перенесли их, когда мигрировали на территорию неандертальцев.

    Мелисса Хогенбум из BBC отмечает, что исследователи думали, что Heliobacter pylori, микроб, вызывающий язву желудка, появился около 8000 лет назад, вскоре после начала земледелия.Но геном H. pylori показывает, что ему не менее 88 000 лет. Исследование Herpes Simplex 2, вызывающего генитальный герпес, показывает, что он был передан людям от неизвестного гоминида 1,2 миллиона лет назад.

    В отличие от передачи болезней от европейцев к коренным американцам, которая привела к массовым эпидемиям, таким как оспа, которые убили миллионы людей за короткий период времени, более вероятно, что передача болезни между людьми и неандертальцами была гораздо более локализованной, говорит Хоулдкрофт.Поскольку охотники-собиратели жили небольшими группами от 15 до 30 человек, инфекционные заболевания поражали одну изолированную группу за раз, ослабляя их общее состояние здоровья.

    «Наша гипотеза в основном состоит в том, что у каждой группы неандертальцев была своя личная катастрофа, и со временем вы теряете все больше и больше групп», — говорит она Хогенбуму. «Я не думаю, что мы когда-нибудь найдем [единственную] теорию того, что убило неандертальцев, но появляется все больше свидетельств того, что за период в несколько тысяч лет произошло множество событий, которые в совокупности убили [их].

    Болезнь Болезни и болезни Эволюция Эволюция человека Происхождение человека неандерталец Палеонтология

    Рекомендуемые видео

    Как инфекционные заболевания могли повлиять на происхождение человека

    Исследователи говорят, что инактивация двух генов позволила избежать бактериальных патогенов

    Примерно 100 000 лет назад человеческая эволюция достигла таинственного узкого места: количество наших предков сократилось до пяти-десяти тысяч особей, живущих в Африке.Со временем из этой популяции появятся «поведенчески современные» люди, резко расширившиеся как по количеству, так и по ареалу и заменившие всех других сосуществующих эволюционных кузенов, таких как неандертальцы.

    Причина узкого места остается нерешенной, и предлагаются ответы, варьирующиеся от генных мутаций до культурных изменений, таких как язык, и событий, изменяющих климат, среди которых массивное извержение вулкана.

    Добавьте еще один возможный фактор: инфекционное заболевание.

     

    Бактерии Escherichia coli , подобные этим на сканирующей электронной микрофотографии в искусственных цветах, сделанной Томасом Диринком из Национального центра микроскопии и визуализирующих исследований Калифорнийского университета в Сан-Диего, вызывают множество часто опасных для жизни состояний, особенно среди молодых людей.Варки и его коллеги предполагают, что генетическое изменение
    примерно 100 000 лет назад обеспечило улучшенную защиту от этих микробов и, вероятно, изменило эволюционное развитие человека.
    В статье, опубликованной 4 июня 2012 г. в онлайн-издании The Proceedings of the National Academy of Sciences , международная группа исследователей во главе с учеными из Медицинской школы Калифорнийского университета в Сан-Диего предполагает, что инактивация два специфических гена, связанных с иммунной системой, могли предоставить избранным предкам современных людей улучшенную защиту от некоторых патогенных бактериальных штаммов, таких как Escherichia coli K1 и Streptococci группы B , основных причин сепсиса и менингита у человеческих плодов, новорожденных и младенцев.

     

    «В небольшой ограниченной популяции одна мутация может иметь большой эффект, а редкий аллель может достигать высокой частоты», — сказал старший автор Аджит Варки, доктор медицинских наук, профессор медицины, клеточной и молекулярной медицины и соруководитель исследовательского центра. Центр академических исследований и обучения антропогенезу Калифорнийского университета в Сан-Диего. «Мы обнаружили два гена, которые не функционируют у людей, но не у родственных приматов, которые могли быть мишенями для бактериальных патогенов, особенно смертельных для новорожденных и младенцев.Убийство очень молодых особей может серьезно повлиять на репродуктивную способность. Тогда выживание вида может зависеть либо от сопротивления патогену, либо от устранения белков-мишеней, которые он использует, чтобы одержать верх».

    В данном случае Варки, который также является директором Центра гликобиологических исследований и обучения Калифорнийского университета в Сан-Диего, и его коллеги в США, Японии и Италии предполагают, что произошло последнее. В частности, они указывают на инактивацию двух сигнальных рецепторов, распознаваемых сиаловой кислотой (siglecs), которые модулируют иммунный ответ и являются частью большого семейства генов, которые, как считается, были очень активны в эволюции человека.

    Работая с Виктором Низе, доктором медицинских наук, профессором педиатрии и фармации, группа Варки ранее показала, что некоторые патогены могут использовать сиглеки для изменения иммунных реакций хозяина в пользу микроба. В последнем исследовании ученые обнаружили, что ген Siglec-13 больше не является частью генома современного человека, хотя он остается неповрежденным и функциональным у шимпанзе, наших ближайших эволюционных родственников. Другой ген сиглека — для сиглека-17 — все еще экспрессировался у людей, но он был слегка изменен, чтобы сделать короткий неактивный белок бесполезным для инвазивных патогенов.

    «Секвенирование генома может дать глубокое представление о том, как развиваются организмы, включая человека», — сказал соавтор Эрик Д. Грин, доктор медицинских наук, директор Национального исследовательского института генома человека при Национальном институте здравоохранения.

    В новом эксперименте ученые «воскресили» эти «молекулярные окаменелости» и обнаружили, что белки распознаются современными патогенными штаммами E. coli и Streptococci группы B . «Современные жуки все еще могут связываться и потенциально могут изменять иммунные реакции», — сказал Варки.

    Хотя невозможно точно определить, что произошло во время эволюции, исследователи изучили молекулярные сигнатуры, окружающие эти гены, чтобы выдвинуть гипотезу о том, что предшественники современного человека столкнулись с огромной патогенной угрозой между 100 000 и 200 000 лет назад. Эта предполагаемая «выборочная зачистка» уничтожила бы их число. Выжили только люди с определенными генными мутациями — крошечная возникающая популяция анатомически современных людей, в результате чего все живущие сегодня будут обладать нефункциональным геном Siglec-17 и отсутствующим геном Siglec-13.

    Варки сказал, что эволюционное узкое место человечества, вероятно, было сложным результатом множества взаимодействующих факторов. «Видообразование (процесс эволюции новых видов из существующих) обусловлено многими вещами», — сказал он. «Мы думаем, что инфекционные агенты являются одним из них».

    Соавторами документа являются Xiaoxia Wang, Ismael Secundino, Nivedita Mitra, Kalyan Banda, Vered Padler-Karavani, Andrea Verhagen и Chris Reid, Victor Nizet и Jack D. Bui, отделы медицины, клеточной и молекулярной медицины, патологии и Педиатрия, Калифорнийский университет в Сан-Диего и Центр исследований и обучения гликобиологии Калифорнийского университета в Сан-Диего; Школа фармации и фармацевтических наук Скаггса и Центр академических исследований и обучения в области антропогенеза Калифорнийского университета в Сан-Диего / Солка; Мартина Лари, Карлотта Бальзамо и Дэвид Карамелли, кафедра эволюционной биологии, лаборатория антропологии, Флорентийский университет; Ermanno Rizzi, Giorgio Corti, Gianluca De Bellis, Институт биомедицинских технологий, Национальный исследовательский совет, Италия; Лаура Лонго, факультет наук об окружающей среде, Сиенский университет, Италия; Уильям Беггс и Сара Тишкофф, факультеты генетики и биологии Пенсильванского университета; Тосиюки Хаякава, Научно-исследовательский институт приматов Киотского университета; Педро Крус, Эрик Д.Грин и Джеймс С. Малликин, Национальный исследовательский институт генома человека, Национальные институты здравоохранения.

    Финансирование этого исследования частично поступило из гранта Национального института здравоохранения 1P01HL107150 (Программа передового опыта NHLBI в области гликонаук) и Фонда Мазерса в Нью-Йорке.

    # # #

    Контакт для СМИ: Скотт ЛаФи, 619-543-6163, [email protected]

    Защита от инфекционных заболеваний среди древних людей

    За последнее десятилетие наше человеческое эволюционное древо превратилось в нечто, больше напоминающее неуклюжий куст.Ученые обнаружили измененные сегменты ДНК, которые мы разделили в результате спаривания между двумя другими гоминидами, неандертальцами и денисовцами, которые были впервые секвенированы в 2010 и 2014 годах соответственно.

    Сколько наших двоюродных братьев-гоминидов осталось в каждом из нас сегодня, и дает ли присутствие ДНК древних гоминидов какие-либо преимущества или недостатки адаптации, было главной областью исследования.

    Ученые показали, что отдельные гены гоминидов могут давать преимущества, в том числе знаменитый случай адаптации к высокогорью, который стал результатом замены ДНК, также известной как геномная интрогрессия, у денисовца на ген EPAS1.Это открытие может помочь объяснить, почему тибетцы уникально приспособлены к высокогорной жизни.

    Но поскольку большинство болезней, вероятно, являются результатом действия нескольких генов и часто проявляют сложные черты, расшифровка вклада древних гоминидов в наши геномы была трудной задачей.

    Теперь, в новом исследовании, опубликованном в расширенном онлайн-издании «Молекулярная биология и эволюция », ученые Александр Гуи и Лоран Экскоффье разработали новые вычислительные инструменты для лучшего анализа наборов данных генома человека и нашли больше доказательств наследия адаптации древних гоминидов. , особенно для борьбы с инфекционными заболеваниями, такими как малярия.

    «Наши результаты подтверждают, что архаическая интрогрессия широко распространена в генах, связанных с иммунитетом, и что патогены представляют сильное избирательное давление, которое может быть одной из основных причин адаптивной эволюции у людей», — говорят авторы. «В целом, наши результаты показывают, что архаичная интрогрессия повлияла на метаболизм человека и реакцию на различные типы патогенов (бактерии, вирусы и протисты), которые были критически определяющими в ходе адаптивной истории человека», — сказал Экскофьер.

    В этом исследовании дуэт проанализировал последние архаичные карты интрогрессии, которые недавно стали доступны для 35 меланезийцев, а также образцы из проекта «1000 геномов».

    «Наши результаты показывают не только то, что интрогрессия обнаруживается во многих генах, участвующих в одних и тех же функциях, но также и то, что некоторые из этих взаимодействующих генов, несущих архаичную ДНК, были отобраны совместно», — сказал Гуи.

    Вместо того, чтобы анализировать отдельные гены, они сосредоточились на методах обнаружения паттернов интрогрессии на основе анализа биологических путей и наборов данных о связанных генах и подсетях.

    Им удалось идентифицировать высокоинтрогрессивные подсети среди трех баз данных основных биологических путей (KEGG, NCI и Reactome) и среди каждой из трех популяций, которые они изучали, включая выходцев из Восточной Азии, европейцев и жителей Папуа-Новой Гвинеи.

    Один из самых ярких примеров возможной устойчивости к малярии среди жителей Папуа-Новой Гвинеи.

    «Одним из самых ярких доказательств адаптивной интрогрессии является возможная устойчивость к малярии среди жителей Папуа-Новой Гвинеи», — сказал Экскофье.

    Кроме того, помимо инфекционных заболеваний, они также обнаружили доказательства интрогрессии в генах, связанных с порфиринами, которые участвуют в энергетическом обмене (дыхательная цепь) и связывании железа и кислорода в эритроцитах (гемоглобин) и мышцах (миоглобин), а также в обонятельные рецепторы, показывающие сигналы интрогрессии неандертальцев среди современных европейских популяций.

    Одной из наиболее спорных областей является развитие современного человеческого поведения и познания. Хотя авторы предупреждают, что работа все еще очень предварительная, они нашли доказательства интрогрессии среди генных сетей, участвующих в таких функциях.

    «Эти результаты предполагают, что архаичная интрогрессия могла также повлиять на поведенческие/нейронные черты, хотя трудно связать эти фенотипы с точным давлением отбора».

    Их результаты основаны на других исследованиях, которые идентифицировали неандертальские варианты в двух локусах SLC (SLC6A11, SLC6A13), которые ранее были связаны с поведенческими чертами (депрессия, расстройства настроения, курение), и некоторые варианты генов, которые, как было показано, преимущественно экспрессируются в мозгу.

    «У папуасов мы также обнаружили гены, демонстрирующие значительный избыток интрогрессии, которые соответственно связаны с предрасположенностью к аутизму и синдромом дефицита внимания/гиперактивности, например, SLC9A9», — сказал Гуи. Они также сообщили о других генах из того же семейства, которые имеют предвзятую экспрессию в головном мозге и показывают избыток интрогрессированных сегментов у жителей Восточной Азии и европейцев, включая SLC6A1 (переносчик ГАМК), SLC6A5 (переносчик нейромедиаторов) и SLC28A1, а также у жителей Папуа-Новой Гвинеи с SLC4A10 (контролирующий внутриклеточный рН нейронов и внеклеточной жидкости мозга).

    Потребуются дальнейшие исследования этих областей влияния, чтобы выявить их вклад в здоровье и болезни человека.

    Несмотря на то, что общий уровень интрогрессии неандертальцев и денисовцев у современных людей довольно низок (обычно 1-3%), их данные продолжают строить научные доводы в пользу того, что сохранившаяся ДНК гоминидов помогла сформировать адаптацию современного человека. Это также предполагает, что эти гоминидные окна в прошлое оказывают сильное влияние и продолжают оказывать влияние на нынешнюю приспособленность современных людей.

    ###



    Журнал

    Молекулярная биология и эволюция

    Отказ от ответственности: AAAS и EurekAlert! не несут ответственности за достоверность новостных сообщений, размещенных на EurekAlert! содействующими учреждениями или для использования любой информации через систему EurekAlert.

    Добавить комментарий

    Ваш адрес email не будет опубликован.