Str mitis: Медсовет для врачей | Remedium.ru

S. pneumoniae

Септический артрит Streptococcus gordonii: два случая и обзор литературы | BMC Infectious Diseases

Все основные исследования септического артрита показывают, что преобладающими возбудителями септического артрита являются либо стафилококки, либо стрептококки [5–13].На эти микроорганизмы приходится 91% случаев [6]. Грамотрицательные микроорганизмы чаще встречаются у пожилых пациентов или пациентов с ослабленным иммунитетом, чем у молодых людей. Анаэробные микроорганизмы редко вызывают септический артрит, но чаще возникают при проникающих травмах в анамнезе [5, 14]. Однако стрептококки группы viridans редко являются возбудителями септического артрита. Группа S. viridans представляет собой гетерогенную группу организмов со сложной и противоречивой таксономией. Сегодня эта группа подразделяется на 6 основных групп: S.mutans , S. salivarius , S. anginosus , S. mitis и S. bovis [15]. На основании фенотипических реакций группа S. mitis может быть далее разделена на S. sanguinis (ранее известный как S. sanguis ), который включает S. gordonii, и S. mitis. Стрептококки группы viridans входят в состав комменсальной флоры и обладают низкой вирулентностью, а заражение этим микроорганизмом обычно возникает на ранее травмированном очаге [2, 15].Однако его связь с кариесом зубов и бактериальным эндокардитом хорошо известна [2, 16]. В комплексных обзорах по теме стрептококки группы зеленых не упоминаются как этиологические агенты септического артрита [5]. Однако были выявлены отдельные случаи, преимущественно поражающие коленный, грудино-ключичный, акромиально-ключичный и крестцово-подвздошный суставы [2, 17–20]. В одном из этих случаев септический артрит был ассоциирован с бактериальным эндокардитом [20]. Бланкштейн и др. [18] описали легкую травму, незадолго предшествовавшую развитию септического явления.Альфа-гемолитические стрептококки были вовлечены в 15 случаев спондилодисцита, включая группу S. mitis ( S. mitis и S. sanguinis ) и S. anginosus [21]. Другие представители Streptococcus viridans из группы S. mitis ( S. sanguinis и S. oralis ) были описаны в отчетах о случаях заболевания как возбудители септического артрита [22–24]. Мы не нашли ни одного случая септического артрита Streptococcus gordonii в современной литературе.

Факторы риска развития суставного сепсиса включают: ревматоидный артрит (РА) или остеоартрит, протезированные суставы, низкий социально-экономический статус, внутривенное употребление наркотиков, алкоголизм, сахарный диабет, предыдущую внутрисуставную инъекцию кортикостероидов и кожные язвы [5].

Перспективное исследование бактериального артрита в сообществе показало, что ряд факторов, по-видимому, связан с неблагоприятным прогнозом. К ним относятся пожилой возраст, ранее существовавшие заболевания суставов и наличие синтетического материала внутри сустава [25].

Септический артрит обычно проявляется горячим, опухшим, чувствительным суставом или суставами с ограниченным диапазоном движений. Симптомы обычно присутствуют в течение менее 2 недель при поступлении, но может произойти значительная задержка, особенно при низковирулентных микроорганизмах, туберкулезе и инфекции протезов. Крупные суставы поражаются чаще, чем мелкие суставы. До 60% случаев поражаются тазобедренные или коленные суставы [5, 8, 26, 27]. При наличии ранее существовавшего воспалительного заболевания суставов, такого как РА, симптомы в пораженном суставе или суставах несоразмерны активности заболевания, обнаруженной в других суставах [5].

Наш первый пациент — пожилой пациент с плохим состоянием зубов. Мы предположили, что у него была транзиторная бактериемия (несмотря на тот факт, что множественные культуры крови при поступлении были отрицательными) и что ранее существовавший тяжелый дегенеративный артрит коленного сустава способствовал бактериальному трансплантату в этом очаге. Второй пациент — также пожилая женщина с ранее существовавшей вальвулопатией и эндопротезированием коленного сустава. Мы также предположили, что у нее была транзиторная бактериемия и развился эндокардит и инфекция протезированных суставов.

Своевременный микроскопический анализ и посев синовиальной жидкости являются основными диагностическими инструментами при оценке возможного суставного сепсиса, позволяя быстро подтвердить диагноз (как сепсиса, так и вызванного кристаллами артрита). Посев более чувствителен, чем микроскопия, так как окрашивание синовиальной жидкости по Граму дает положительный результат только в 50% случаев.

Цитология синовиальной жидкости показывает количество лейкоцитов в среднем 100 000 клеток/мм 91 350 3 91 351 (от 25 000 до 250 000 клеток/мм 91 350 3 91 351 ). Число клеток более 50 000 клеток/мм ³ с более чем 90% нейтрофилов делает диагноз септического артрита весьма вероятным [28]. Coutlakis et al. в своем ретроспективном исследовании 202 пациентов показали, что, когда количество клеток в синовиальной жидкости превышает 100 000/мм ³ , у 77% пациентов был септический артрит, в то время как у 47% пациентов был диагностирован СА, если клетки -количество было между 50.000 и 100.000/мм ³ . Ниже порога 50 000/мм ³ диагноз СА был менее вероятен [29], хотя и не исключает его.Септический артрит с количеством лейкоцитов < 25 000/мм ³ может встречаться в основном у пациентов с онкологическими заболеваниями в анамнезе, у тех, кто принимает кортикостероиды или у лиц, злоупотребляющих наркотиками внутривенно, хотя количество нейтрофилов остается выше 90%. При эндопротезировании коленного сустава количество лейкоцитов в синовиальной жидкости более 1,7 × 10 ³ /мм ³ имело чувствительность 94% и специфичность 88% для инфекции протезированных суставов (ПИС) [30]. Дифференциал синовиальных полиморфноядерных нейтрофилов выше 65% имел чувствительность 94% и специфичность 98% для ППИ.

Аспирация синовиальной жидкости также позволяет искать кристаллы для исключения подагры или микрокристаллического артрита.

Могут быть выполнены другие лабораторные исследования, такие как уровни глюкозы: (SA: глюкоза < 40 мг/дл или 50% гликемии) или лактаты (высокие уровни). Хотя они неспецифичны, они повышают вероятность диагноза септического артрита [31, 32].

Краеугольным камнем быстрого и достоверного подтверждения диагноза подозрения на септический артрит является микробиологическое исследование синовиальной жидкости.Однако чувствительность обнаружения возбудителей часто разочаровывает. Общепринято, что образцы свежеаспирированной суставной жидкости следует отправлять в лабораторию для немедленного анализа. Неспособность обнаружить возбудитель у пациентов с септическим артритом связана с различными факторами, включая небольшой объем культивируемого образца, гнойный экссудат, который может оказывать ингибирующее действие на рост бактерий, и более низкую концентрацию бактерий в синовиальной жидкости. В этом случае инокуляция синовиальной жидкости в среду для культивирования крови, такую ​​как система BACTEC (системы диагностических инструментов Becton Dickinson) или пробирки для педиатрического изолятора, увеличивает выделение микроорганизмов. Инокуляция стерильных образцов, таких как синовиальная жидкость, непосредственно в систему BACTEC является обычной практикой в ​​нашем учреждении и позволила выявить этиологический агент в двух вышеупомянутых случаях. В настоящее время идентификация стрептококков группы viridans с помощью ручных или автоматических методов остается затруднительной.Это, вместе с таксономическими проблемами в этой группе организмов, сделало идентификацию на видовом уровне не всегда точной и часто отсутствовало во многих зарегистрированных случаях септического артрита стрептококками группы viridans. Матричная лазерная десорбция-ионизация-время полета (MALDITOF) является быстрым и экономичным инструментом для идентификации культур бактерий. Недавние исследования, сравнивающие возможности этой системы с биохимическими анализами, показали, что MALDITOF оказался быстрым и точным способом идентификации стрептококков группы зеленящих [33]. Этот метод дал правильную идентификацию S. gordonii у наших пациентов, что было подтверждено анализом последовательности гена 16S рРНК.

Лечение септического артрита различается в зависимости от сустава: нативный или искусственный сустав. Своевременное лечение антибиотиками вместе с удалением любого гнойного материала является основой лечения септического артрита.

Существует мало доказательств, на которых можно основывать выбор и продолжительность лечения антибиотиками, и мы не нашли проспективных рандомизированных контролируемых испытаний.В одном систематическом обзоре и метаанализе антибиотикотерапии инфекций суставов не было выявлено преимуществ по клинической или бактериологической эффективности одного режима антибиотикотерапии перед другим [34]. В настоящее время выбор антибиотика основывается на вероятности вовлечения микроорганизма, модифицированного результатами окрашивания по Граму и посева.

Удаление гнойного содержимого может быть достигнуто либо хирургическим путем, либо посредством аспирации с помощью закрытой иглы. Существуют разногласия по поводу того, какой способ дренажа следует использовать.Недавно Батт и др. обнаружили, что 77% ревматологов и 66% хирургов-ортопедов (OS) в Великобритании рекомендовали хирургическое дренирование суставов; 22% и 27%, соответственно, рекомендовали повторную закрытую игольную аспирацию в качестве метода дренирования сустава [35]. Тем не менее, Ravindran et al. в недавнем исследовании, сравнивающем медикаментозное лечение (серийная аспирация закрытой иглой) и хирургическое лечение (артроскопия/артротомия в сочетании с промыванием сустава), показали, что при СА нативного сустава хирургическое лечение не превосходит медикаментозное лечение и поэтому подчеркнули необходимость тщательного отбора случаев для хирургического вмешательства [36].

Антимикробная терапия без удаления имплантата при стрептококковой инфекции протезных суставов была успешной в 45 из 63 случаев (71%) [37]. Everts et al. в своем исследовании ППИ, вызванного Streptococcus , леченного антимикробной терапией и сохранением имплантата, обнаружили показатель успеха 94% [37]. Streptococcus viridans ППИ, обработанные первичным антибиотиком и ретенцией имплантата, показали успех в 8 из 10 случаев (80%) [37]. Однако необходимо соблюдать некоторые критерии: стабильный имплантат, острая инфекция с продолжительностью симптомов менее 3 недель и пациент должен переносить длительную антимикробную терапию.В нашем втором случае мы решили провести двухэтапную операцию, потому что симптомы присутствовали в течение 4 недель, а рентген показал подозрение на расшатывание имплантата.

Обнаружение большого количества генов пневмококковых вирулентности в стрептококках Группы Гита — Университет Бирмингема

@ {011A38abf4ac463db2f56115caaa9700,

Название = «Обнаружение большого количества генов пневмококкового вирусентности в стрептококках Группы Гита»,

abstract = «Семь стрептококковых изолятов из группы mitis были проанализированы на наличие гомологов пневмококкового гена с помощью сравнительных исследований геномной гибридизации с использованием микрочипов на основе открытых рамок считывания геномов Streptococcus pneumoniae TIGR4 и R6. Разнообразие последовательностей генов пневмолизина (ply) и нейраминидазы A (nanA) было изучено более подробно в коллекции из 14 изолятов группы S. pseudopneumoniae и 29 групп mitis соответственно. Изоляты группы mitis, использованные в экспериментах с микрочипами, включали типовой штамм (NCTC 12261), два изолята S. mitis из носоглотки детей, один изолят S. mitis из случая инфекционного эндокардита, один изолят S. mitis из зубного абсцесса. и один изолят S. oralis и один изолят S. pseudopneumoniae из носоглотки детей.Результаты исследования микрочипов показали, что 5 изолятов S. mitis имели гомологи между 67 и 82 % генов вирулентности пневмококков, S. oralis гибридизовались с 83 % генов вирулентности пневмококков, а S. pseudopneumoniae гибридизовались с 92 % идентифицированных пневмококковых генов. гены вирулентности. Сравнение последовательностей генов pneumolysin, mitilysin (mly) и недавно идентифицированных псевдопневмолизина (pply) показало, что гены mly и pply более тесно связаны друг с другом, чем любой из них с ply. Напротив, последовательности гена nanA у пневмококков и стрептококков из группы mitis тесно сгруппированы вместе, имея 99 общих последовательностей.Идентичность последовательности от 4 до 99,7% с пневмококковыми аллелями nanA.»,

ключевых слов = «Бактериальные белки, сравнительная геномная гибридизация, ДНК, бактерии, люди, микрочиповый анализ, данные молекулярной последовательности, нейраминидаза, анализ последовательности, ДНК, стрептококковые инфекции, Streptococcus mitis , Streptococcus pneumoniae, стрептолизины, факторы вирулентности»,

автор = «Калам Джонстон и Джейсон Хайндс, Эндрю Смит и {ван дер Линден}, Марк и {Ван Элдере}, Йохан и Митчелл, {Тим Дж.}»,

год = «2010»,

месяц = ​​август,

doi = «10.1128/JCM.01746-09»,

language = «English»,

volume = «48»,

pages = «2762—9»,

journal = «Journal of Clinical Microbiology»,

issn = «0095-1137»,

издатель = «American Society for Microbiology»,

номер = «8»,

}

Ингибирующее действие стрептококков на рост штаммов M.

Ингибирующее действие стрептококков на рост

В тех случаях, когда нижний слой агара, засеянный тест-штаммами, не обрабатывался каталазой, мы наблюдали очень обширные, часто сливающиеся зоны угнетения роста штаммов M. catarrhalis . Шесть тестовых штаммов, равномерно нанесенных на поверхность агара 9-мм чашки Петри, полностью ингибировали рост индикаторных штаммов.Обработка поверхности агара каталазой (4000 или 10 000 единиц на чашку) приводит к резкому уменьшению зон ингибирования (таблица 2). Обработка каталазой с последующим умерщвлением живых бактериальных клеток в парах хлороформа приводит к полному подавлению ингибирующего действия пневмококков и псевдопневмококков, но не штаммов S. mitis (табл. 2).

Таблица 2 Ингибирующее действие исследуемых стрептококков на рост штаммов M. catarrhalis

Сравнительный скрининг кластеров генов, связанных с продукцией бактериоцина, у штаммов VGS группы mitis

В соответствии с данными, собранными для S.pneumoniae и его родственных видов, существует по крайней мере два кластера генов, связанных с продукцией бактериоцина: blp (бактериоциноподобные пептиды; ранее pnc или spi ) оперон и кластер cibAB (бактериоцины, индуцированные компетенцией). Оба хорошо описаны (см. Ref. Lux et al. 2007; Son et al. 2011; Kjos et al. 2016; Miller et al. 2016; Bogaardt et al. 2015), хотя путаница в названиях и расположении составляющих генов , из-за их сложной структуры, до сих пор встречается.

Реконструкция кластера blp в геномах наших штаммов представлена ​​на рис. 1а. Этот локус был сходным у всех пневмококков и псевдопневмококков, имеющих интактную регуляторную часть и БИР, состоящую из разного количества генов, кодирующих бактериоцины и белки иммунитета. Исключением был Spn_2009, в котором отсутствовали почти все гены BIR (Bacteriocin Immunity Region). Примечательно, что по сравнению со штаммами S. pneumoniae псевдопневмококки обладали значительно меньшим количеством генов, кодирующих бактериоцин, внутри области BIR.

Реконструкция кластерных структур blp ( a ) и cibAB ( b ) по данным анализа генома девяти исследуемых штаммов VGS. Верхнее изображение подготовлено с использованием программы JContextExplorer v. 3.0 (Seitzer et al. 2013). Гомологичные гены в сравниваемых образцах отмечены одинаковым цветом (за исключением генов, кодирующих бактериоцин и иммунный белок на верхнем рисунке). Двойная косая черта на нижнем рисунке указывает на разрыв в нуклеотидной последовательности Spn-NT_13856 (точка соединения двух контигов).Здесь и далее: NCBI-идентификаторы первого и последнего генов представленных фрагментов генома приведены для Spn_357

В геномах S. mitis также присутствовал кластер blp , хотя он существенно отличался от кластера S. pneumoniae . Кластер S. mitis blp сохранил регуляторные гены системы blpRH , в то время как ген, кодирующий феромон blpC , а также гены транспортера ABC были потеряны.Два из трех геномов S. mitis не содержали генов, кодирующих бактериоцин, внутри области BIR, хотя были гены, кодирующие предполагаемые иммунные белки.

Двухпептидный бактериоцин CibAB класса II предположительно является частью пути братоубийственного уничтожения (Guiral et al. 2005). Для S. pneumoniae показано, что, становясь компетентными, стрептококковые клетки продуцируют набор факторов, запускающих лизис клональных, но некомпетентных родственников. Этот механизм называется братоубийством, и было обнаружено, что бактериоцин CibAB является одним из эффекторов этого процесса.Кластер cibAB был представлен во всех исследованных геномах пневмококков и псевдопневмококков, но не был обнаружен в двух из трех геномов S. mitis (рис. 1б). Обратите внимание, что ген cibC ниже по течению от cibAB был пропущен в аннотациях и был выведен путем анализа соответствующих нуклеотидных последовательностей на основе нуклеотидной последовательности гена S. mitis B6 cibC (smi_1957). Таким образом, кластер бактериоцина cibAB не оказался специфичным для S.pneumoniae, , что противоречит более раннему предположению (Majchrzykiewicz 2011).

Следующим нашим шагом был поиск генов, кодирующих потенциальные пептиды бактериоцинов, в геномах исследуемых штаммов с использованием веб-ресурса BAGEL3.

Кластеры лантибиотиков

Помимо бактериоцинов класса II, различные виды рода Streptococcus могут продуцировать посттрансляционно модифицированные пептиды класса I, называемые лантибиотиками (Nes et al. 2007; Hakenbeck and Chhatwal 2007). У наших штаммов в геноме Spn_357 был обнаружен только один ген, кодирующий лантибиотоподобный пептид: двухпептидный бактериоцин входил в состав генного кластера (кластер I по Майхшикевичу). Этот кластер включал гены, кодирующие предполагаемую регуляцию, модификацию, транспорт и иммунные белки (рис. 2а). Этот кластер отсутствовал в других исследуемых геномах. У Spn_2009 обнаружен укороченный вариант этого кластера: утрачены модифицирующие и транспортные гены, в том числе гены бактериоцинов.

Графическое представление кластеров лантибиотиков I ( a ) и локуса pld ( b ) на основе анализа генома исследуемых штаммов. *P174 — штамм, описанный в работе (Maricic et al.2016), где обнаружен необычный тандем из четырех лантибиотоподобных генов. Квадратные скобки указывают на часть локуса pld , обнаруженного в штаммах S. mitis кластера IV локуса гена (см. текст). Серые поля выделяют гомологичные фрагменты в разных геномах

Еще один пневмококковый лантибиотический локус (пневмоланцидин, pld, локус) был описан совсем недавно Maricic et al. (2016). Он расположен на подвижном элементе, обнаруженном в некоторых линиях пневмококков. Особенностью локуса pld является необычный тандемный набор из четырех ингибирующих пептидов, три из которых абсолютно необходимы для антибактериальной активности (см. рис. 2b). Альтернативный вариант локуса лантибиотиков, описанный для штамма S. pneumoniae ATCC 700669 (Maricic et al. 2016), включает только один пептид-предшественник лантибиотиков (рис. 2b). В наших штаммах локус pld был обнаружен в Spn_357 только со структурой, «подобной ATCC 700669» (рис. 2b). Нам не удалось обнаружить этот локус в геномах других исследуемых штаммов; однако часть его, а именно фрагмент pldFEKR , обнаружена в ближайшей окрестности кластера IV у двух из трех S.mitis (см. ниже).

Лактококцин 972-подобные пептиды в геномах исследуемых штаммов

Два лактококцин 972-подобных пептида были обнаружены с помощью BAGEL3 в наших штаммах. Лактококцин 972 представляет собой бактериоцин класса IIc, полученный из Lactococcus lactis , который воздействует на клетку-мишень, ингибируя клеточное деление путем блокирования образования перегородки (Alvarez-Sieiro et al. 2016). Соответствующие локусы в геномах пневмококков были обозначены Majchrzykiewicz (2011) как кластеры III и IV.Оба кластера несут гомологичные гены, но они локализованы в разных областях генома. Оба кластера включают ген бактериоцина, предполагаемый белок самоиммунитета и транспортер ABC ниже по течению. Лактококциноподобные гены обнаружены в кластере III у Spn_357 и Spspn_22725, а также в кластере IV во всех геномах, кроме S. mitis (рис. 3). В двух геномах S. mitis весь кластер был утрачен, тогда как у Sm_11/5 иммунный и транспортный гены сохранились, но пропал структурный ген.

Графическое изображение лактококцина 972 кластеров III ( a ) и IV ( b ) соответственно. Гомологичные гены в разных образцах обозначены одинаковым цветом. Квадратные скобки указывают на часть локуса pld в геномах S. mitis на нижнем рисунке. Незакрашенными стрелками отмечены фрагменты нуклеотидных последовательностей, гомологичных генам pld1 — 3 или pld4 (см. текст)

Следует отметить, что выше положения кластера IV в геномах пневмококков, в геномах двух из трех S.mitis мы обнаружили фрагменты оперона лантибиотика pld , включая гены, необходимые для иммунитета и регуляции пневмоланцидина ( pldFEKR ) (рис. 3b). В соответствии с расположением генов в локусе pld мы ожидаем обнаружить пневмоланцидин pldA1 — 4 генов выше по течению от pldF . Собственно нуклеотидная последовательность в этом районе включала два фрагмента, сходных с генами pldA1 — 3 и pldA4 .Однако оба нуклеотидных фрагмента были разорваны стоп-кодонами.

Предполагаемые кластеры, кодирующие бактериоцины, в геномах стрептококков

Вдохновленные результатами Majchrzykiewicz, мы исследовали еще два генных локуса, предположительно связанных с активностью продукции бактериоцина. Схемы этих локусов приведены в дополнительном файле 1: Рисунок S1. Один из них, кластер V или ppu («пневмококковый пептид с неизвестной функцией»), был тщательно изучен Майхжикевичем, чтобы понять, продуцирует ли он функциональный бактериоциноподобный пептид, но не проявляет противомикробной активности, специфически связанной с бактериоциноподобным пептидом PpuA. был раскрыт.Мы обнаружили ген ppuA в четырех из девяти геномов, включая пневмококки и псевдопневмококки, но не S. mitis . Другой локус (кластер VI по Majchrzykiewicz) состоит из четырех генов, кодирующих малые пептиды, предполагаемые бактериоцины. Однако функция этих пептидов, а также бактериоциноподобный потенциал всего кластера до сих пор неясны.

Локус сактипептида в геноме штамма

В геноме Sm_13/39 обнаружен еще один ген, кодирующий бактериоциноподобный пептид, который был отнесен к сактипептидам.Сактипептиды представляют собой подкласс бактериоцинов с серным мостиком, которые характеризуются типичной структурой, включающей три или четыре цистеиновых остатка, разделенных определенным количеством аминокислот (рис. 4). Эти остатки цистеина служат для образования внутримолекулярных тиоэфирных мостиков между серой цистеина и α-углеродами других аминокислот внутри пептида (Himes et al. 2016). Выше и ниже предполагаемого бактериоцина расположены два радикальных белка, содержащих домен SAM/SPASM, которые предположительно опосредуют образование посттрансляционной тиоэфирной связи (Lohans and Vederas 2014).

Структура кластера сактипептидов по данным анализа генома Sm_13/39. Внизу рисунка показана АА-последовательность предполагаемого бактериоцина, обнаруженного в геноме Sm_13/39, в сравнении с известными сактипептидами, субтилозином А и туринцином Н

У остальных исследованных штаммов не обнаружено ни сактипептидного бактериоцина, ни соседних радикальных ферментов SAM, кодирующих гены.

Кластер

Этот локус выше по течению от comAB впервые упоминается в статье, посвященной анализу штамма S.mitis B6 геном (11), поэтому мы назвали его кластером « S. mitis ». Позднее он упоминался и при описании генома S. pseudopneumoniae IS7493 (Shahinas et al. 2013). Этот неясный локус, по-видимому, очень изменчив у разных представителей рода Streptococcus . В наших пневмококковых штаммах он включал гены, кодирующие BlpU (BlpO)-подобный бактериоцин, и (кроме Spn_357) ряд предполагаемых мембранных белков с неясной функцией (рис. 5). В этом локусе пневмококков и псевдопневмококков обнаружены гены, кодирующие регулятор транскрипции и мультилекарственный транспортер.Кроме того, элемент BOX непосредственно перед comAB сохранялся у всех видов, за исключением двух из трех штаммов S. mitis .

Реконструкция структуры кластера генов « S. mitis ». Гомологичные гены в сравниваемых образцах обозначены одинаковым цветом. Серые поля выделяют гомологичные фрагменты в разных геномах. Двойная косая черта указывает на пробелы в последовательности нуклеотидов (точка соединения двух контигов). Идентификаторы NCBI первого гена в локусе даны для Spn-NT_2298, Spspn_G42 и Sm_18/56 соответственно

В двух С.pseudopneumoniae наиболее интересным представляется расположение кластера « S. mitis ». Во-первых, он включал в себя фрагмент регулона компетенции, а именно двухкомпонентную систему регулирования, подобную ComDE. Эта система играет роль на начальном этапе компетентности, когда кодируемый геном comC внеклеточный стимулирующий компетентность пептидный феромон (CSP) воспринимается гистидинкиназным рецептором ComD, который, связываясь со своим лигандом, переносит фосфорильную группу на регулятор срабатывания ComE.Фосфорилированный ComE управляет экспрессией генов ранней компетентности (Claverys and Havarstein 2007). Однако мы не обнаружили гомологичного гена comC вблизи comDE . Обратите внимание, что мы обнаружили компетентно регулируемый cibA -подобный ген в этом локусе в обоих штаммах псевдопневмококков. В то же время имеется полный репертуар генов компетентностного регулона, расположенных в положении, эквивалентном положению генома S. pneumoniae как в S.псевдопневмонии штаммов.

Во-вторых, помимо BlpU, в этом локусе присутствовало большое количество предполагаемых генов, кодирующих бактериоциноподобный пептид класса II, с типичным сайтом процессинга GG. Кроме того, были обнаружены два гена, кодирующие иммунный белок, выше поля предполагаемых мембранных белков. Наконец, там было локализовано несколько экскретируемых пептидов с неизвестной функцией.

Удивительно, но кластер « S. mitis » был полностью потерян в двух из трех S.mitis и усечены в третьем (Sm_11/5), сохранившем только регуляторную часть comDE .

Streptococcus mitis — Обзор — Примечания о микробах

Streptococcus mitis представляет собой грамположительный кокк, относящийся к группе зеленых стрептококков, а также к группе mitis.

• Это комменсальный организм, который колонизирует различные области человеческого тела, такие как ротоглотка, кожа, желудочно-кишечный и половой тракт, как часть нормальной флоры.
• Это важный вид рода Streptococcus , состоящий из сферических или яйцевидных клеток, расположенных цепочками или парами.
• Однако он был связан с различными заболеваниями и инфекциями человеческого организма, поскольку микроорганизм действует как условно-патогенный микроорганизм в организме людей с ослабленным иммунитетом.
• Кроме того, было обнаружено, что он также является одним из основных возбудителей зеленящей стрептококковой бактериемии и инфекционного эндокардита.
• Название рода «mitis» произошло от латинского термина «mitis», означающего «мягкий», что указывает на то, что это микроорганизм с низкой патогенностью и вирулентностью, который участвует в различных типах легких инфекций.
• Впервые он был выделен и обнаружен Эндрюсом и Хордером в 1906 году в области ротоглотки человека.
• S. mitis является основным видом группы mitis, состоящей из двенадцати других видов, включая высокопатогенный S. pneumoniae .
• Виды отнесены к группе mitis стрептококков на основании их последовательностей генов 16S рРНК и данных о гибридизации нуклеиновых кислот.

• Представители рода Streptococcus относятся к группе молочнокислых бактерий, которая представляет собой таксономически разнообразную группу грамположительных, неспорообразующих бактерий определяется образованием молочной кислоты как единственного или основного конечного продукта углеводного обмена.
• Семейство Streptococcaceae классифицируется на основе анализа последовательности гена 16S рРНК в низком (< 50 мол.%) G+C ответвлении грамположительных эубактерий.
• В настоящее время род насчитывает более 50 признанных видов, большинство из которых относятся к «видовым группам», которые идентифицируются на основе их последовательностей генов 16S рРНК.
• S. mitis является одним из первых видов группы mitis, который плохо классифицируется, поскольку к одному и тому же виду применяется несколько синонимов.
• Однако в результате многочисленных фенотипических и генетических исследований было сделано новое, более четкое таксономическое описание группы.

Хабитат

часть ротовой флоры.

Кроме того, были изучены случаи колонизации S. mitis желудочно-кишечного тракта и половых путей.

Streptococcus mitis считается типичным представителем комменсальной микробиоты дыхательных путей.

Бактерии колонизируют несколько поверхностей в ротовой полости и глотке после рождения и остаются численно значительными колонизаторами этих экосистем на протяжении всей жизни.

S. mitis составляют большинство самых ранних «пионерских» видов, колонизирующих рот здоровых новорожденных, наряду с S. oralis .

Наряду с некоторыми другими видами Streptococcus он участвует в начальной колонизации зубной эмали и может присутствовать на бутылочках для кормления и при кариесе на поверхности корня.

Полость рта представляет собой динамичную среду, в которой происходят большие и быстрые колебания pH, доступности и источника питательных веществ, давления кислорода, температуры и осмоляльности, и организм, обитающий в таких областях, имеет механизмы, позволяющие справляться с такими колебаниями.

Члены S. mitis могут вызывать инфекцию при попадании в нормально стерильные части организма или у пациентов с ослабленным иммунитетом.

Оптимальной температурой для организма является средняя температура тела хозяина, но известно, что он выживает в диапазоне температур 18-40°C.

9

Морфология

из

Клетки располагаются цепочками, как и у всех других стрептококков, но часто встречаются парами и короткими цепочками. Более длинные цепи наблюдаются при выращивании на агаризованной среде.

Расположение стрептококков является результатом последовательных  плоскостей деления , параллельных друг другу, как у палочковидных бактерий.

Микроорганизм является каталазоотрицательным, факультативным анаэробом, не капсулирован и обычно несет на поверхности редко расположенные длинные фибриллы.

У большинства штаммов часто встречаются внеклеточные поверхностные структуры и разнообразные придатки клеток разной длины. Плотность структур и придатков различается в зависимости от деформации.

Клеточная стенка состоит из пептидогликана, С-полисахарида и тейхоевой кислоты. Тип пептидогликана – Lys-прямой.

Как и в других грамположительных клеточных стенках, пептидогликан состоит из множества гликановых цепей, которые поперечно связаны короткими пептидами, а гликановая часть состоит из чередующихся β-1,4-связанных звеньев N-ацетилглюкозамина и N- ацетилмурамовая кислота.

Клеточная стенка содержит рибитолтейхоевую кислоту и не содержит значительного количества рамнозы. Он содержит остатки фосфорилхолина в тейхоевых кислотах своей клеточной оболочки.

На клеточной стенке присутствуют различные поверхностные белки, связанные с клеточной стенкой, которые помогают организму связываться с различными поверхностями хозяина.

Под клеточной стенкой находится клеточная мембрана, состоящая из двойного липидно-белкового слоя, а также различные транспортные механизмы для перемещения молекул в клетку и из нее.

Рисунок: (A) Клетки S. mitis (окраска по Граму). (B) Колонии S. mitis (чашка с агаром TPY). (C) Колонии S. mitis (чашка с агаром BHI). (D) Колонии S. mitis (стереомикроскоп). Источник изображения: Атлас микробиологии полости рта (ScienceDirect).

Культуральные характеристики из Streptococcus mitis

• Рост S.mitis относительно беден в обычных средах, таких как питательный агар, и поэтому требует добавления некоторых противомикробных препаратов и углеводов, чтобы сделать среду более селективной в отношении организма.
• Среды с добавлением крови, сахарозы и сыворотки демонстрируют более обильный рост.
• Кровяной агар и шоколадный агар обычно используются при идентификации S. mitis для наблюдения за гемолизом.
• Для более селективного выделения можно использовать такие среды, как агар с настоем мозга и сердца и триптиказо-соевый агар/бульон с дефибринированной овечьей кровью.
• Является факультативным анаэробом, поэтому обильный рост наблюдается на воздухе с 5% углекислым газом при 37°С.
• Большинство штаммов не могут расти в присутствии 6,5 % NaCl, тогда как некоторые штаммы могут расти в 4 % NaCl.

1. Питательный агар

• Колонии от белого до серого цвета со средним размером 1 мм в диаметре. Колонии округлые, с приподнятой высотой и сплошным краем.
• Рост в основном плохой и требует воздуха с подачей углекислого газа.

2. Кровяной агар

• На кровяном агаре наблюдаются типичные гладкие, непигментированные, выпуклые колонии со сплошным краем.
• Рост происходит легко на кровяном агаре и проявляет различные типы гемолиза, но в основном α-гемолиз. На кровяном агаре наблюдается около 1-2 мм зоны гемолиза зеленого цвета.
• На шоколадном агаре наблюдается выраженное позеленение.

Биохимические характеристики из Streptococcus mitis

Биохимические характеристики S.ГИТИЛ можно табурировать следующим образом:

Sn
1.	Капсула	Без капсулы
2.	Форма	COCCI
3.	3.	Catalase	отрицательный (-)
4.	4	положительный (+)
5.	цитрат	отрицательный (-)
60160	6.	Метил красный (MR)	положительный (+)
7.	Voges Proskauer (VR)	отрицательный (-)
8.	(окислительно-ферментативные)	факультативные анаэроб
9.	Coagulase	отрицательный (-)
10.	DNASE	отрицательный (-)
11 .	Клубный фактор	отрицательный (-)
Газ	отрицательный (-)
11.	H3O2	положительный (+)
12.	гемолиз	α-Hemolytic
13.	Мотоцитность	Notile	NOTILE
14.	NITRATE Снижение	негативных (-)
Гидролиз желатина	отрицательный (-)
16.	Pigment Production	Переменная
17.	Bile Esculin Test	отрицательный (-)
18.	IG A1 Protease	Plantife (+)
19.	Уреализация	Отрицательный (-)
19.	Lancefield group	Некоторые штаммы реагируют с антисыворотками групп K и O, в то время как другие не поддаются группировке.

Ферментация 4 4 9. 160

С.N		субстрат	Streptococcus Misit
глюкоза	положительный (+)
2.	Fructose	40146	3 .	Mannitol	отрицательный (-)
	положительный (+)
8.	Raffinose	Переменная
Ribosose	Переменная
10.	Sucrose	положительный (+)
11.	RAWLH	негативные (-)
12.	Trehalose	положительный (+)
13.	Xylose	отрицательный (-)
Salicin	VALICIN	Отмен
15.	глицерин	отрицательный (-)
16.	Dulcitol	негативные (- )
17.	Cellobiose	положительный (+)
18.	RHAMNOSE	RAMNOSE	отрицательный (-)
19.	арабиносе	негативные (-)
20.	INULIN	Отрицательный (-)
21.	Sorbitol	Переменная
22.	Pyruvate	отрицательный (-)
23.	гликоген	)

9016 4 4

Sn				97	Streptococcus Misit
1.	Acetoin	Отрицательный (-)
2.	Кислотная фосфатаза	Переменная	Переменная
3.	Alkaline Phosphatase	положительный (+)
4.	Орнитин декарбоксилаза	Не определено
5.	5	Hyalronidase	отрицательный (-)
6.	β-D-глюкозидаза	положительный (+)
7.	Лейцин аминопептидазы	положительный (+)
80160	80160	40160	положительный (+)

факторы вирулентности из Streptococcus Misit

• S. Mitise обычно считается относительно доброкачественным оральным стрептококком и членом комменсальной флоры полости рта.
• Тем не менее, S. mitis вызывает ряд инвазивных заболеваний у людей, а в последнее время стал причиной инфекций кровотока у пациентов с ослабленным иммунитетом и у пациентов, проходящих цитотоксическую противораковую химиотерапию.
• S. mitis считается ведущей причиной инфекционного эндокардита и бактериемии среди пероральных стрептококков
• Было проведено очень мало исследований роли факторов вирулентности S. mitis , поэтому информация о Факторы вирулентности стрептококков и их роль в патогенезе заболевания.
• Некоторые из известных и изученных факторов вирулентности S. mitis , участвующих в патогенезе заболеваний:

1.Фаговые белки

• Связывание S. mitis с тромбоцитами человека способствует патогенезу S. mitis инфекционного эндокардита.
• Связывание тромбоцитов S. mitis частично опосредовано двумя белками, кодируемыми бактериофагами , PblA и PblB.
• Как PblA, так и PblB, продуцируемые бактериофагом, опосредуют присоединение бактериофага к остаткам холина, присутствующим на клеточных стенках жизнеспособных бактерий, где они затем обеспечивают связывание жизнеспособных бактерий с тромбоцитами хозяина.
• Сиаловая кислота ганглиозида мембран тромбоцитов является рецептором-мишенью для кодируемых фагом белков PblA и PblB.
• Другие факторы вирулентности, помимо PblA и PblA, которые опосредуют связывание бактерий с тромбоцитами, еще полностью не изучены.

 2. Протеаза иммуноглобулина А1

• Streptococcus mitis может продуцировать протеазу IgA1, которая гомологична протеазе IgA1 S. oralis .
• Эти протеазы представляют собой закрепленные на клеточной стенке металлопротеазы цинка, которые расщепляют пептидные связи в IgA1.
• Это протеолитическое расщепление IgA1 протеазой приводит к образованию фрагментов Fab и Fc, которые могут отделить распознавание антигенов S. mitis от механизмов их элиминации.
• В дополнение к этому оставшиеся Fab-фрагменты, связанные с бактериями, могут маскировать эпитопы от иммунной системы и предотвращать связывание других изотипов антител, активацию комплемента и опосредованный комплементом лизис.

3. Поверхностные белки, ассоциированные со стенкой

• Существует около 18 предполагаемых поверхностных белков, ассоциированных с клеточной стенкой, несущих мотив прикрепления к клеточной стенке LPXTG, закодированный в геноме S. mitis .
• Некоторые из этих белков включают белок NanA2, который связывается с сиаловой кислотой тромбоцитов, и MonX, связывающий тромбоциты.
• Эти белки участвуют в колонизации поверхностей хозяина и патогенезе заболевания.

4. Цитолизин

• Streptococcus mitis не продуцирует широкий спектр токсинов, но было показано, что он кодирует и продуцирует токсин, структурно и функционально сходный с S. pneumoniae pneumolysin и интермедилизин S. intermedius .
• Специфический токсин S. mitis , названный митилизином, функционально сходен с пневмолизином в гемолитических анализах и перекрестно реагирует с антителами к пневмолизину.
• Однако этот цитотоксин был идентифицирован только в нескольких штаммах S. mitis, , и исследования, связанные с его ролью в патогенезе инфекций, еще не проводились.

Патогенез из Streptococcus mitis

Streptococcus mitis является одним из первых и численно значимых колонизаторов ротоглотки человека в неонатальном периоде. Однако он также считается одним из важных патогенных агентов среди виридиановых стрептококков, вызывающих такие инфекции, как менингит и инфекционный эндокардит.Различные факторы вирулентности, экспрессируемые организмом, способствуют процессу патогенеза.

1. Передача

• S. mitis является частью нормальной флоры человека, но его происхождение еще предстоит определить.
• Однако было известно, что комменсальные бактерии переносятся из внешней среды, основного опекуна и из других областей дыхательных путей после рождения.
• Однако в случае инфекции бактерии могут попасть в стерильные части тела, такие как мозг и сердце, через кровь.

2. Адгезия/прикрепление/колонизация

• Успешная колонизация ротоглотки зависит от ряда различных факторов.
• Первоначально S. mitis экспрессирует несколько адгезинов, которые способствуют первичному прикреплению к тканям хозяина.
• Наиболее важными белками, участвующими в связывании организма с клеточной поверхностью, являются ассоциированные со стенкой адгезины или белки, которые связываются с различными типами клеток.
• Белки, подобные NanA2, участвуют в связывании бактерии с остатками сиаловой кислоты эпителиальной клетки.
• Анализ последовательности его генома подтвердил, что S. mitis кодирует многочисленные заякоренные в клеточной стенке и связывающие холин белки, которые являются эффективными адгезинами, помогающими прикрепляться и колонизироваться.

3. Инвазия

• Некоторые вирулентные штаммы S. mitis продуцируют цитотоксин, митилизин, который лизирует эпителиальные клетки и проникает в кровеносную систему хозяина.
• В крови фаговые белки PblA и PblB в значительной степени способствуют прикреплению S.mitis к тромбоцитам.
• С помощью тромбоцитов S. mitis достигает различных частей тела, где вызывает различные заболевания.

4. Взаимодействие с иммунной системой

• После первичного прикрепления S. mitis использует несколько стратегий, чтобы уйти от врожденной и приобретенной иммунной системы хозяина.
• Слюна в ротовой полости содержит секреторные антитела иммуноглобулина А (IgA), которые реагируют с S.митис . Однако эти антитела не полностью блокируют прилипание и последующую колонизацию.
• S. mitis может продуцировать протеазу IgA1, которая расщепляет пептидные связи в IgA1, разделяя области Fab и Fc.
• Предотвращает связывание антител и другие механизмы иммунной системы.
• Кроме того, разрушение тканей, связанное с заболеванием, вызванным S. mitis , в основном опосредовано воспалительной реакцией хозяина на инфицирование бактериями.
• S. mitis также может модифицировать экспрессию провоспалительного хемокина интерлейкина-8, что приводит к разрушению тканей и возникновению заболеваний.

Клинические проявления из Streptococcus mitis

• У большинства людей S. mitis не представляет значительной иммунологической угрозы ротовой полости, что не представляет значительной угрозы со стороны комменсальных бактерий.
• Однако С.mitis стал важным возбудителем у пожилых пациентов, пациентов с ослабленным иммунитетом и у пациентов, проходящих цитотоксическую химиотерапию по поводу рака.
• Streptococcus mitis также является нечастым условно-патогенным микроорганизмом у нормальных здоровых младенцев и взрослых, который, как известно, вызывает широкий спектр заболеваний от кариеса зубов до бактериального инфекционного эндокардита, бактериемии, менингита, глазных инфекций и пневмонии.
• Кроме того, S. mitis также считается этиологическим агентом различных инфекций мочевыводящих путей.
• S. mitis также редко связан с септическим артритом, который, если его не диагностировать, может привести к повышенному риску необратимого повреждения костей или септицемии.

Лабораторная диагностика из Streptococcus mitis

Диагностика S. mitis по клиническим образцам в первую очередь связана с идентификацией микроорганизма из этих образцов. В зависимости от места заражения для диагностики берут разные образцы.При инфекциях полости рта собирают мазки и зубные отложения, тогда как при инфекциях мочевыводящих путей собирают мочу.

Ниже приведены различные типы диагностических методов, которые можно использовать для правильного выделения и идентификации S. mitis :

1. Морфологические, культуральные и биохимические характеристики

• Оральные стрептококки часто можно селективные среды, в которых морфология колоний обеспечивает первичную основу для идентификации организма.
• Появление типичных гладких, непигментированных, выпуклых колоний со сплошным краем на кровяном агаре с α-гемолизом указывает на присутствие S. mitis .
• После выделения проводят микроскопическое исследование организма на предмет морфологии и расположения клеток.
• Появление грамположительных, неподвижных, не образующих спор кокков парами или короткими цепочками служит дополнительным основанием для присутствия S. mitis.
• Затем проводятся биохимические тесты для определения вида и подтверждения наличия микроорганизма.
• Группировка антигенов Lancefield также может быть выполнена, поскольку некоторые штаммы S. mitis реагируют на антисыворотки K и O, в то время как другие не поддаются группировке.

2. Экспресс-диагностика

• Помимо традиционных методов видовой идентификации, теперь также доступны коммерческие наборы для экспресс-идентификации Streptococcus .
• Коммерческие наборы, такие как Rapid Strep 32, можно использовать для идентификации видов Streptococcus .
• В случае S. mitis идентификация основана на анализе состава их микробных клеток жирных кислот.

3. Молекулярная диагностика

• Определение последовательности 16S рРНК является наиболее важным молекулярным методом для подтверждения S. mitis .
• Кроме того, для более точного подтверждения и диагностики можно проводить такие тесты, как ПЦР и секвенирование ДНК.
• В некоторой степени идентификация также может быть достигнута с помощью ДНК-зондов, которые гибридизуются исключительно с отдельными видами.

Лечение из Streptococcus mitis инфекции

• Поскольку инфекции, вызванные S. mitis , в основном легкие (за исключением инфекционного эндокардита), лечение заболевания в основном несложно.
• Большинство штаммов S. mitis чувствительны к различным группам антибиотиков, однако в последнее время наблюдаются случаи устойчивости к пенициллину, эритромицину и, реже, к клиндамицину.
• Основное лечение антибиотиками пожилых пациентов (старше 50 лет) при менингите, вызванном S.mitis представляет собой цефтриаксон 4 г/сут и ампициллин 12 г/сут.
• В случае инфекций, связанных с медицинским устройством, таких как эндокардит, может потребоваться удаление или замена устройства.

Ссылки

1. Topley WWC (2007). «Микробиология и микробные взаимодействия» Топли и Уайсона; Бактериология, 2 Том. Десятое издание. John Wiley and Sons Ltd.
2. Bergey, DH, Whitman, WB, De, VP, Garrity, GM, & Jones, D. (2009). Руководство Берджи по систематической бактериологии: Vol.3 . Нью-Йорк: Спрингер.
3. Streptococcus mitis   (ATCC® 49456™).
4. Mitchell J. Streptococcus mitis: баланс между комменсализмом и патогенезом. Мол Оральный микробиол. 2011 апр; 26(2):89-98. doi: 10.1111/j.2041-1014.2010.00601.x. Epub 2011, 18 января. PMID: 21375700.
5. Эндрю Смит, Маргарет С. Джексон и Хелен Кеннеди (2004) Антимикробная чувствительность стрептококковых изолятов группы viridans к восьми противомикробным агентам, Scandinavian Journal of Infectious Diseases, 36:4, 259–263 , ДОИ: 10. 1080/00365540410019435
6. Расмуссен, Луиза и Хойхолт, Катрин и Даргис, Римтас и Кристенсен, Йенс Йорген и Сковгаард, Оле и Юстесен, Ульрик и Розенвинге, Флемминг и Мозер, Клаус и Лукьянченко, Оксана и Расмуссен, Симоно и Нильсен, Ся. (2017). In silico оценка факторов вирулентности штаммов Streptococcus oralis и Streptococcus mitis, выделенных от пациентов с инфекционным эндокардитом. Журнал медицинской микробиологии. 66. 10.1099/мм.0,000573.
7. Хохви, Дж., Рейнхольд, Дж., и Килиан, М. (2001). Динамика популяций Streptococcus mitis в естественной среде обитания. Инфекция и иммунитет , 69 (10), 6055–6063. https://doi.org/10.1128/IAI.69.10.6055-6063.2001
8. Selda Sayin Kutlu, Suzan Sacar, Nural Cevahir, Huseyin Turgut, Внебольничный менингит Streptococcus mitis: отчет о случае, Международный журнал инфекционных заболеваний, том 12, выпуск 6, 2008 г., страницы e107-e109, ISSN 1201-9712, https://doi.org/10.1016/j.ijid.2008.01.003.
9. Фатма Аль-Фарси, Ибрагим Аль-Бусаиди, Халфан Аль-Зиди, «Острый Streptococcus mitis Сакроилеит у подростка с неясным источником бактериемии: история болезни и обзор литературы», Отчеты о случаях инфекционных заболеваний , том .